| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第一部分 前言 | 第10-33页 |
| 1 线粒体研究进展 | 第10-15页 |
| ·线粒体的起源、进化与功能 | 第10-12页 |
| ·线粒体的研究进展与研究热点 | 第12-13页 |
| ·线粒体的分离与纯化 | 第13-15页 |
| 2 线粒体蛋白质组 | 第15-23页 |
| ·蛋白质组研究概述 | 第15-16页 |
| ·蛋白质组实验技术 | 第16-20页 |
| ·线粒体蛋白质组研究进展 | 第20-22页 |
| ·线粒体蛋白质组数据库 | 第22-23页 |
| 3 线粒体转录组 | 第23-31页 |
| ·转录组研究及其技术发展概述 | 第23-26页 |
| ·线粒体转录组(Mitoscriptome)研究进展 | 第26-27页 |
| ·线粒体转录图谱的构建及数据分析 | 第27-29页 |
| ·转录组与蛋白质组相关性 | 第29-31页 |
| 4 日本三角涡虫研究概述 | 第31-32页 |
| 5 本研究的目的和意义 | 第32-33页 |
| 第二部分 材料与方法 | 第33-50页 |
| 1 实验材料 | 第33-39页 |
| ·标本的采集与饲养 | 第33页 |
| ·实验仪器和试剂 | 第33-39页 |
| 2 实验方法 | 第39-46页 |
| ·线粒体纯化 | 第39页 |
| ·透射电镜检测线粒体完整性 | 第39-40页 |
| ·Weatern-Blot检测线粒体纯度 | 第40-42页 |
| ·2-DE分析线粒体蛋白质组 | 第42-43页 |
| ·Shotgun测定线粒体蛋白质组 | 第43-44页 |
| ·线粒体总RNA提取 | 第44-45页 |
| ·Solexa测序测定线粒体转录组 | 第45-46页 |
| 3 实验数据处理和分析 | 第46-50页 |
| ·线粒体蛋白质组2-DE图谱在线分析 | 第46页 |
| ·线粒体蛋白质组Shotgun数据注释与分析 | 第46-47页 |
| ·Solexa测序结果的采集与保存 | 第47-49页 |
| ·线粒体蛋白质组与转录组相关性分析 | 第49-50页 |
| 第三部分 结果分析与讨论 | 第50-82页 |
| 1 实验结果 | 第50-56页 |
| ·线粒体提取与纯度检测 | 第50-54页 |
| ·日本三角涡虫2-DE电泳图谱 | 第54-56页 |
| 2 日本三角涡虫线粒体蛋白质组分析 | 第56-63页 |
| ·2-DE电泳图谱在线分析 | 第56-57页 |
| ·线粒体蛋白质组Shotgun结果 | 第57-58页 |
| ·线粒体蛋白质组理化性质简况 | 第58-59页 |
| ·线粒体蛋白质功能分类的GO注释 | 第59-63页 |
| 3 线粒体转录组Solexa结果分析 | 第63-79页 |
| ·线粒体总RNA质量检测 | 第63-65页 |
| ·测序产量统计 | 第65-66页 |
| ·序列拼接 | 第66-68页 |
| ·线粒体转录组Gene Ontology注释 | 第68-72页 |
| ·KEGG Pathway通路分析 | 第72-73页 |
| ·线粒体转录组unigene中转录因子的识别 | 第73-74页 |
| ·转录组到基因组的转录本作图 | 第74-79页 |
| 4 日本三角涡虫线粒体蛋白质组与转录组相关性比较分析 | 第79-82页 |
| 第四部分 结论 | 第82-84页 |
| 参考文献 | 第84-106页 |
| 附录 | 第106-134页 |
| 致谢 | 第134-136页 |
| 攻读博士学位期间科研成果 | 第136页 |