| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-41页 |
| 1 引言 | 第10页 |
| 2 QTL定位原理与方法 | 第10-24页 |
| ·试验设计 | 第11-15页 |
| ·半同胞设计 | 第13页 |
| ·孙女设计 | 第13-14页 |
| ·全同胞设计 | 第14页 |
| ·一般(实验或商业)系谱 | 第14-15页 |
| ·遗传标记及连锁图谱 | 第15-18页 |
| ·QTL定位方法 | 第18-21页 |
| ·候选基因法 | 第18-19页 |
| ·连锁分析法 | 第19-21页 |
| ·定位统计方法 | 第21-24页 |
| 3 QTL精细定位 | 第24-37页 |
| ·定义和度量连锁不平衡 | 第24-26页 |
| ·连锁不平衡的原因与程度 | 第26-27页 |
| ·连锁不平衡分析 | 第27-34页 |
| ·单标记关联分析 | 第27-28页 |
| ·单倍型关联分析 | 第28-29页 |
| ·基于IBD的LD定位(LDLA) | 第29-34页 |
| ·影响定位精度的因素 | 第34-37页 |
| ·标记密度 | 第34-35页 |
| ·当前重组 | 第35页 |
| ·历史重组 | 第35-36页 |
| ·增加数量座位检测 | 第36-37页 |
| 4 奶牛泌乳性状QTL研究 | 第37-40页 |
| ·全基因组上泌乳性状QTL的定位情况 | 第37-38页 |
| ·BTA6上泌乳性状QTL与QTN | 第38-40页 |
| 5 本研究目的与意义 | 第40-41页 |
| 第二章 运用LDLA法精细定位中国荷斯坦奶牛6号染色体上泌乳性状QTL | 第41-65页 |
| 1 试验材料 | 第41-44页 |
| ·群体与表型 | 第41-42页 |
| ·标记与图谱 | 第42-44页 |
| ·标记群体遗传学分析 | 第42-43页 |
| ·标记图谱 | 第43-44页 |
| 2 精细定位方法 | 第44-53页 |
| ·统计分析 | 第44-47页 |
| ·构建G阵 | 第47-53页 |
| ·计算块[a]中IBD | 第47-50页 |
| ·计算块[b]中IBD | 第50-53页 |
| 3 结果与分析 | 第53-60页 |
| ·微卫星群体遗传参数评估 | 第53-54页 |
| ·连锁不平衡图谱 | 第54-55页 |
| ·三个性状育种值统计 | 第55-56页 |
| ·QTL精细定位 | 第56-60页 |
| ·单倍型推断结果 | 第56-58页 |
| ·定位结果 | 第58-60页 |
| 4 讨论与结论 | 第60-65页 |
| 第三章 应用WinQTLcart分析中国荷斯坦奶牛BTA6泌乳性状QTL | 第65-78页 |
| 1 模型与方法 | 第65-70页 |
| ·推断单倍型 | 第65-67页 |
| ·半同胞家系内多重区间定位 | 第67-69页 |
| ·权重的多重区间定位(wMIM) | 第67页 |
| ·最大似然分析 | 第67-68页 |
| ·假设检验 | 第68页 |
| ·计算R~2 | 第68-69页 |
| ·多家系的混合模型估计QTL | 第69-70页 |
| ·模型 | 第69-70页 |
| ·假设检验 | 第70页 |
| ·计算R~2 | 第70页 |
| 2 实验材料 | 第70-72页 |
| 3 结果与分析 | 第72-76页 |
| ·家系内分析结果 | 第72-76页 |
| ·多家系间分析结果 | 第76页 |
| 4 讨论 | 第76-78页 |
| 第四章 总结 | 第78-80页 |
| 参考文献 | 第80-89页 |
| 致谢 | 第89-90页 |
| 个人简历 | 第90页 |