摘要 | 第5-7页 |
Abstract | 第7-8页 |
缩略短语 | 第9-15页 |
第一章 绪论 | 第15-32页 |
1.1 结核病概述 | 第15页 |
1.2 吡嗪酰胺与吡嗪酸 | 第15-17页 |
1.3 核糖体蛋白MtRpsA | 第17-23页 |
1.3.1 MtRpsA的功能 | 第17-20页 |
1.3.2 MtRpsA的同源蛋白 | 第20-21页 |
1.3.3 MtRpsA~(CTD)的晶体结构 | 第21-22页 |
1.3.4 POA抑制反式翻译的结构基础 | 第22-23页 |
1.4 生物大分子的核磁共振技术 | 第23-31页 |
1.4.1 NMR技术解析蛋白质的三维溶液结构 | 第24-26页 |
1.4.2 蛋白质动力学实验 | 第26-30页 |
1.4.3 NMR技术研究蛋白质-药物的相互作用 | 第30-31页 |
1.5 本课题研究目的及意义 | 第31-32页 |
第二章 材料与方法 | 第32-55页 |
2.1 实验材料 | 第32-38页 |
2.1.1 菌株与载体 | 第32-33页 |
2.1.2 主要试剂与耗材 | 第33-34页 |
2.1.3 主要仪器 | 第34-35页 |
2.1.4 常用试剂的配制 | 第35-38页 |
2.2 实验方法 | 第38-55页 |
2.2.1 MtRpsA~(CTD)_280-438重组质粒的构建 | 第38-42页 |
2.2.2 目的蛋白的表达纯化 | 第42-45页 |
2.2.3 蛋白质的检测与定量 | 第45-46页 |
2.2.4 MtRpsA最佳缓冲液条件的筛选 | 第46-47页 |
2.2.5 同位素标记MtRpsA样品的制备 | 第47-48页 |
2.2.6 NMR谱图的采集与处理 | 第48-49页 |
2.2.7 主链归属 | 第49-50页 |
2.2.8 侧链和NOE信号归属 | 第50-51页 |
2.2.9 二级结构预测 | 第51-52页 |
2.2.10 蛋白质溶液结构计算与优化处理 | 第52-53页 |
2.2.11 蛋白质主链动力学驰豫实验 | 第53-54页 |
2.2.12 化学位移扰动法研究MtRpsA蛋白与底物的相互作用 | 第54-55页 |
第三章 MtRpsA结构生物学和动力学研究 | 第55-74页 |
3.1 目的基因的克隆和表达载体的构建 | 第55页 |
3.2 目的蛋白的表达与纯化 | 第55-58页 |
3.2.1 目的蛋白的小量表达 | 第55-56页 |
3.2.2 目的蛋白的大量表达与纯化 | 第56-58页 |
3.3 目的蛋白的稳定性和聚集状态分析 | 第58-60页 |
3.4 目的蛋白的CD谱分析 | 第60-61页 |
3.5 目的蛋白的~1H-NMR谱 | 第61-62页 |
3.6 目的蛋白的2D~1H-~(15)N HSQC谱 | 第62-63页 |
3.7 NMR信号的指认 | 第63-66页 |
3.7.1 主链原子化学位移指认 | 第63-65页 |
3.7.2 侧链原子化学位移指认 | 第65-66页 |
3.8 NOE信号指认与溶液结构计算及优化 | 第66-70页 |
3.8.1 NOE信号指认 | 第66页 |
3.8.2 二级结构预测 | 第66-68页 |
3.8.3 三维溶液结构计算及优化 | 第68页 |
3.8.4 RpsA不同片段的比较 | 第68-70页 |
3.9 MtRpsA~(CTD)_280-438主链动力学分析 | 第70-74页 |
3.9.1 驰豫速率R_1、R_2和异核稳态{~1H}-~(15)N NOE | 第70-72页 |
3.9.2 约化谱密度函数分析 | 第72-74页 |
第四章 MtRpsA~(CTD)蛋白与药物的相互作用 | 第74-79页 |
4.1 MtRpsA~(CTD)蛋白与POA的相互作用 | 第74-76页 |
4.2 MtRpsA~(CTD)蛋白与药物设计的药物的相互作用 | 第76-79页 |
第五章 结论与展望 | 第79-81页 |
参考文献 | 第81-85页 |
附录1 | 第85-101页 |
附录2 | 第101-105页 |
攻读硕士学位期间发表论文 | 第105-106页 |
致谢 | 第106页 |