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结核分枝杆菌新药靶RpsA的溶液结构动力学和功能的研究

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
缩略短语第9-15页
第一章 绪论第15-32页
    1.1 结核病概述第15页
    1.2 吡嗪酰胺与吡嗪酸第15-17页
    1.3 核糖体蛋白MtRpsA第17-23页
        1.3.1 MtRpsA的功能第17-20页
        1.3.2 MtRpsA的同源蛋白第20-21页
        1.3.3 MtRpsA~(CTD)的晶体结构第21-22页
        1.3.4 POA抑制反式翻译的结构基础第22-23页
    1.4 生物大分子的核磁共振技术第23-31页
        1.4.1 NMR技术解析蛋白质的三维溶液结构第24-26页
        1.4.2 蛋白质动力学实验第26-30页
        1.4.3 NMR技术研究蛋白质-药物的相互作用第30-31页
    1.5 本课题研究目的及意义第31-32页
第二章 材料与方法第32-55页
    2.1 实验材料第32-38页
        2.1.1 菌株与载体第32-33页
        2.1.2 主要试剂与耗材第33-34页
        2.1.3 主要仪器第34-35页
        2.1.4 常用试剂的配制第35-38页
    2.2 实验方法第38-55页
        2.2.1 MtRpsA~(CTD)_280-438重组质粒的构建第38-42页
        2.2.2 目的蛋白的表达纯化第42-45页
        2.2.3 蛋白质的检测与定量第45-46页
        2.2.4 MtRpsA最佳缓冲液条件的筛选第46-47页
        2.2.5 同位素标记MtRpsA样品的制备第47-48页
        2.2.6 NMR谱图的采集与处理第48-49页
        2.2.7 主链归属第49-50页
        2.2.8 侧链和NOE信号归属第50-51页
        2.2.9 二级结构预测第51-52页
        2.2.10 蛋白质溶液结构计算与优化处理第52-53页
        2.2.11 蛋白质主链动力学驰豫实验第53-54页
        2.2.12 化学位移扰动法研究MtRpsA蛋白与底物的相互作用第54-55页
第三章 MtRpsA结构生物学和动力学研究第55-74页
    3.1 目的基因的克隆和表达载体的构建第55页
    3.2 目的蛋白的表达与纯化第55-58页
        3.2.1 目的蛋白的小量表达第55-56页
        3.2.2 目的蛋白的大量表达与纯化第56-58页
    3.3 目的蛋白的稳定性和聚集状态分析第58-60页
    3.4 目的蛋白的CD谱分析第60-61页
    3.5 目的蛋白的~1H-NMR谱第61-62页
    3.6 目的蛋白的2D~1H-~(15)N HSQC谱第62-63页
    3.7 NMR信号的指认第63-66页
        3.7.1 主链原子化学位移指认第63-65页
        3.7.2 侧链原子化学位移指认第65-66页
    3.8 NOE信号指认与溶液结构计算及优化第66-70页
        3.8.1 NOE信号指认第66页
        3.8.2 二级结构预测第66-68页
        3.8.3 三维溶液结构计算及优化第68页
        3.8.4 RpsA不同片段的比较第68-70页
    3.9 MtRpsA~(CTD)_280-438主链动力学分析第70-74页
        3.9.1 驰豫速率R_1、R_2和异核稳态{~1H}-~(15)N NOE第70-72页
        3.9.2 约化谱密度函数分析第72-74页
第四章 MtRpsA~(CTD)蛋白与药物的相互作用第74-79页
    4.1 MtRpsA~(CTD)蛋白与POA的相互作用第74-76页
    4.2 MtRpsA~(CTD)蛋白与药物设计的药物的相互作用第76-79页
第五章 结论与展望第79-81页
参考文献第81-85页
附录1第85-101页
附录2第101-105页
攻读硕士学位期间发表论文第105-106页
致谢第106页

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