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蛋白质结构折叠分析与速率预测

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
1 绪论第9-22页
    1.1 课题研究的背景及意义第9-10页
    1.2 研究现状第10-11页
    1.3 蛋白质基本介绍第11-19页
        1.3.1 蛋白质的组成第11-13页
        1.3.2 蛋白质的结构层次第13-15页
        1.3.3 维持和稳定蛋白质结构的因素第15-19页
    1.4 蛋白质折叠的研究方法第19-20页
        1.4.1 体内研究第19页
        1.4.2 体外研究第19页
        1.4.3 计算机模拟第19-20页
    1.5 论文组织结构及研究内容第20-22页
2 荧光光谱法在研究蛋白质折叠中的应用第22-31页
    2.1 引言第22页
    2.2 蛋白质的实验研究方法第22-23页
        2.2.1 测定晶体中的蛋白质分子第23页
        2.2.2 测定溶液中的蛋白质分子第23页
    2.3 蛋白质的荧光光谱技术第23-28页
        2.3.1 荧光光谱技术第24-26页
        2.3.2 蛋白质荧光光谱法第26-28页
    2.4 荧光光谱法研究蛋白质应用分析第28-29页
        2.4.1 测定蛋白质分子的构象第28页
        2.4.2 测定蛋白质分子的含量第28-29页
        2.4.3 测定蛋白质分子的性质第29页
    2.5 本章小结第29-31页
3 氨基酸疏水性对蛋白质折叠的影响分析第31-47页
    3.1 引言第31页
    3.2 研究背景及方法第31-39页
        3.2.1 折叠漏斗模型第31-34页
        3.2.2 蛋白质的结构预测第34-35页
        3.2.3 模型简化第35-36页
        3.2.4 搜索算法第36-39页
    3.3 材料与方法第39-42页
        3.3.1 数据集第39-40页
        3.3.2 模型与算法第40-42页
    3.4 模拟结果及分析第42-46页
        3.4.1 分段讨论第43页
        3.4.2 整体讨论第43-46页
    3.5 本章小结第46-47页
4 氨基酸序列预测蛋白质折叠速率第47-59页
    4.1 引言第47页
    4.2 研究背景及方法第47-49页
        4.2.1 蛋白质结构类第47-48页
        4.2.2 基于一级序列预测蛋白质折叠速率的方法第48-49页
    4.3 材料与方法第49-52页
        4.3.1 数据集第49页
        4.3.2 数据分析方法第49-52页
    4.4 结果与讨论第52-57页
        4.4.1 氨基酸总亲疏水P_(HP)预测蛋白折叠速率第52页
        4.4.2 每种氨基酸的亲疏水值之和P_i预测蛋白折叠速率第52-57页
    4.5 本章小结第57-59页
5 残基接触数对蛋白质折叠速率预测的影响分析第59-71页
    5.1 引言第59页
    5.2 基于蛋白质的三级结构预测折叠速率的研究方法第59-60页
    5.3 材料与方法第60-63页
        5.3.1 数据集第60页
        5.3.2 数据分析方法第60-63页
    5.4 结果与讨论第63-70页
        5.4.1 各特征原子接触数预测蛋白折叠速率第63-64页
        5.4.2 各结构类蛋白接触数的折叠速率预测第64-70页
    5.5 本章小结第70-71页
6 结论第71-73页
    6.1 创新点及主要结论第71-72页
        6.1.1 2D HP模型第71页
        6.1.2 一级序列预测蛋白质折叠速率第71页
        6.1.3 三级结构预测蛋白质折叠速率第71-72页
    6.2 对今后工作的展望第72-73页
        6.2.1 2D HP模型第72页
        6.2.2 一级序列预测蛋白质折叠速率第72-73页
参考文献第73-77页
攻读硕士学位期间发表的论文第77-78页
致谢第78-81页
附录第81-90页

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