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青海农用沼气池发酵微生物群落结构与功能研究

摘要第6-8页
Abstract第8-10页
第一章 绪论第14-39页
    1.1 我国农用沼气池的发展现状第14页
    1.2 青海农用沼气池发展现状与存在问题第14-19页
        1.2.1 发展现状与利用效率第14-18页
        1.2.2 存在问题第18-19页
    1.3 沼气发酵第19-36页
        1.3.1 沼气发酵原理第19-25页
        1.3.2 沼气发酵微生物第25-32页
        1.3.3 温度对沼气发酵的影响第32-36页
    1.4 沼气发酵微生物群落与功能的研究方法第36-38页
        1.4.1 DGGE技术第36页
        1.4.2 16S rRNA基因高通量测序技术第36-37页
        1.4.3 宏基因组与微生物功能第37-38页
    1.5 课题研究意义第38-39页
第二章 青海不同地区农用沼气池微生物群落结构研究第39-64页
    2.1 引言第39页
    2.2 实验材料与方法第39-42页
        2.2.1 污泥样品采集第39页
        2.2.2 菌株和质粒第39页
        2.2.3 工具酶与其它试剂第39-40页
        2.2.4 培养基第40页
        2.2.5 常用缓冲液第40页
        2.2.6 引物与测序第40页
        2.2.7 污泥样品理化特征的测定第40-41页
        2.2.8 污泥基因组DNA提取和检测第41页
        2.2.9 16S rRNA基因的PCR扩增第41页
        2.2.10 DGGE分析体系建立与数据分析第41-42页
        2.2.11 DGGE条带测序与系统发育分析第42页
        2.2.12 微生物群落与环境因子相关性分析第42页
    2.3 结果与分析第42-61页
        2.3.1 青海不同地区农用沼气池及样品特征描述第42-44页
        2.3.2 农用沼气池16S rDNA的PCR扩增第44-45页
        2.3.3 DGGE图谱及多样性分析第45-48页
        2.3.4 不同泥样微生物群落的相似性分析第48-49页
        2.3.5 不同地区沼气池微生物群落结构组成第49-59页
        2.3.6 微生物群落与环境因子相关分析第59-61页
    2.4 讨论第61-64页
        2.4.1 不同地区农用沼气池微生物群落结构研究第61-62页
        2.4.2 沼气微生物群落与环境因子相关性分析第62-64页
第三章 温度对沼气池发酵微生物群落结构影响的研究第64-93页
    3.1 引言第64页
    3.2 实验材料与方法第64-66页
        3.2.1 污泥样品来源与采集第64-65页
        3.2.2 工具酶与其它试剂第65页
        3.2.3 常用缓冲液第65页
        3.2.4 引物与测序第65页
        3.2.5 农用沼气池温度的测定与统计第65页
        3.2.6 PCR-DGGE研究微生物多样性第65页
        3.2.7 污泥基因组DNA的提取和检测第65-66页
        3.2.8 高通量测序及优化第66页
        3.2.9 物种分类和多样性分析第66页
        3.2.10 相似性聚类分析第66页
    3.3 结果与分析第66-88页
        3.3.1 全年沼气池内外温度的动态变化分析第66-71页
        3.3.2 PCR-DGGE分析微生物多样性的动态变化第71-77页
        3.3.3 高通量测序统计分析第77-78页
        3.3.4 微生物丰富度及多样性第78-80页
        3.3.5 细菌群落组成和结构第80-84页
        3.3.6 古菌群落组成和结构第84-88页
    3.4 讨论第88-93页
        3.4.1 沼气池发酵温度与产气密切相关第88页
        3.4.2 高通量测序和DGGE分析青海农用沼气池发酵微生物群落的技术评价第88-90页
        3.4.3 温度对青海农用沼气池发酵微生物群落结构的影响第90-93页
第四章 青海农用沼气池发酵微生物功能及代谢研究第93-117页
    4.1 引言第93页
    4.2 实验材料与方法第93-95页
        4.2.1 样品来源与采集第93页
        4.2.2 试剂第93-94页
        4.2.3 污泥样品宏基因组DNA的提取和检测第94页
        4.2.4 宏基因组测序及数据分析流程第94-95页
    4.3 结果与分析第95-114页
        4.3.1 宏基因组数据分析与基因预测第95-96页
        4.3.2 物种注释与功能注释第96-99页
        4.3.3 微生物群落代谢途径的差异性分析第99-102页
        4.3.4 温度变化与微生物群落碳代谢关系解析第102-107页
        4.3.5 温度变化与微生物群落氮代谢关系解析第107-111页
        4.3.6 温度变化与微生物群落硫代谢关系解析第111-112页
        4.3.7 温度变化与微生物群落甲烷代谢关系解析第112-114页
    4.4 讨论第114-117页
第五章 结论与展望第117-120页
    5.1 结论第117-118页
    5.2 创新点第118页
    5.3 展望第118-120页
参考文献第120-134页
附录第134-142页
攻读学位期间发表的学术论文第142-143页
致谢第143页

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