摘要 | 第4-7页 |
Abstract | 第7-10页 |
目录 | 第11-17页 |
图和附表清单 | 第17-21页 |
符号说明 | 第21-24页 |
1 前言 | 第24-52页 |
1.1 什么是表观遗传学? | 第24页 |
1.2 染色质的结构 | 第24-25页 |
1.3 DNA 的甲基化 | 第25-27页 |
1.4 组蛋白的修饰 | 第27-29页 |
1.4.1 组蛋白的乙酰化 | 第27页 |
1.4.2 组蛋白精氨酸的甲基化 | 第27-28页 |
1.4.3 组蛋白赖氨酸的甲基化 | 第28-29页 |
1.5 含有 JmjC 结构域的去甲基化酶 | 第29-33页 |
1.5.1 JmjC 家族成员与肿瘤关系 | 第29-30页 |
1.5.2 JmjC 家族组蛋白去甲基化酶抑制剂 | 第30-33页 |
1.6 组蛋白赖氨酸特异性去甲基化酶(1Histone lysine specific demethylase 1,LSD1) | 第33-40页 |
1.6.1 LSD1 的结构和功能 | 第33-34页 |
1.6.2 LSD1 去甲基化的机制 | 第34-35页 |
1.6.3 LSD1 在肿瘤中的功能和作用 | 第35-36页 |
1.6.4 LSD1 抑制剂 | 第36-40页 |
1.7 点击化学在表观遗传学靶点药物设计中的应用 | 第40-41页 |
1.8 转化生长因子 TGF β1、上皮细胞-间质细胞转换与表观遗传学修饰蛋白 | 第41-43页 |
1.8.1 什么是转化生长因子 TGF β1 | 第41页 |
1.8.2 上皮细胞-间质细胞转换(EMT) | 第41-42页 |
1.8.3 TGF β与 EMT | 第42-43页 |
1.8.4 EMT 与组蛋白表观遗传学修饰 | 第43页 |
1.8.5 TGF β诱导 EMT 过程中的表观遗传学修饰 | 第43页 |
1.9 NF-κB 信号通路 | 第43-44页 |
1.10 本论文的主要研究目的和内容 | 第44页 |
参考文献 | 第44-52页 |
2 LSD1、LSD2 抑制剂筛选平台的建立及 LSD1 抑制剂的设计和合成 | 第52-110页 |
引言 | 第52页 |
2.1 LSD1 的原核表达和纯化 | 第52-66页 |
2.1.1 实验材料 | 第52-57页 |
2.1.2 实验方法 | 第57-64页 |
2.1.3 实验结果 | 第64-66页 |
2.2 LSD2 的原核表达和纯化 | 第66-68页 |
2.2.1 实验材料 | 第66-67页 |
2.2.2 实验方法 | 第67页 |
2.2.3 实验结果 | 第67-68页 |
2.3 基于荧光的 LSD1 抑制剂筛选模型的建立 | 第68-73页 |
2.3.1 实验原理 | 第68页 |
2.3.2 实验材料 | 第68-69页 |
2.3.3 实验方法 | 第69-71页 |
2.3.4 实验结果 | 第71-73页 |
2.4 基于荧光检测的 LSD2 抑制剂筛选模型建立 | 第73-76页 |
2.4.1 实验原理 | 第73页 |
2.4.2 实验材料 | 第73-74页 |
2.4.3 实验方法 | 第74-75页 |
2.4.4 实验结果 | 第75-76页 |
2.5 LSD1 抑制剂的设计与合成 | 第76-105页 |
2.5.0 实验仪器 | 第76页 |
2.5.1 1,2,3-三氮唑-氨基二硫代甲酸酯衍生物合成方案设计 | 第76-79页 |
2.5.2 1,2,3-三氮唑-氨基二硫代甲酸酯衍生物合成 | 第79-82页 |
2.5.3 1,2,3-三氮唑-氨基二硫代甲酸酯衍生物合成和数据表征 | 第82-105页 |
2.5.4 1,2,3-三氮唑-氨基二硫代甲酸酯衍生物合成小结 | 第105页 |
2.6 LSD1 抑制剂的 LSD 抑制活性评价及构效关系讨论 | 第105-108页 |
小结 | 第108页 |
参考文献 | 第108-110页 |
3 新型 LSD1 抑制剂蛋白水平选择性及其作用机理研究 | 第110-122页 |
引言 | 第110页 |
3.1 新型 LSD1 抑制剂在重组蛋白水平选择性研究 | 第110-112页 |
3.1.1 化合物对 LSD2 抑制活性评价 | 第110页 |
3.1.2 化合物对 MAO-A、B 抑制活性评价 | 第110-111页 |
3.1.3 实验结果 | 第111-112页 |
3.2 新型 LSD1 抑制剂对 LSD1 活性的可逆性研究 | 第112-113页 |
3.2.1 实验原理 | 第112页 |
3.2.2 实验材料和方法 | 第112-113页 |
3.2.3 实验结果 | 第113页 |
3.3 新型 LSD1 抑制剂对 LSD1 底物及辅酶竞争性研究 | 第113-116页 |
3.3.1 实验原理 | 第114-115页 |
3.3.2 实验材料和方法 | 第115页 |
3.3.3 实验结果 | 第115-116页 |
3.4 新型 LSD1 抑制剂对与 LSD1 亲和力研究 | 第116-117页 |
3.4.1 实验原理和方法 | 第116页 |
3.4.2 实验结果 | 第116-117页 |
3.5 计算机模拟化合物 30 与 LSD1 的相互作用 | 第117-119页 |
3.5.1 分子对接及分子动力学的原理、方法和结果 | 第117-118页 |
3.5.2 分子对接及分子动力学模拟方法 | 第118页 |
3.5.3 分子对接和分子动力学模拟结果 | 第118-119页 |
小结 | 第119-120页 |
参考文献 | 第120-122页 |
4 新型 LSD1 抑制剂细胞水平活性分析及其体内、体外抗肿瘤作用研究 | 第122-146页 |
引言 | 第122页 |
4.1 新型 LSD1 抑制剂细胞水平去甲基化活性分析 | 第122-129页 |
4.1.1 实验材料 | 第122-126页 |
4.1.2 实验方法 | 第126-128页 |
4.1.3 实验结果 | 第128-129页 |
4.2 新型 LSD1 抑制剂对胃癌细胞生长抑制作用及分析 | 第129-132页 |
4.2.1 实验材料和方法 | 第129-130页 |
4.2.2 实验结果 | 第130-132页 |
4.3 LSD1 knockdown 对胃癌细胞 MGC-803 增殖作用研究 | 第132-134页 |
4.3.1 实验原理 | 第132页 |
4.3.2 实验材料和方法 | 第132-133页 |
4.3.3 实验结果 | 第133-134页 |
4.4 新型 LSD1 抑制剂对胃癌细胞 MGC-803 周期作用研究 | 第134-136页 |
4.4.1 实验原理 | 第134-135页 |
4.4.2 实验材料和方法 | 第135-136页 |
4.4.3 实验结果 | 第136页 |
4.5 新型 LSD1 抑制剂体对胃癌细胞 MGC-803 细胞形态学研究 | 第136-138页 |
4.5.1 实验原理 | 第136页 |
4.5.2 实验材料和方法 | 第136-137页 |
4.5.3 实验结果 | 第137-138页 |
4.6 新型 LSD1 抑制剂体对胃癌细胞 MGC-803 凋亡作用研究 | 第138-139页 |
4.6.1 实验原理 | 第138页 |
4.6.2 实验材料和方法 | 第138-139页 |
4.6.3 实验结果 | 第139页 |
4.7 新型 LSD1 抑制剂急性毒性研究 | 第139-142页 |
4.7.1 实验原理 | 第139-140页 |
4.7.2 实验材料和方法 | 第140-141页 |
4.7.3 实验结果 | 第141-142页 |
4.8 新型 LSD1 抑制剂体内抗肿瘤活性研究 | 第142-144页 |
4.8.1 实验材料与方法 | 第142-143页 |
4.8.2 实验结果 | 第143-144页 |
小结 | 第144-145页 |
参考文献 | 第145-146页 |
5 新型 LSD1 抑制剂对胃癌细胞系 MGC-803 转移和侵袭作用研究 | 第146-161页 |
引言 | 第146页 |
5.1 新型 LSD1 抑制剂抑制肿瘤细胞的转移 | 第146-149页 |
5.1.1 实验原理 | 第146-147页 |
5.1.2 实验材料和方法 | 第147-148页 |
5.1.3 实验结果 | 第148-149页 |
5.2 新型 LSD1 抑制剂抑制肿瘤细胞侵袭 | 第149-151页 |
5.2.1 实验原理 | 第149页 |
5.2.2 实验材料和方法 | 第149-150页 |
5.2.3 实验结果 | 第150-151页 |
5.3 新型 LSD1 抑制剂抑制肿瘤细胞上皮-间质转化 | 第151-156页 |
5.3.1 实验目的 | 第151-152页 |
5.3.2 免疫共沉淀实验原理和方法 | 第152-154页 |
5.3.3 实验结果 | 第154-156页 |
5.4 新型 LSD1 抑制剂抑制 MGC-803 中 TGF β1 的表达 | 第156-159页 |
5.4.1 实验背景和原理 | 第156-157页 |
5.4.2 实验材料和实验方法 | 第157-158页 |
5.4.3 实验结果 | 第158-159页 |
小结 | 第159页 |
参考文献 | 第159-161页 |
6 TGF β1 在胃癌细胞 MGC-803 及胃黏膜上皮细胞 GES-1 中对LSD1 调控作用及其作用机制研究 | 第161-184页 |
引言 | 第161页 |
6.1 MGC-803 中 TGF β1 促进 LSD1 的表达 | 第161-163页 |
6.1.1 实验原理和目的 | 第161页 |
6.1.2 实验材料 | 第161-162页 |
6.1.3 实验方法 | 第162页 |
6.1.4 实验结果 | 第162-163页 |
6.2 MGC-803 中 ERK 磷酸化介导 TGF β1 激活 NF-κB 诱导 LSD1 过表达 | 第163-170页 |
6.2.1 实验设计原理和目的 | 第163页 |
6.2.2 实验材料 | 第163页 |
6.2.3 实验方法和设计 | 第163-165页 |
6.2.4 实验结果 | 第165-170页 |
6.3 MGC-803 中 TGF β1 激活 NF-κB 并使其磷酸化,促进 p300 对 LSD1的转录调控 | 第170-172页 |
6.3.1 实验设计原理和目的 | 第170-171页 |
6.3.2 实验材料与方法 | 第171页 |
6.3.3 实验结果 | 第171-172页 |
6.4 MGC-803 中 TGF β1 激活 LSD1 启动子 | 第172-178页 |
6.4.1 实验设计原理和目的 | 第172-173页 |
6.4.2 实验材料与方法 | 第173-176页 |
6.4.3 实验结果 | 第176-178页 |
6.5 GES-1 中 TGF β1 对 LSD1 的表达无影响 | 第178-179页 |
6.5.1 实验原理和目的 | 第178-179页 |
6.5.2 实验材料和方法 | 第179页 |
6.5.3 实验结果 | 第179页 |
6.6 GES-1 中 ERK 磷酸化介导 TGF β1 激活 NF-κB 从而诱导 LSD1 过表达 | 第179-181页 |
6.6.1 实验设计原理和目的 | 第179-180页 |
6.6.2 实验材料,实验方法和设计 | 第180页 |
6.6.3 实验结果 | 第180-181页 |
小结 | 第181-183页 |
参考文献 | 第183-184页 |
结论 | 第184-186页 |
附图 | 第186-204页 |
个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第204-207页 |
致谢 | 第207页 |