疾病蛋白质—配体数据库构建及药物—靶标相互作用的预测
| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-19页 |
| 1.1 蛋白质-配体复合物及结构 | 第10-13页 |
| 1.1.1 疾病相关蛋白质概述 | 第10页 |
| 1.1.2 蛋白质-配体分子 | 第10-11页 |
| 1.1.3 蛋白质-配体复合物三维结构 | 第11-12页 |
| 1.1.4 研究现状 | 第12-13页 |
| 1.2 药物-靶标相互作用及预测 | 第13-17页 |
| 1.2.1 药物发现 | 第13-14页 |
| 1.2.2 药物-靶标相互作用 | 第14-15页 |
| 1.2.3 药物-靶标相互作用计算模型 | 第15-16页 |
| 1.2.4 研究现状 | 第16-17页 |
| 1.3 本文章节安排和创新点 | 第17-19页 |
| 第二章 构建与人类疾病相关的蛋白质-配体数据库 | 第19-30页 |
| 2.1 引言 | 第19页 |
| 2.2 疾病蛋白质-配体复合物结构数据收集与整合 | 第19-22页 |
| 2.2.1 复合物结构数据收集 | 第19-20页 |
| 2.2.2 复合物结构注释 | 第20-22页 |
| 2.3 数据简要统计和分析 | 第22-25页 |
| 2.3.1 数据简要统计 | 第22-23页 |
| 2.3.2 数据分析 | 第23-25页 |
| 2.4 数据库网站 | 第25-29页 |
| 2.4.1 数据存储 | 第25页 |
| 2.4.2 Web界面设计和web服务器搭建 | 第25-26页 |
| 2.4.3 数据库界面 | 第26-29页 |
| 2.5 本章小结 | 第29-30页 |
| 第三章 预测药物-靶标相互作用 | 第30-42页 |
| 3.1 引言 | 第30页 |
| 3.2 材料和方法 | 第30-36页 |
| 3.2.1 数据集 | 第30-31页 |
| 3.2.2 靶标蛋白特征编码 | 第31-32页 |
| 3.2.3 药物分子特征编码 | 第32-34页 |
| 3.2.4 分类器 | 第34-35页 |
| 3.2.5 评估药物-靶标相互作用预测效果 | 第35-36页 |
| 3.3 结果 | 第36-40页 |
| 3.3.1 药物-靶标相互作用的预测效果 | 第36-39页 |
| 3.3.2 与其他方法的比较 | 第39-40页 |
| 3.4 讨论 | 第40页 |
| 3.5 本章小结 | 第40-42页 |
| 第四章 总结与展望 | 第42-45页 |
| 4.1 总结 | 第42-43页 |
| 4.2 展望 | 第43-45页 |
| 参考文献 | 第45-54页 |
| 附录 | 第54-55页 |
| 致谢 | 第55-56页 |
| 硕士研究生期间发表的论文 | 第56页 |
