| 摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-23页 |
| 1 微生态学 | 第13-18页 |
| 1.1 微生物在生态系统中的地位 | 第13页 |
| 1.2 微生态学的研究方法 | 第13-18页 |
| 1.2.1 传统研究方法 | 第14-15页 |
| 1.2.2 分子研究方法 | 第15-18页 |
| 2 多营养层次生态养殖 | 第18-21页 |
| 2.1 对虾养殖面临的问题 | 第18页 |
| 2.2 多营养层次养殖的提出 | 第18-19页 |
| 2.3 对虾主要的生态养殖模式 | 第19-20页 |
| 2.4 贝类在多营养层次养殖系统中的调控作用 | 第20页 |
| 2.5 微生物对海水多营养层次健康养殖系统的调控 | 第20-21页 |
| 3 养殖水域微生物国内外研究进展 | 第21-22页 |
| 4 本研究目的和意义 | 第22-23页 |
| 第二章 PCR-DGGE 检测条件的优化 | 第23-38页 |
| 1 实验材料与方法 | 第23-32页 |
| 1.1 样品的采集与处理 | 第23-24页 |
| 1.2 实验试剂 | 第24-26页 |
| 1.2.1 化学药品 | 第24页 |
| 1.2.2 溶液配制方法 | 第24-25页 |
| 1.2.3 PCR 引物及载体 | 第25-26页 |
| 1.3 实验方法 | 第26-32页 |
| 1.3.1 样品总 DNA 的提取 | 第26-28页 |
| 1.3.2 粗提 DNA 的纯化 | 第28页 |
| 1.3.3 PCR 扩增条件的优化 | 第28-30页 |
| 1.3.4 DGGE 条件的优化 | 第30-32页 |
| 2 实验结果与讨论 | 第32-37页 |
| 2.1 总 DNA 提取结果 | 第32-33页 |
| 2.2 PCR 优化结果 | 第33-34页 |
| 2.3 DGGE 优化结果 | 第34-37页 |
| 2.3.1 确定变性剂的梯度范围 | 第34-35页 |
| 2.3.2 最佳电泳时间的确定 | 第35-36页 |
| 2.3.3 染色方法的对比 | 第36-37页 |
| 3 小结 | 第37-38页 |
| 第三章 多营养层次养殖池塘沉积物细菌群落结构分析 | 第38-58页 |
| 1 实验材料与方法 | 第38-41页 |
| 1.1 采集样品 | 第38页 |
| 1.2 实验方法 | 第38-41页 |
| 1.2.1 DGGE 图谱相关统计分析 | 第38-39页 |
| 1.2.2 DGGE 条带的序列测定 | 第39-41页 |
| 2 实验结果 | 第41-52页 |
| 2.1 总 DNA 提取结果 | 第41页 |
| 2.2 降落 PCR 扩增结果 | 第41-42页 |
| 2.3 DGGE 图谱分析 | 第42-45页 |
| 2.3.1 同一养殖模式养殖周期内 DGGE 图谱 | 第42-44页 |
| 2.3.2 不同养殖模式池塘在同一时期 DGGE 图谱 | 第44-45页 |
| 2.4 DGGE 图谱的 UPGMA 聚类分析 | 第45-46页 |
| 2.5 DGGE 条带序列测定及细菌群落系统发育分析 | 第46-47页 |
| 2.6 香浓威纳指数（H′） | 第47-52页 |
| 3 讨论 | 第52-56页 |
| 3.1 池塘底泥样品总 DNA 的提取 | 第52页 |
| 3.2 Shannon-Wiener 指数和条带数 | 第52-53页 |
| 3.3 同一养殖模式养殖周期内微生物生物群落结构变化 | 第53-54页 |
| 3.4 不同营养层次养殖池塘菌群的分析比较 | 第54-56页 |
| 4 小结 | 第56-58页 |
| 第四章 养殖池塘细菌变动与理化因子相关性分析 | 第58-68页 |
| 1 实验材料与方法 | 第58-59页 |
| 1.1 理化指标的测定 | 第58页 |
| 1.2 沉积物异养细菌及弧菌计数 | 第58-59页 |
| 1.3 细菌群落结构与环境因子的典型性对应分析 | 第59页 |
| 2 实验结果 | 第59-64页 |
| 2.1 养殖周期内底泥细菌数量的周期变化 | 第59-60页 |
| 2.2 养殖周期内底泥理化指标的动态变化 | 第60-62页 |
| 2.3 细菌群落与环境因子的典型性对应关系 | 第62-64页 |
| 2.4 细菌数量动态变化与理化因子的相关分析 | 第64页 |
| 3 讨论 | 第64-66页 |
| 3.1 养殖池塘理化因子的动态变化 | 第64-65页 |
| 3.2 养殖周期底泥数量的动态变化及与理化因子的关系 | 第65页 |
| 3.3 细菌群落分布与理化因子相关性分析 | 第65-66页 |
| 4 小结 | 第66-68页 |
| 参考文献 | 第68-76页 |
| 个人简历 | 第76页 |
| 发表的学术论文 | 第76-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
