致谢 | 第6-7页 |
摘要 | 第7-9页 |
Abstract | 第9-11页 |
缩略词表 | 第12-15页 |
前言 | 第15-17页 |
1 文献综述 | 第17-37页 |
1.1 植物性染色体进化研究进展 | 第17-20页 |
1.1.1 植物性染色体的起源 | 第17-18页 |
1.1.2 植物性染色体的演变 | 第18-19页 |
1.1.3 遗传退化与剂量补偿效应 | 第19-20页 |
1.2 植物性别决定基因研究进展 | 第20-23页 |
1.2.1 植物性染色体连锁基因的挖掘 | 第20-22页 |
1.2.2 植物性别决定基因的分离与鉴定 | 第22-23页 |
1.3 miRNA参与调控植物性别决定与分化 | 第23-26页 |
1.3.1 植物miRNA的形成与作用机制 | 第23-24页 |
1.3.2 植物性别决定与分化相关的miRNA | 第24-26页 |
1.4 激素与糖信号参与调控植物性别决定与分化 | 第26-29页 |
1.4.1 植物激素调控性别决定与分化 | 第26-28页 |
1.4.2 糖类代谢与植物性别分化 | 第28-29页 |
1.5 芦笋性别决定机制研究进展 | 第29-32页 |
1.5.1 芦笋雌雄花分化及其生理生化特性的研究 | 第29-30页 |
1.5.2 芦笋性别决定基因及其连锁分子标记的鉴定 | 第30-32页 |
1.6 转录组学研究概况 | 第32-37页 |
1.6.1 转录组测序技术 | 第32-33页 |
1.6.2 转录组学研究的应用 | 第33-37页 |
2 芦笋不同发育时期雌雄花形态学特征研究及转录组测序分析 | 第37-57页 |
2.1 材料与方法 | 第38-44页 |
2.1.1 植物材料 | 第38页 |
2.1.2 主要试剂与仪器 | 第38-39页 |
2.1.3 花器官的形态观察与比较 | 第39-40页 |
2.1.4 转录组的高通量测序 | 第40-42页 |
2.1.5 基因功能注释 | 第42-43页 |
2.1.6 差异表达基因筛选 | 第43页 |
2.1.7 SNP的鉴定 | 第43-44页 |
2.2 结果与分析 | 第44-53页 |
2.2.1 芦笋雌雄花发育的形态学特征与测序样品的选择 | 第44-46页 |
2.2.2 RNA-seq数据分析 | 第46-50页 |
2.2.3 芦笋雌雄花间差异表达基因分析 | 第50-52页 |
2.2.4 芦笋花发育不同时期间差异表达基因分析 | 第52-53页 |
2.2.5 芦笋雄花与雌花间SNP的鉴定 | 第53页 |
2.3 讨论 | 第53-57页 |
2.3.1 芦笋性别分化过程中两性花向单性花的转变 | 第53-54页 |
2.3.2 芦笋雌雄花发育过程中基因表达模式分析 | 第54页 |
2.3.3 基于表达特征预测芦笋性别决定相关基因 | 第54-57页 |
3 芦笋雌雄花不同发育时期差异表达基因的功能分析与验证 | 第57-79页 |
3.1 材料与方法 | 第59-63页 |
3.1.1 植物材料 | 第59页 |
3.1.2 主要试剂与仪器 | 第59页 |
3.1.3 差异表达基因的GO功能分类 | 第59页 |
3.1.4 差异表达基因的代谢通路预测 | 第59-60页 |
3.1.5 特定代谢途径相关基因的筛选 | 第60页 |
3.1.6 qRT-PCR验证基因表达特征 | 第60-62页 |
3.1.7 植物内源激素含量的测定 | 第62-63页 |
3.2 结果与分析 | 第63-76页 |
3.2.1 芦笋雌雄花间差异表达基因的GO功能富集分析 | 第63-68页 |
3.2.2 芦笋雌雄花间差异表达基因的Pathway富集分析 | 第68-69页 |
3.2.3 植物激素代谢相关基因的表达特征 | 第69-70页 |
3.2.4 糖类代谢相关基因的表达特征 | 第70-71页 |
3.2.5 基因表达模式的qRT-PCR验证 | 第71-75页 |
3.2.6 芦笋雌雄花不同发育时期内源生长素、赤霉素和茉莉酸的含量变化 | 第75-76页 |
3.3 讨论 | 第76-79页 |
3.3.1 植物激素调控芦笋性别决定与性别分化 | 第76-78页 |
3.3.2 糖信号参与调控芦笋性别分化 | 第78-79页 |
4 基于芦笋转录组数据对性别分化相关miRNA靶基因的鉴定与表达分析 | 第79-97页 |
4.1 材料与方法 | 第81-87页 |
4.1.1 植物材料 | 第81页 |
4.1.2 主要试剂与仪器 | 第81页 |
4.1.3 运用生物信息学方法预测miRNA靶基因 | 第81-82页 |
4.1.4 运用RLM-5'RACE法验证miRNA靶基因 | 第82-86页 |
4.1.5 miRNA及其靶基因的qRT-PCR分析 | 第86-87页 |
4.2 结果与分析 | 第87-92页 |
4.2.1 利用转录组数据库预测芦笋雌雄株差异表达miRNA的靶基因 | 第87-88页 |
4.2.2 运用RLM-5'RACE法验证得到芦笋4个miRNA的10个靶基因 | 第88-89页 |
4.2.3 芦笋雌雄花发育不同时期miRNA及其靶基因的表达模式分析 | 第89-92页 |
4.3 讨论 | 第92-97页 |
4.3.1 芦笋雌雄个体差异表达miRNA的靶基因预测与验证 | 第92-93页 |
4.3.2 芦笋性别分化相关miRNA及其靶基因的筛选与鉴定 | 第93-94页 |
4.3.3 miR160d调控芦笋性别分化的模式浅析 | 第94-97页 |
5 结论 | 第97-99页 |
参考文献 | 第99-109页 |
附录 | 第109-135页 |