| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-26页 |
| 1.1 海湾扇贝历史地理分布和我国的养殖情况 | 第11-12页 |
| 1.1.1 海湾扇贝历史地理分布 | 第11页 |
| 1.1.2 海湾扇贝在我国的养殖情况 | 第11-12页 |
| 1.2 海洋贝类壳色研究进展 | 第12-16页 |
| 1.2.1 海洋贝类壳色的化学本质 | 第12-13页 |
| 1.2.2 海洋贝类壳色的遗传研究 | 第13-15页 |
| 1.2.3 海湾扇贝壳色研究进展 | 第15-16页 |
| 1.3 DNA分子标记和SNP分型方法简介 | 第16-25页 |
| 1.3.1 DNA分子标记 | 第16-22页 |
| 1.3.2 SNP分型方法 | 第22-25页 |
| 1.4 本研究主要内容与意义 | 第25-26页 |
| 1.4.1 本研究主要内容 | 第25页 |
| 1.4.2 本研究意义 | 第25-26页 |
| 第二章 海湾扇贝壳色关联标记开发 | 第26-40页 |
| 2.1 材料与方法 | 第26-30页 |
| 2.1.1 样品的采集 | 第26-27页 |
| 2.1.2 DNA提取 | 第27页 |
| 2.1.3 SNP标记分型和关联分析 | 第27-28页 |
| 2.1.4 后期验证实验 | 第28-30页 |
| 2.2 结果 | 第30-38页 |
| 2.2.1 测序结果 | 第30-32页 |
| 2.2.2 SNP分型及关联分析 | 第32-36页 |
| 2.2.3 验证试验结果 | 第36-38页 |
| 2.3 讨论 | 第38-40页 |
| 第三章 海湾扇贝转录组分析 | 第40-51页 |
| 3.1 材料与方法 | 第40-42页 |
| 3.1.1 样品采集 | 第40页 |
| 3.1.2 总RNA提取 | 第40-41页 |
| 3.1.3 制备文库和Illumina HiSeq测序 | 第41页 |
| 3.1.4 De novo拼接 | 第41-42页 |
| 3.1.5 Unigene注释差异表达基因分析 | 第42页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第42-50页 |
| 3.2.1 双端测序及组转结果 | 第42-43页 |
| 3.2.2 Unigene注释结果 | 第43-44页 |
| 3.2.3 GO注释分析、KEGG注释分析结果 | 第44-45页 |
| 3.2.4 差异表达基因分析 | 第45-48页 |
| 3.2.5 差异表达基因功能注释 | 第48-50页 |
| 3.3 小结 | 第50-51页 |
| 第四章 总结 | 第51-54页 |
| 参考文献 | 第54-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果 | 第63页 |