基于单细胞转录组分析的鲩肠袋虫系统发育研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5页 |
| 第一章 绪论 | 第9-22页 |
| 1.1 鲩肠袋虫的国内外研究现状 | 第9-11页 |
| 1.1.1 鲩肠袋虫的概述 | 第9-10页 |
| 1.1.2 鲩肠袋虫研究的现状 | 第10-11页 |
| 1.1.3 鲩肠袋虫研究存在的问题 | 第11页 |
| 1.2 系统发育的研究现状 | 第11-14页 |
| 1.2.1 系统发育研究的历史 | 第11-12页 |
| 1.2.2 分子系统发育研究的历史 | 第12-14页 |
| 1.3 测序技术的研究现状 | 第14-20页 |
| 1.3.1 一代测序 | 第15页 |
| 1.3.2 二代测序 | 第15-18页 |
| 1.3.3 三代测序 | 第18-19页 |
| 1.3.4 单细胞测序 | 第19-20页 |
| 1.4 研究目的及意义 | 第20-22页 |
| 1.4.1 鲩肠袋虫的基因功能注释 | 第20-21页 |
| 1.4.2 鲩肠袋虫的系统发育基因组学 | 第21-22页 |
| 第二章 实验与方法 | 第22-31页 |
| 2.1 样品收集与分离 | 第22页 |
| 2.2 蛋白银染色 | 第22-23页 |
| 2.3 单细胞转录组测序 | 第23-25页 |
| 2.3.1 测序样品收集 | 第23页 |
| 2.3.2 单细胞转录组测序 | 第23-25页 |
| 2.4 转录组分析 | 第25-26页 |
| 2.4.1 转录组从头组装 | 第25-26页 |
| 2.4.2 转录组污染物去除 | 第26页 |
| 2.5 转录组功能注释 | 第26-27页 |
| 2.6 系统发育分析 | 第27-31页 |
| 2.6.1 系统发育分析数据的获得 | 第27-29页 |
| 2.6.2 基于SSU rDNA的系统发育研究 | 第29-30页 |
| 2.6.3 系统发育基因组学 | 第30-31页 |
| 第三章 结果 | 第31-41页 |
| 3.1 形态描述 | 第31-32页 |
| 3.2 转录组分析 | 第32-35页 |
| 3.2.1 原始数据处理 | 第32-33页 |
| 3.2.2 转录组组装 | 第33-35页 |
| 3.3 转录组功能注释结果 | 第35-38页 |
| 3.4 系统发育分析结果 | 第38-41页 |
| 第四章 讨论 | 第41-45页 |
| 4.1 形态学鉴定 | 第41页 |
| 4.2 单细胞转录组测序样品分离与收集方法 | 第41-42页 |
| 4.3 单细胞转录组的分析 | 第42-43页 |
| 4.4 鲩肠袋虫系统发育地位的探讨 | 第43-44页 |
| 4.5 本研究创新点 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-51页 |
| 附录 | 第51-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第62页 |
