| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第1章 基于~(13)C标记实验的代谢组学分析技术的原理 | 第10-40页 |
| 1.1 系统生物学与代谢组学简介 | 第10-11页 |
| 1.2 代谢组学常用技术 | 第11-14页 |
| 1.3 代谢通量分析 | 第14-27页 |
| 1.3.1 计量代谢通量的发展与局限 | 第15页 |
| 1.3.2 ~(13)C代谢通量分析的发展 | 第15-16页 |
| 1.3.3 基于GC-MS的代谢通量比分析 | 第16-27页 |
| 1.4 NMR在代谢组学分析中的应用 | 第27-34页 |
| 1.4.1 NMR用于代谢组学研究的优势 | 第28-29页 |
| 1.4.2 代谢组学中常见NMR实验 | 第29-34页 |
| 参考文献 | 第34-40页 |
| 第2章 癌症细胞代谢与表观遗传调控 | 第40-56页 |
| 2.1 癌症与细胞代谢 | 第40-42页 |
| 2.2 癌症中的表观遗传调控与代谢 | 第42-44页 |
| 2.3 Jhdm1b的功能 | 第44-48页 |
| 2.4 RIP3与细胞程序性坏死 | 第48-50页 |
| 参考文献 | 第50-56页 |
| 第3章 实验材料与方法 | 第56-74页 |
| 3.1 实验材料 | 第56-57页 |
| 3.1.1 细胞 | 第56页 |
| 3.1.2 细胞培养相关试剂 | 第56页 |
| 3.1.3 各种试剂盒 | 第56页 |
| 3.1.4 合成引物 | 第56页 |
| 3.1.5 各种抗体 | 第56-57页 |
| 3.1.6 代谢组学相关试剂 | 第57页 |
| 3.2 细胞培养方法与缺失株构建 | 第57-61页 |
| 3.2.1 细胞传代 | 第57页 |
| 3.2.2 细胞保种 | 第57-58页 |
| 3.2.3 细胞复苏 | 第58页 |
| 3.2.4 细胞计数 | 第58页 |
| 3.2.5 细胞转染 | 第58-59页 |
| 3.2.6 ~(13)C稳定同位素标记实验 | 第59页 |
| 3.2.7 哺乳动物细胞基因敲低 | 第59-61页 |
| 3.3 荧光实时定量PCR | 第61-65页 |
| 3.3.1 核酸电泳 | 第62-63页 |
| 3.3.2 逆转录反应 | 第63页 |
| 3.3.3 绘制熔解曲线 | 第63-65页 |
| 3.4 SDS-PAGE电泳 | 第65-66页 |
| 3.5 免疫印迹(Western Blot) | 第66-67页 |
| 3.6 酶活测定 | 第67-68页 |
| 3.6.1 糖原磷酸酶(Glycogen phosphorylase,PYGL)酶活测定 | 第67页 |
| 3.6.2 谷氨酰胺合成酶(Glutamine synthetase,GLUL)酶活测定 | 第67-68页 |
| 3.6.3 谷氨酸脱氢酶1(Glutamate dehydrogenase 1,GLUD1)酶活测定 | 第68页 |
| 3.6.4 丙酮酸脱氢酶(Pyruvate dehydrogenase,PDH)酶活测定 | 第68页 |
| 3.7 细胞坏死检测 | 第68-69页 |
| 3.8 代谢物抽提方法 | 第69-71页 |
| 3.9 NMR与GC-MS | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-74页 |
| 第4章 肿瘤细胞中Jhdm1b代谢调控功能的系统生物学研究 | 第74-94页 |
| 4.1 引言 | 第74页 |
| 4.2 实验结果 | 第74-88页 |
| 4.2.1 HeLa细胞中Jhdm1b被敲低抑制细胞增殖 | 第74-75页 |
| 4.2.2 Jhdm1b敲低细胞中糖酵解通路受到抑制 | 第75-77页 |
| 4.2.3 Jhdm1b被敲低后柠檬酸循环活性保持稳定 | 第77-81页 |
| 4.2.4 Jhdm1b被敲低后核苷酸合成速率下降 | 第81-83页 |
| 4.2.5 磷酸戊糖途径活性没有因Jhdm1b敲低而上调 | 第83页 |
| 4.2.6 Jhdm1b的敲低激活RIP3表达 | 第83-85页 |
| 4.2.7 RIP3调控的代谢酶表达水平与活性在Jhdm1b敲低后升高 | 第85-86页 |
| 4.2.8 RIP3和Jhdm1b的双敲低实验部分恢复Jhdm1b敲低引起的代谢变化 | 第86-88页 |
| 4.3 讨论 | 第88-92页 |
| 4.3.1 Jhdm1b促进细胞增殖并激活细胞的能量代谢与生物质合成 | 第88-89页 |
| 4.3.2 Jhdm1b敲低后激活PDH | 第89页 |
| 4.3.3 Jhdm1b通过RIP3调控肿瘤细胞代谢 | 第89-90页 |
| 4.3.4 Jhdm1b可能通过募集PRC1激活RIP3在癌症细胞中的表达 | 第90-92页 |
| 参考文献 | 第92-94页 |
| 附录 | 第94-103页 |
| 致谢 | 第103-105页 |
| 在读期间发表的学术论文与参加的学术会议 | 第105页 |
