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长非编码RNA-AK003290在成肌细胞增殖和分化过程中的功能研究

摘要第9-11页
Abstract第11-12页
缩略词表第13-14页
第一章 文献综述第14-25页
    1 前言第14页
    2 骨骼肌概述第14-15页
        2.1 骨骼肌的生长发育与再生第14-15页
        2.2 骨骼肌的结构与功能第15页
    3 骨骼肌生长发育的相关调控因子第15-17页
    4 MicroRNA在骨骼肌中的作用第17-18页
    5 长非编码RNA第18-23页
        5.1 长非编码RNA简介第18-19页
        5.2 lncRNA的生物学功能第19-23页
            5.2.1 lncRNA对成肌细胞增殖和分化的影响第19-21页
            5.2.2 lncRNA与肌肉再生第21-22页
            5.2.3 lncRNA与疾病第22-23页
        5.3 lncRNA的作用机制第23页
    6 本研究的目的和意义第23-25页
第二章 材料和方法第25-50页
    1 实验材料第25-30页
        1.1 实验样品第25页
            1.1.1 实验动物第25页
            1.1.2 细胞样品第25页
            1.1.3 克隆载体第25页
        1.2 主要仪器和设备第25-26页
        1.3 主要试剂与试剂盒第26-27页
        1.4 常用试剂及配制第27-29页
        1.5 表达谱芯片第29页
        1.6 主要数据库和软件第29页
        1.7 所用载体第29-30页
    2 试验方法第30-50页
        2.1 构建小鼠组织表达谱第30-32页
            2.1.1 小鼠组织样的总RNA提取第30-31页
            2.1.2 RNA质量浓度检测第31页
            2.1.3 RNA反转录成cDNA第31-32页
        2.2 细胞培养第32-33页
            2.2.1 细胞的复苏第32页
            2.2.2 细胞的增殖培养第32-33页
            2.2.3 细胞的分化培养第33页
            2.2.4 细胞的冻存第33页
        2.3 AK003290-siRNA干涉片段的选取第33-34页
        2.4 AK003290超表达载体构建第34页
        2.5 脂质体介导的细胞转染(6 孔板)第34页
        2.6 C2C12细胞总RNA的提取和cDNA的制备第34-35页
        2.7 Quantitative real-time PCR分析第35-38页
            2.7.1 PCR的引物设计第35-36页
            2.7.2 荧光实时定量PCR第36-37页
            2.7.3 定量数据分析第37-38页
        2.8 RACE扩增及序列检测第38-40页
            2.8.1 制备 5’/3’ RACE第一链第38页
            2.8.2 设计PCR扩增引物第38-39页
            2.8.3 快速扩增cDNA Ends第39-40页
            2.8.4 琼脂糖凝胶电泳和成像第40页
            2.8.5 PCR产物的胶回收和克隆测序第40页
        2.9 细胞核和细胞质的RNA分离第40-41页
        2.10 Northern blotting分析第41-43页
            2.10.1 RNA提取第41页
            2.10.2 琼脂糖变性胶电泳第41页
            2.10.3 转膜第41-42页
            2.10.4 紫外交联第42页
            2.10.5 亚甲基蓝染色第42页
            2.10.6 探针标记第42-43页
            2.10.7 预杂交第43页
            2.10.8 杂交第43页
            2.10.9 洗膜第43页
            2.10.10 放射自显影第43页
        2.11 荧光原位杂交(Henderson et al)第43-44页
            2.11.1 细胞培养第43页
            2.11.2 细胞固定与通透第43-44页
            2.11.3 探针检测第44页
            2.11.4 DAPI染色第44页
        2.12 EdU染色第44-46页
            2.12.1 细胞培养第44页
            2.12.2 EdU标记第44页
            2.12.3 细胞固定化第44-45页
            2.12.4 Apollo染色第45页
            2.12.5 DNA染色第45页
            2.12.5 DAPI染色第45-46页
            2.12.6 图片获取及分析第46页
        2.13 蛋白检测分析第46-48页
            2.13.1 蛋白的提取第46页
            2.13.2 蛋白质的检测第46-48页
        2.14 免疫荧光第48页
        2.15 RTCA×CELLigence系统细胞增殖实验第48-49页
            2.15.1 细胞悬液的准备第48页
            2.15.2 E-Plate 96(Roche公司产品)准备第48-49页
        2.16 细胞迁移检测第49-50页
第三章 结果和分析第50-69页
    1 LncRNA-AK003290的自身特征第50-53页
        1.1 对AK003290的组织表达谱进行分析第50页
        1.2 AK003290在成肌细胞分化过程中的表达情况第50-51页
        1.3 AK003290的 5'Race和 3'Race以及Northern blot第51-52页
            1.3.1 细胞总RNA的完整性和纯度检测第51页
            1.3.2 AK003290的 5'Race,3'Race和Northern blot结果第51-52页
        1.4 AK003290编码能力预测第52页
        1.5 AK003290的核质定位第52-53页
    2 AK003290对成肌细胞增殖的影响第53-58页
        2.1 干涉AK003290对成肌细胞增殖的影响第53-56页
            2.1.1 AK003290干涉片段筛选和干涉效率检测第53-54页
            2.1.2 干涉AK003290对成肌细胞增殖及其相关基因的影响第54-56页
        2.2 超表达AK003290对成肌细胞增殖的影响第56-58页
    3 AK003290对成肌细胞分化的影响第58-63页
        3.1 干涉AK003290对成肌细胞分化的影响第58-60页
        3.2 超表达AK003290对成肌细胞分化的影响第60-63页
    4 AK003290对成肌细胞迁移的影响第63-65页
        4.1 干涉AK003290对成肌细胞迁移的影响第63-64页
        4.2 超表达AK003290对成肌细胞迁移的影响第64-65页
    5 利用基因芯片检测干涉AK003290前后差异基因表达的变化情况并做相关分析第65-69页
        5.1 芯片样品干涉效率验证第65页
        5.2 芯片中差异基因筛选第65-66页
        5.3 差异基因的可靠性验证第66页
        5.4 差异基因的Gene ontology(GO)显著性富集分析第66-68页
        5.5 KEGG Pathway显著性富集分析第68-69页
第四章 讨论第69-73页
    1 AK003290在成肌细胞增殖和分化过程中的表达模式第69-70页
    2 AK003290的功能分析第70-71页
    3 AK003290调控机制的预测第71-72页
    4 下一步计划第72-73页
第五章 小结第73-74页
参考文献第74-83页
致谢第83-84页

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