| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第一章 绪论 | 第10-22页 |
| 1.1 红色糖多孢菌简介 | 第10-12页 |
| 1.2 蛋白质组学介绍 | 第12-14页 |
| 1.2.1 表达蛋白质组学 | 第13-14页 |
| 1.2.2 功能蛋白质组学 | 第14页 |
| 1.3 翻译后修饰——赖氨酸乙酰化 | 第14-17页 |
| 1.3.1 蛋白赖氨酸乙酰化修饰 | 第14-16页 |
| 1.3.2 乙酰化调控的生物学过程 | 第16页 |
| 1.3.3 乙酰化的生物学意义 | 第16-17页 |
| 1.4 乙酰转移酶和去乙酰化酶 | 第17-20页 |
| 1.4.1 乙酰转移酶 | 第17-18页 |
| 1.4.2 去乙酰化酶 | 第18-19页 |
| 1.4.3 原核生物的乙酰转移酶/去乙酰化酶系统 | 第19-20页 |
| 1.5 研究目的和意义 | 第20-22页 |
| 第二章 材料与方法 | 第22-37页 |
| 2.1 实验材料 | 第22-29页 |
| 2.1.1 菌种 | 第22页 |
| 2.1.2 培养基 | 第22-24页 |
| 2.1.3 溶液配方 | 第24-27页 |
| 2.1.4 实验试剂，试剂盒和仪器设备 | 第27-29页 |
| 2.2 实验方法 | 第29-37页 |
| 2.2.1 红色糖多胞菌的培养及菌种保藏 | 第29页 |
| 2.2.2 红色糖多孢菌蛋白质提取 | 第29页 |
| 2.2.3 SDS-PAGE电泳和Western blotting | 第29-30页 |
| 2.2.4 胰蛋白酶消化水解 | 第30页 |
| 2.2.5 赖氨酸乙酰化肽段免疫富集 | 第30页 |
| 2.2.6 二维电泳 | 第30-32页 |
| 2.2.7 二维荧光差异凝胶电泳(2-D DIEG) | 第32-34页 |
| 2.2.8 质谱分析及数据库检索 | 第34-35页 |
| 2.2.9 生物信息学分析 | 第35-37页 |
| 第三章 红色糖多孢菌乙酰化组学分析 | 第37-55页 |
| 3.1 引言 | 第37-38页 |
| 3.2 实验方案的设计 | 第38页 |
| 3.3 实验结果与分析 | 第38-53页 |
| 3.3.1 鉴定和分析红色糖多孢菌中赖氨酸乙酰化蛋白 | 第38-42页 |
| 3.3.2 乙酰化蛋白组学的功能富集分析 | 第42-44页 |
| 3.3.3 参与新陈代谢过程中被乙酰化的酶 | 第44-47页 |
| 3.3.4 转录过程中的乙酰化蛋白 | 第47-48页 |
| 3.3.5 鉴定和分析红色糖多孢菌中特异赖氨酸乙酰化基因序列 | 第48-51页 |
| 3.3.6 乙酰化蛋白的相互作用和功能结构域分析 | 第51-53页 |
| 3.4 小结 | 第53-55页 |
| 第四章 蛋白质组学比较分析红色糖多孢菌野生菌与SACE_5148,SACE_3798敲除菌 | 第55-72页 |
| 4.1 引言 | 第55-57页 |
| 4.2 方案设计思路 | 第57页 |
| 4.3 实验结果与分析 | 第57-70页 |
| 4.3.1 ΔSACE 5148菌、ΔSACE_3798菌和野生菌表型差异研究 | 第57-60页 |
| 4.3.2 二维电泳分离蛋白条件的确定 | 第60-62页 |
| 4.3.3 二维荧光差异凝胶电泳比较差异点 | 第62-65页 |
| 4.3.4 质谱鉴定及蛋白数据库检索 | 第65-68页 |
| 4.3.5 差异蛋白富集分析 | 第68-70页 |
| 4.4 小结 | 第70-72页 |
| 第五章 总结与展望 | 第72-74页 |
| 参考文献 | 第74-81页 |
| 附录 | 第81-108页 |
| 致谢 | 第108页 |
