| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 1 绪论 | 第8-12页 |
| 1.1 研究背景及研究意义 | 第8-9页 |
| 1.2 研究内容及论文结构 | 第9-12页 |
| 1.2.1 研究内容 | 第9-10页 |
| 1.2.2 论文结构 | 第10-12页 |
| 2 国内外研究现状 | 第12-17页 |
| 2.1 植物miRNA非生物逆境响应研究现状 | 第12-13页 |
| 2.2 植物中蛋白质相互作用网络研究现状 | 第13-14页 |
| 2.3 基于复杂网络理论的蛋白质相互作用网络研究现状 | 第14-15页 |
| 2.3.1 复杂网络的特性 | 第14-15页 |
| 2.3.2 复杂网络在蛋白质互作网络中的应用 | 第15页 |
| 2.4 本章小结 | 第15-17页 |
| 3 水稻蛋白质相互作用组预测及PPI网络的构建 | 第17-25页 |
| 3.1 基于计算机模拟的蛋白质间相互作用组的预测方法 | 第17-20页 |
| 3.1.1 实验数据 | 第17页 |
| 3.1.2 基于interolog原理的蛋白质互作组预测方法 | 第17-19页 |
| 3.1.3 实验结果 | 第19-20页 |
| 3.2 融入非生物逆境相关miRNA的蛋白质互作网络的构建 | 第20-23页 |
| 3.2.1 非生物逆境相关miRNA的收集 | 第20-21页 |
| 3.2.2 非生物逆境miRNA的靶基因预测及PPI网络构建 | 第21-23页 |
| 3.3 本章小结 | 第23-25页 |
| 4 水稻PPI网络中逆境miRNA靶基因的拓扑结构分析 | 第25-41页 |
| 4.1 不同类型的蛋白质相互作用概率计算方法 | 第25-29页 |
| 4.1.1 相互作用概率的定义 | 第25-26页 |
| 4.1.2 实验结果分析 | 第26-29页 |
| 4.2 基于复杂网络理论的逆境miRNA靶向基因的特征属性分析方法 | 第29-36页 |
| 4.2.1 七种网络测量值的定义 | 第29-32页 |
| 4.2.2 实验结果分析 | 第32-36页 |
| 4.3 基于复杂网络理论的k-core算法提取PPI网络核心信息的方法 | 第36-38页 |
| 4.3.1 k-core分解算法的定义 | 第36-37页 |
| 4.3.2 实验结果分析 | 第37-38页 |
| 4.4 实例验证：水稻响应寒冷逆境的网络调控机制 | 第38-40页 |
| 4.5 本章小结 | 第40-41页 |
| 5 总结与展望 | 第41-44页 |
| 5.1 工作总结 | 第41-43页 |
| 5.2 工作展望 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-48页 |
| 致谢 | 第48-49页 |
| 个人简介 | 第49-50页 |
| 在读期间发表的学术论文、成果及科研工作情况 | 第50-51页 |
| 附录A 图索引 | 第51-52页 |
| 附录B 表索引 | 第52-53页 |
| Appendix A Figure Index | 第53-54页 |
| Appendix B Table Index | 第54页 |
