| 符号说明 | 第5-11页 |
| 中文摘要 | 第11-13页 |
| Abstract | 第13-15页 |
| 1. 引言 | 第16-28页 |
| 1.1 肠道菌群研究概述 | 第16-19页 |
| 1.1.1 肠道菌群的形成过程 | 第16页 |
| 1.1.2 肠道菌群的组成与分布 | 第16-17页 |
| 1.1.3 肠道微生物的类群 | 第17-18页 |
| 1.1.4 肠道菌群的功能 | 第18-19页 |
| 1.1.4.1 营养与代谢 | 第18-19页 |
| 1.1.4.2 免疫保护 | 第19页 |
| 1.2 肠道菌群研究方法概述 | 第19-23页 |
| 1.2.1 传统培养方法 | 第19-20页 |
| 1.2.2 以宏基因组学为基础的研究方法 | 第20-23页 |
| 1.2.2.1 荧光原位杂交技术 | 第21页 |
| 1.2.2.2 末端限制性片段长度多态性技术 | 第21-22页 |
| 1.2.2.3 变性/温度梯度凝胶电泳技术 | 第22页 |
| 1.2.2.4 高通量测序技术 | 第22-23页 |
| 1.3 微生态制剂研究概述 | 第23-27页 |
| 1.3.1 微生态制剂的研究现状 | 第24页 |
| 1.3.2 微生态制剂的分类 | 第24-25页 |
| 1.3.3 常用益生菌的种类 | 第25-26页 |
| 1.3.4 微生态制剂对反刍动物的影响 | 第26-27页 |
| 1.3.4.1 稳定瘤胃内环境，促进氮的代谢 | 第26页 |
| 1.3.4.2 增加瘤胃微生物的数量，提高机体对饲料的利用率 | 第26页 |
| 1.3.4.3 提高机体的免疫力和抗病力 | 第26页 |
| 1.3.4.4 对新生反刍动物的影响 | 第26-27页 |
| 1.3.5 微生态制剂在反刍动物方面的应用 | 第27页 |
| 1.4 本研究的目的及意义 | 第27-28页 |
| 2. 材料与方法 | 第28-40页 |
| 2.1 菌（毒）株与试验动物 | 第28页 |
| 2.2 试剂和仪器 | 第28-29页 |
| 2.3 小尾寒羊肠道正常菌群群落分布高通量测序分析 | 第29-34页 |
| 2.3.1 肠道样本的采集 | 第29页 |
| 2.3.2 DNA的提取 | 第29-30页 |
| 2.3.3 Meta Vx?文库构建和Illumina Mi Seq测序 | 第30-32页 |
| 2.3.4 生物信息学和统计分析 | 第32-34页 |
| 2.3.4.1 测序数据初步统计 | 第32页 |
| 2.3.4.2 测序数据质量优化 | 第32页 |
| 2.3.4.3 OTU分析 | 第32-33页 |
| 2.3.4.4 物种分类分析 | 第33页 |
| 2.3.4.5 α 多样性分析 | 第33页 |
| 2.3.4.6 β 多样性分析 | 第33页 |
| 2.3.4.7 样本聚类分析 | 第33-34页 |
| 2.4 具有益生特性的小尾寒羊肠道正常菌群的分离鉴定 | 第34-36页 |
| 2.4.1 小尾寒羊肠道正常菌群的分离 | 第34页 |
| 2.4.2 革兰氏染色、镜检 | 第34页 |
| 2.4.3 生化鉴定 | 第34页 |
| 2.4.4 16SrDNA基因序列的测定与系统发育分析 | 第34-35页 |
| 2.4.5 生长曲线的测定 | 第35页 |
| 2.4.6 耐酸试验 | 第35页 |
| 2.4.7 耐胆盐试验 | 第35页 |
| 2.4.8 体外抑菌试验（牛津杯法） | 第35-36页 |
| 2.4.9 药敏试验 | 第36页 |
| 2.4.10 安全性试验 | 第36页 |
| 2.5 微生态制剂对家兔生长性能、免疫功能的影响及对腹泻羊的调理作用 | 第36-40页 |
| 2.5.1 微生态制剂的制备 | 第36页 |
| 2.5.2 兔瘟组织灭活苗的制备 | 第36-37页 |
| 2.5.3 动物试验 | 第37页 |
| 2.5.4 微生态制剂对家兔生长性能的影响 | 第37页 |
| 2.5.5 微生态制剂对家兔免疫功能的影响 | 第37-39页 |
| 2.5.5.1 血清抗体效价的检测 | 第37-38页 |
| 2.5.5.2 血清IFN-γ 浓度和溶菌酶含量的检测 | 第38-39页 |
| 2.5.6 微生态制剂对腹泻羊的调理作用 | 第39页 |
| 2.5.7 数据分析 | 第39-40页 |
| 3. 结果与分析 | 第40-62页 |
| 3.1 小尾寒羊肠道正常菌群群落分布的高通量测序分析 | 第40-51页 |
| 3.1.1 测序数据质量分析结果 | 第40页 |
| 3.1.2 样本菌群结构分析 | 第40-46页 |
| 3.1.3 小尾寒羊肠道菌群 α 多样性指数分析 | 第46-48页 |
| 3.1.4 小尾寒羊肠道菌群 β 多样性指数和样本聚类分析 | 第48-51页 |
| 3.2 具有益生特性的小尾寒羊肠道正常菌群的分离鉴定 | 第51-58页 |
| 3.2.1 分离菌菌落及镜检形态观察 | 第51-52页 |
| 3.2.2 分离菌生化鉴定结果 | 第52-53页 |
| 3.2.3 16S r DNA基因序列的测定与系统发育分析 | 第53-54页 |
| 3.2.4 生长曲线测定结果 | 第54页 |
| 3.2.5 耐酸试验结果 | 第54-55页 |
| 3.2.6 耐胆盐试验结果 | 第55-56页 |
| 3.2.7 体外抑菌试验结果 | 第56页 |
| 3.2.8 药敏试验结果 | 第56-57页 |
| 3.2.9 安全性试验结果 | 第57-58页 |
| 3.3 微生态制剂对家兔生长性能、免疫功能的影响及对腹泻羊的调理作用 | 第58-62页 |
| 3.3.1 微生态制剂对家兔生长性能的影响结果 | 第58页 |
| 3.3.2 血清抗体水平 | 第58-59页 |
| 3.3.3 血清IFN-γ 浓度 | 第59-60页 |
| 3.3.4 血清溶菌酶含量 | 第60-61页 |
| 3.3.5 微生态制剂对腹泻羊调理作用的结果 | 第61-62页 |
| 4. 讨论 | 第62-64页 |
| 5. 结论 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 攻读读硕士学位期间发表论文 | 第75-77页 |
| 个人简介 | 第77页 |
