摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
第1章 文献综述 | 第10-22页 |
1.1 MYB类转录因子的概述 | 第10-12页 |
1.1.1 MYB类转录因子的结构与分类 | 第10页 |
1.1.2 R2R3-MYB类转录因子对植物的次生代谢的调控 | 第10-12页 |
1.2 丹参研究概况 | 第12-16页 |
1.2.1 丹参概况 | 第12-13页 |
1.2.2 丹参的主要活性成分及药理作用 | 第13-14页 |
1.2.3 丹参酚酸类物质生物合成途径的研究概况 | 第14-15页 |
1.2.4 转录因子PAP1调控丹参酚酸类物质生物合成途径的调控 | 第15-16页 |
1.3 DNA与蛋白质相互作用的研究 | 第16-18页 |
1.3.1 DNA与蛋白质相互作用的研究方法 | 第16-17页 |
1.3.2 基于瞬时表达系统的DNA与蛋白质相互作用的研究 | 第17-18页 |
1.4 转录组测序 | 第18-20页 |
1.4.1 转录组的概念 | 第18页 |
1.4.2 测序技术的发展 | 第18-19页 |
1.4.3 药用植物转录组研究的意义 | 第19-20页 |
1.5 本研究的目的及意义 | 第20-22页 |
第2章 烟草中转录因子基因SmPAP1的转录自激活研究 | 第22-32页 |
2.1 实验材料、试剂及主要仪器 | 第22-24页 |
2.1.1 植物材料 | 第22页 |
2.1.2 菌株及载体 | 第22页 |
2.1.3 试剂与药品 | 第22-23页 |
2.1.4 实验仪器 | 第23-24页 |
2.2 实验方法 | 第24-28页 |
2.2.1 表达载体导入根癌农杆菌GV3101 | 第24-26页 |
2.2.2 农杆菌介导的烟草瞬时表达 | 第26-27页 |
2.2.3 GUS组织化学染色 | 第27页 |
2.2.4 GUS蛋白活性检测 | 第27-28页 |
2.3 实验结果与分析 | 第28-30页 |
2.3.1 烟草GUS组织化学染色结果 | 第28-29页 |
2.3.2 烟草GUS蛋白活性检测结果 | 第29-30页 |
2.4 讨论 | 第30-32页 |
第3章 丹参中转录因子基因SmPAP1的转录自激活研究 | 第32-44页 |
3.1 实验材料、试剂及主要仪器 | 第32-33页 |
3.1.1 植物材料 | 第32页 |
3.1.2 菌株 | 第32页 |
3.1.3 试剂与药品 | 第32-33页 |
3.1.4 实验仪器 | 第33页 |
3.2 实验方法 | 第33-37页 |
3.2.1 表达载体导入根癌农杆菌EHA105 | 第33页 |
3.2.2 PCR鉴定根癌农杆菌EHA105转化子 | 第33-34页 |
3.2.3 根癌农杆菌介导的叶盘转化法转化丹参 | 第34-35页 |
3.2.4 转基因丹参株系的DNA水平检测 | 第35-36页 |
3.2.5 转基因丹参株系的RNA水平检测 | 第36-37页 |
3.2.6 转基因丹参株系的GUS组织化学染色 | 第37页 |
3.2.7 转基因丹参株系的GUS蛋白活性检测 | 第37页 |
3.3 实验结果与分析 | 第37-41页 |
3.3.1 转基因丹参株系DNA水平的检测 | 第37-38页 |
3.3.2 转基因丹参株系的GUS基因表达水平检测 | 第38-40页 |
3.3.3 转基因丹参株系GUS组织化学染色结果 | 第40页 |
3.3.4 转基因丹参中GUS蛋白活性的定量检测 | 第40-41页 |
3.4 讨论 | 第41-44页 |
第4章 基于转录组测序的差异表达基因分析 | 第44-56页 |
4.1 植物材料 | 第44页 |
4.2 实验方法 | 第44-46页 |
4.2.1 总RNA的提取 | 第44页 |
4.2.2 RNA测序 | 第44页 |
4.2.3 数据分析 | 第44-45页 |
4.2.4 转录组的差异表达分析 | 第45页 |
4.2.5 差异基因的富集分析 | 第45页 |
4.2.6 丹参SmPAP1过表达植株中次生代谢相关基因的差异表达分析 | 第45-46页 |
4.2.7 差异基因的实时定量PCR验证 | 第46页 |
4.3 实验结果与分析 | 第46-53页 |
4.3.1 测序产量统计 | 第46-47页 |
4.3.2 差异表达基因的筛选 | 第47-48页 |
4.3.3 Gene Ontology功能显著性富集分析 | 第48-50页 |
4.3.4 KEGG Pathway显著性富集分析 | 第50-51页 |
4.3.5 丹参次生代谢相关的差异表达基因 | 第51-52页 |
4.3.6 部分差异基因的实时定量PCR验证 | 第52-53页 |
4.4 讨论 | 第53-56页 |
第5章 结论 | 第56-58页 |
参考文献 | 第58-70页 |
致谢 | 第70-72页 |
攻读硕士学位期间研究成果 | 第72页 |