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猪生长速度、背膘厚和肉质性状多个相关候选基因的效应分析及两个新候选基因的分离与功能研究

摘要第1-13页
ABSTRACT第13-16页
缩略词表(ABBREVIATIONS)第16-17页
第一章 文献综述第17-31页
 1 问题的提出第17页
 2 瘦肉型猪育种现状第17-19页
 3 标记辅助选择在育种中的应用第19-22页
   ·标记辅助选择的发展第19-20页
   ·标记辅助选择的特点第20-21页
   ·标记辅助选择的应用第21-22页
 4 全基因组选择的提出和应用第22-23页
 5 猪生长速度、背膘厚以及肉质三类性状QTLs及候选基因研究现状第23-26页
   ·猪生长性状QTLs及其候选基因第23-24页
   ·猪背膘厚性状QTLs及其候选基因第24-25页
   ·猪肉质性状QTLs及其候选基因第25-26页
 6 多个基因标记辅助选择在育种中的应用第26-29页
   ·多基因聚合的提出第26-27页
   ·多基因聚合的途径第27-28页
     ·传统杂交方法第27页
     ·多基因标记辅助选择第27页
     ·转基因技术第27-28页
   ·多基因聚合在育种中的应用第28-29页
   ·猪多基因聚合育种中存在的问题第29页
 7 本研究目的和意义第29-31页
第二章 试验群体生产性能测定第31-40页
 1 前言第31页
 2 材料与方法第31-33页
   ·试验试剂第31-32页
     ·试验仪器第31页
     ·试验试剂配制第31-32页
   ·供试群体生产性能测定第32-33页
     ·生长速度和背膘厚性状测定第32-33页
     ·肉质性状测定第33页
   ·数据整理与分析第33页
 3 结果第33-37页
   ·生长和背膘厚性状第33-35页
     ·生长速度和背膘厚性状表型值分布规律第33-35页
     ·生长速度与背膘厚性状间表型相关分析第35页
   ·肉质性状第35-37页
     ·肉质性状表型值分布规律第35-37页
     ·肉质性状表型相关分析第37页
 4 讨论第37-39页
   ·猪重要经济性状的测定第37-38页
   ·本试验群体表型值的分析第38-39页
 5 小结第39-40页
第三章 候选基因的筛选和多个基因标记效应分析第40-78页
 1 前言第40-46页
   ·生长性状候选基因第40-41页
     ·IGF2基因第40-41页
     ·JHDM1A基因第41页
   ·背膘厚性状候选基因第41-43页
     ·FTO基因第41-42页
     ·COPB1基因第42页
     ·ANK1基因第42-43页
     ·PSMC5基因第43页
     ·CMYA2基因第43页
   ·肉质性状候选基因第43-46页
     ·H-FABP基因第43-44页
     ·CAST基因第44页
     ·UCP3基因第44-45页
     ·MYOD1基因第45页
     ·MUSTN1基因第45-46页
     ·MASTR基因第46页
 2 材料与方法第46-49页
   ·引物设计第46-48页
   ·候选基因SNPs检测第48页
   ·候选基因性状关联分析第48-49页
     ·单基因性状关联分析第48页
     ·多个基因合并效应分析第48-49页
     ·基因互作效应分析第49页
 3 结果第49-72页
   ·候选基因SNPs的PCR-RFLP酶切分型第49-55页
     ·生长性状候选基因第49-50页
     ·背膘厚性状候选基因第50-53页
     ·肉质性状候选基因第53-55页
   ·第55-59页
     ·生长性状候选基因第55-56页
     ·背膘厚性状候选基因第56-58页
     ·肉质性状候选基因第58-59页
   ·多个基因合并效应分析第59-67页
     ·生长性状候选基因第59-60页
     ·背膘厚性状候选基因第60-66页
     ·肉质性状候选基因第66-67页
   ·基因互作效应分析第67-72页
     ·生长和背膘厚性状候选基因第67-70页
     ·肉质性状候选基因第70-72页
 4 讨论第72-76页
   ·用于基因间互作统计分析的方法第72页
   ·多基因效应分析的优点第72-73页
   ·目标性状候选基因的选择第73-76页
   ·分子遗传技术在育种中应用第76页
 5 小结第76-78页
第四章 猪MASTR和MUSTN1新候选基因的分离与功能研究第78-117页
 1. 前言第78-79页
 2 材料与方法第79-94页
   ·材料第79-84页
     ·样品第79-80页
     ·载体和菌株第80-81页
     ·试剂盒和工具酶第81-82页
     ·主要试剂及其配制第82-83页
     ·主要仪器设备第83页
     ·主要分子生物学软件第83-84页
     ·常用网站及主要数据库第84页
   ·方法第84-94页
     ·候选基因的分离第84-87页
     ·候选基因的染色体定位第87-88页
     ·候选基因的表达谱分析第88-90页
     ·候选基因启动子克隆与转录活性分析第90-93页
     ·MASTR基因功能初步研究第93-94页
 3 结果第94-110页
   ·猪MUSTNl和MASTR基因的分离第94-99页
     ·猪MUSTN1基因的分离及其序列分析第94-96页
     ·猪MASTR基因的分离及其序列分析第96-99页
   ·猪MUSTN1和MASTR基因的染色体定位结果第99-102页
     ·猪MUSTN1基因的染色体定位结果第99-101页
     ·猪MA4STR基因的染色体定位结果第101-102页
   ·猪MUSTN1和MASTR基因表达谱分析结果第102-103页
     ·猪MUSTN1基因的组织表达谱结果第102页
     ·猪MASTR基因的组织表达谱结果第102-103页
   ·猪MUSTN1和MASTR基因多态性检测及其性状关联分析第103-106页
     ·猪MUSTN1基因的多态性检测及其性状关联分析第103-104页
     ·猪MASTR基因的多态性检测及其性状关联分析第104-106页
   ·猪MASTR基因的启动子克隆与转录活性分析第106-108页
   ·小鼠MASTR基因超表达后对C2C12细胞的影响第108-109页
     ·小鼠MASTR基因超表达后对C2C12细胞周期检测第108-109页
     ·小鼠MASTR基因超表达后肌肉生长相关基因检测第109页
   ·小鼠MASTR-siRNA转染后肌肉生长相关基因的影响第109-110页
 4 讨论第110-115页
   ·关于实验方法的讨论第110-112页
     ·基因的cDNA序列的克隆第110页
     ·基因选择性剪切的意义第110-111页
     ·RNAi在基因功能研究中的应用第111-112页
   ·关于本实验结果的讨论第112-115页
     ·猪MASTR基因选择性剪切及其结构功能预测第112-113页
     ·猪MUSTN1和MASTR基因多态位点与经济性状的关联分析第113-114页
     ·MYOD1转录因子对猪MASTR基因的转录激活作用第114-115页
     ·小鼠MASTR基因对C2C12细胞增殖的影响第115页
 5 小结第115-117页
本研究小结第117-119页
本研究特色与创新点第119-120页
本研究存在不足之处及值得进一步研究问题第120-121页
参考文献第121-134页
附录1 猪MUSTN1基因基因组序列第134-135页
附录2 猪MASTR基因CDNA序列第135-138页
在读期间撰写论文题录第138-139页
致谢第139页

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