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真核生物中人类疾病易感基因ELAC2和DJ-1的生物信息学分析

符号说明第1-5页
摘要第5-6页
Abstract第6-10页
第1章 tRNase Z的研究综述第10-15页
   ·tRNase Z的结构特点和分类第10-12页
   ·tRNase Z序列定位第12-13页
   ·tRNase Z的功能第13页
   ·tRNase Z与疾病研究第13-14页
   ·课题内容和展望第14-15页
第2章 植物ELAC2同源蛋白生物信息学分析第15-31页
   ·实验方法第15-16页
     ·植物ELAC2同源蛋白的收集和鉴别数据收集第15页
     ·植物ELAC2同源蛋白的氨基酸序列分析第15-16页
     ·植物tRNase Z蛋白的亚细胞定位预测第16页
     ·植物ELAC2同源蛋白系统发育树的构建第16页
   ·实验结果分析第16-29页
     ·植物ELAC2同源蛋白多样分析第16-19页
     ·植物ELAC2同源蛋白的氨基酸序列分析第19-25页
     ·开花植物中tRNase Z亚细胞定位信号的预测第25-27页
     ·植物中tRNase Z分子进化树分析第27-29页
   ·实验讨论第29-31页
     ·植物中的tRNase Z的多态性第29页
     ·植物中的tRNase Z-like蛋白第29-30页
     ·植物中的tRNase Z小结第30-31页
第3章 后生动物ELAC2同源蛋白生物信息学分析第31-56页
   ·材料与方法第31-32页
     ·后生动物ELAC2同源蛋白的收集和鉴别数据收集第31-32页
     ·后生动物ELAC2同源蛋白的氨基酸序列分析第32页
     ·后生动物tRNase Z基因内含子数目预测和编码区GC含量分析第32页
     ·后生动物tRNase Z蛋白的亚细胞定位预测第32页
     ·后生动物ELAC2同源蛋白系统发育树的构建和dN/dS分析第32页
   ·实验结果分析第32-54页
     ·后生动物ELAC2同源蛋白多态性分析第32-36页
     ·哺乳动物和隐杆线虫的变异剪切体第36-40页
     ·后生动物ELAC2同源蛋白的氨基酸序列分析第40-46页
     ·后生动物tRNase Z基因的内含子多态性分析第46-48页
     ·后生动物tRNase Z蛋白的亚细胞定位预测第48-51页
     ·tRNase Z进化分析及Ka/Ks分析第51-54页
   ·实验讨论第54-56页
     ·后生动物tRNase Z的起源和进化第54页
     ·后生动物中tRNase Z的功能第54-56页
第4章 DJ-1蛋白的研究进展第56-61页
   ·DJ-1蛋白结构特点第56-57页
   ·DJ-1功能第57-58页
     ·DJ-1在癌症的诱发扮演重要的角色第57页
     ·DJ-1蛋白能够正调控雄激素受体及受精过程第57页
     ·DJ-1具有氧化还原依赖的分子伴侣功能第57页
     ·DJ-1对氧自由基的清除作用第57-58页
   ·裂殖酵母GLO3的研究进展第58页
   ·模式生物—粟酒裂殖酵母第58-60页
   ·课题内容和展望第60-61页
第5章 真菌中HsDJ-1和EcHsp31同源蛋白生物信息学分析第61-72页
   ·材料与方法第61-62页
     ·真菌中HsDJ-1同源蛋白的收集和鉴别第61页
     ·真菌中DJ-1蛋白的氨基酸序列比对和相似性分析第61-62页
     ·真菌中EcHsp31同源蛋白的收集和鉴别第62页
     ·真菌中Hsp31蛋白的氨基酸序列比对和相似性分析第62页
     ·真菌中DJ-1基因和Hsp31基因的系统发育树的构建第62页
   ·实验结果分析第62-69页
     ·真菌中DJ-1基因的分布和蛋白序列分析第62-65页
     ·真菌中Hsp31基因分布和氨基酸序列分析第65-69页
     ·真菌中DJ-1基因和Hsp31基因进化关系分析第69页
   ·实验讨论第69-72页
第6章 HPLC法检测SpDJ-1和ScHsp31催化MG的产物第72-81页
   ·实验材料第72-73页
     ·实验菌株、质粒和培养基第72页
     ·主要试剂及来源第72-73页
     ·DNA引物合成和DNA测序服务第73页
   ·实验方法第73-78页
     ·ScHsp31和SpDJ-1表达菌株的构建第73-77页
     ·ScHsp31蛋白和SpDJ-1蛋白的提取纯化第77-78页
     ·HPLC法检测ScHsp31蛋白和SpDJ-1蛋白催化丙酮醛的产物第78页
   ·实验结果分析第78-79页
   ·实验讨论第79-81页
附录第81-95页
参考文献第95-103页
攻读硕士学位期间发表的论文和获得奖励第103-104页
致谢第104-105页

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