| 摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-13页 |
| 缩略词 | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-42页 |
| 1 水稻株高的研究概况 | 第14-20页 |
| ·水稻矮化突变体的遗传研究进展 | 第14-15页 |
| ·水稻矮化机制的研究进展 | 第15-19页 |
| ·水稻显性矮秆突变体的研究进展 | 第19-20页 |
| 2 植物表观遗传调控的分子机制 | 第20-33页 |
| ·表观遗传学的定义和研究内容 | 第20页 |
| ·DNA甲基化 | 第20-26页 |
| ·组蛋白修饰 | 第26-30页 |
| ·表观遗传学的研究方法 | 第30-32页 |
| ·表观等位基因的克隆 | 第32-33页 |
| 3 PcG蛋白介导的基因沉默与植物发育 | 第33-40页 |
| ·PcG蛋白复合体的组成和分类 | 第34-35页 |
| ·PcG蛋白与TRX蛋白的相互拮抗 | 第35-36页 |
| ·PcG蛋白介导的H3K27me3修饰的建立、维持以及识别 | 第36-38页 |
| ·PcG蛋白对植物发育的调控 | 第38-40页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第40-42页 |
| 第二章 水稻Epi-df突变体的表型及遗传分析 | 第42-50页 |
| 摘要 | 第42页 |
| 1 材料与方法 | 第42-43页 |
| ·实验材料与田间种植 | 第42-43页 |
| ·Epi-df降秆能力调查 | 第43页 |
| ·Epi-df花器官突变、花粉育性以及结实率调查 | 第43页 |
| ·Epi-df遗传规律和回复突变调查 | 第43页 |
| 2 结果与分析 | 第43-48页 |
| ·Epi-df表型分析 | 第43-44页 |
| ·Epi-df花器官变异及育性分析 | 第44-48页 |
| 3 讨论 | 第48-50页 |
| ·Epi-df具有潜在的育种利用价值 | 第48-49页 |
| ·Epi-df遗传稳定但存在低频率的回复突变 | 第49-50页 |
| 第三章 水稻显性矮秆基因Epi-df的图位克隆及转基因验证 | 第50-62页 |
| 摘要 | 第50页 |
| 1 材料与方法 | 第50-55页 |
| ·实验材料与田间种植 | 第50-51页 |
| ·DNA提取 | 第51页 |
| ·PCR分析 | 第51-52页 |
| ·分子标记设计 | 第52页 |
| ·基因定位 | 第52-53页 |
| ·候选基因预测和测序 | 第53页 |
| ·RNA提取、RT-PCR及Real-time PCR | 第53页 |
| ·转基因互补载体的构建 | 第53-54页 |
| ·转基因过表达载体的构建 | 第54页 |
| ·农秆菌介导的遗传转化 | 第54页 |
| ·转基因阳性植株的鉴定 | 第54-55页 |
| 2 结果与分析 | 第55-60页 |
| ·初定位和精细定位 | 第55-56页 |
| ·候选基因分析 | 第56-57页 |
| ·候选基因的测序和表达分析 | 第57-58页 |
| ·转基因验证 | 第58-60页 |
| 3 讨论 | 第60-62页 |
| ·Epi-df突变表型来自FIE1基因的异位表达 | 第60-61页 |
| ·FIE1异位表达可能是由表观突变导致的 | 第61-62页 |
| 第四章 水稻FIE1基因的表观遗传修饰及功能分析 | 第62-86页 |
| 摘要 | 第62-63页 |
| 1 材料与方法 | 第63-66页 |
| ·DNA甲基化分析 | 第63-64页 |
| ·亚硫酸盐法DNA甲基化测序 | 第64页 |
| ·染色质免疫共沉淀(ChIP) | 第64页 |
| ·生物信息学分析 | 第64页 |
| ·胚乳RNA提取、RT-PCR及Real-time PCR | 第64-65页 |
| ·印记分析 | 第65页 |
| ·酵母双杂交分析 | 第65-66页 |
| ·Microarray分析 | 第66页 |
| 2 结果与分析 | 第66-82页 |
| ·FIE1基因DNA甲基化分析 | 第66-71页 |
| ·FIE1基因位点组蛋白H3K9me2和H3K4me3分析 | 第71-72页 |
| ·FIE1基因结构及蛋白同源分析 | 第72-75页 |
| ·FIE1基因表达模式分析 | 第75-77页 |
| ·FIE1基因印记分析 | 第77-79页 |
| ·FIE1蛋白与水稻E(z)类蛋白互作 | 第79-80页 |
| ·FIE1基因异位表达对靶基因H3K27me3修饰的影响 | 第80-82页 |
| 3 讨论 | 第82-86页 |
| ·Epi-df是水稻中发现的第一个DNA去甲基化表观突变体 | 第82-83页 |
| ·FIE1的胚乳特异性表达和印记模式受DNA甲基化调控 | 第83-84页 |
| ·FIE1蛋白参与PcG蛋白复合体PRC2介导的转录抑制 | 第84-85页 |
| ·水稻中PRC2介导的H3K27me3修饰途径受H3K9me2的调控 | 第85-86页 |
| 第五章 全文讨论与结论 | 第86-90页 |
| 1 讨论 | 第86-87页 |
| ·Epi-df具有自身的表观遗传学特征 | 第86页 |
| ·表观遗传修饰对水稻两个FIE基因的功能分化起重要作用 | 第86-87页 |
| ·水稻H3K27me3的正常功能依赖于H3K9me2对FIE1的转录抑制 | 第87页 |
| 2 结论 | 第87-89页 |
| ·Epi-df是一个降秆能力较强的显性矮秆突变体 | 第87页 |
| ·Epi-df的表型是由FIE1基因的表观遗传突变导致的 | 第87-88页 |
| ·FIE1的表达模式和印记特征受表观遗传修饰调控 | 第88-89页 |
| ·FIE1参与PRC2介导的基因沉默 | 第89页 |
| 3 本文创新之处 | 第89-90页 |
| 参考文献 | 第90-108页 |
| 附录 | 第108-120页 |
| 在读期间发表的论文 | 第120-122页 |
| 致谢 | 第122页 |
