鼠疫耶尔森氏菌与假结核耶尔森氏菌比较基因组学研究
| 中文摘要 | 第1-8页 |
| 英文摘要 | 第8-11页 |
| 引言 | 第11-16页 |
| 第一章 材料与方法 | 第16-36页 |
| 一.实验材料 | 第16-21页 |
| (一) 接头和引物序列 | 第16页 |
| (二) 工具酶和DNA分子标准 | 第16-17页 |
| (三) 试剂盒 | 第17页 |
| (四) 主要试剂 | 第17页 |
| (五) 主要仪器 | 第17-18页 |
| (六) 常用试剂配制 | 第18-19页 |
| (七) 实验菌株 | 第19-21页 |
| 二.实验方法 | 第21-36页 |
| (一) 基因组DNA的提取 | 第21页 |
| (二) 消减杂交实验 | 第21-28页 |
| 1.双链DNA的RsaⅠ酶切 | 第21-22页 |
| 2.酶切效率分析实验 | 第22页 |
| 3.酶切片段的纯化 | 第22页 |
| 4.接头连接实验 | 第22-23页 |
| 5.接头连接效率分析 | 第23-24页 |
| 6.第一次杂交反应 | 第24-25页 |
| 7.第二次杂交反应 | 第25-26页 |
| 8.第一次PCR反应 | 第26页 |
| 9.第二次PCR反应 | 第26-27页 |
| 10.消减效率的PCR分析 | 第27-28页 |
| 11.PCR产物纯化 | 第28页 |
| (三) 抑制消减杂交文库的构建 | 第28-31页 |
| 1.抑制消减杂交基因片段的克隆 | 第28-29页 |
| 2.感受态菌的制备 | 第29页 |
| 3.转化实验 | 第29页 |
| 4.PCR鉴定阳性克隆 | 第29-30页 |
| 5.第二次筛选阳性克隆 | 第30页 |
| 6.细菌的96孔板培养 | 第30页 |
| 7.提取质粒 | 第30-31页 |
| 8.质粒的测序 | 第31页 |
| (四) 芯片的制备 | 第31-36页 |
| 1.PCR扩增差异片段 | 第31-32页 |
| 2.差异片段的纯化 | 第32页 |
| 3.芯片阳性对照的PCR扩增 | 第32-33页 |
| 4.芯片制备 | 第33页 |
| 5.芯片杂交 | 第33-35页 |
| 6.芯片扫描 | 第35页 |
| 7.数据分析 | 第35-36页 |
| 第二章 实验结果 | 第36-46页 |
| 一.RsaⅠ酶切结果分析 | 第36-37页 |
| 二.接头连接效率分析结果 | 第37-38页 |
| 三.消减杂交结果分析 | 第38页 |
| 四.序列测定和同源性比较分析结果 | 第38-39页 |
| 五.片段序列 | 第39页 |
| 六.片段在GenBank中的登入号 | 第39-40页 |
| 七.特异片段功能注释 | 第40-44页 |
| 八.芯片杂交结果 | 第44-46页 |
| 第三章 讨论 | 第46-56页 |
| 结论 | 第56-60页 |
| 参考文献 | 第60-63页 |
| 附录 | 第63-94页 |
| 文献综述 | 第94-114页 |
| 发表文章 | 第114-115页 |
| 致谢 | 第115页 |
