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GPCR配体药效团模拟及其数据库构建研究

摘要第1-7页
Abstract第7-12页
第1章 绪论第12-32页
   ·G蛋白偶联受体第12-14页
     ·GPCR概述第12页
     ·G蛋白偶联受体介导信号传导路径第12-13页
     ·GPCR的三维结构第13-14页
   ·计算机辅助药物设计第14-26页
     ·药效基团模拟技术第15-17页
     ·蛋白质同源模建技术第17-20页
     ·分子对接技术第20-23页
     ·虚拟筛选技术第23-26页
     ·小结第26页
   ·GPCR配体设计第26-30页
     ·基于受体的GPCR配体设计第27-28页
     ·基于配体的GPCR新化合物设计第28-29页
     ·小结第29-30页
   ·论文总体安排第30-32页
第2章 腺苷受体拮抗剂药效团构建及虚拟筛选研究第32-66页
   ·腺苷受体概述第32-36页
     ·A_1腺苷受体及其拮抗剂第33页
     ·A_(2A)腺苷受体及其拮抗剂第33-35页
     ·A_(2B)腺苷受体及其拮抗剂第35页
     ·A_3腺苷受体及其拮抗剂第35页
     ·小结第35-36页
   ·材料与方法第36-42页
     ·生物活性数据和训练集的选择第36-37页
     ·药效团模型的构建第37-42页
     ·药效团模型验证第42页
     ·药效团与晶体结构比对第42页
   ·实验结果与讨论第42-65页
     ·A_1受体拮抗剂药效团的构建及验证第42-46页
     ·A_(2A)受体拮抗剂药效团的构建及验证第46-52页
     ·A_(2B)受体拮抗剂药效团的构建及验证第52-55页
     ·A_3受体拮抗剂药效团的构建及验证第55-58页
     ·腺苷A_(2A)受体药效团模型与晶体结构的比对分析第58-60页
     ·与先前发表的腺苷受体配体药效团比较分析第60-61页
     ·腺苷受体各亚型药效团模型比较分析第61-62页
     ·基于腺苷A_1、A_(2A)、A_(2B)、A_3受体药效团模型的模拟虚拟筛选研究第62-65页
   ·本章小结第65-66页
第3章 阿片受体拮抗剂药效团构建及受体-拮抗剂相互作用研究第66-86页
   ·引言第66-70页
     ·阿片受体结构与功能第67-68页
     ·阿片类镇痛药物第68-69页
     ·药效团模建技术第69-70页
   ·材料与方法第70-75页
     ·数据来源第70页
     ·药效团模型的构建第70-73页
     ·阿片受体结构模建第73-74页
     ·配体的分子对接第74-75页
   ·实验结果与讨论第75-84页
     ·阿片受体拮抗剂药效团模型的构建第75-78页
     ·药效团模型的测试集验证第78页
     ·药效团模型与基于结构的靶标模建的一致性第78-83页
     ·阿片受体各亚型药效团模型的比对分析第83-84页
     ·阿片受体药效团模型的应用第84页
   ·本章小结第84-86页
第4章 GPCR配体药效团数据库的构建及基于药效团的反向筛选探讨第86-102页
   ·引言第86-87页
   ·材料与方法第87-88页
     ·数据来源及规范性第87页
     ·数据库表的设计第87-88页
   ·药效团模型可靠性验证第88-89页
     ·基于开发软件的验证第88页
     ·测试集验证第88-89页
     ·基于富集率的测试第89页
     ·基于受体结构的验证第89页
   ·实验结果与讨论第89-95页
     ·药效团模型数据库分析第89-91页
     ·收录药效团模型的验证第91-95页
   ·GPCR配体药效团数据库应用第95-97页
     ·先导化合物的发现第95-96页
     ·配体选择性的研究第96-97页
     ·反向筛选第97页
   ·基于药效团数据库的反向筛选探讨第97-100页
   ·结论第100-102页
第5章 全文总结第102-104页
参考文献第104-127页
攻读博士期间发表的论文第127-128页
致谢第128页

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