| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 目录 | 第9-12页 |
| 第1章 综述组蛋白分子伴侣的研究背景 | 第12-45页 |
| ·引言 | 第12-15页 |
| ·核小体的结构 | 第15-20页 |
| ·组蛋白分子伴侣的分类 | 第20-22页 |
| ·几个典型的组蛋白分子伴侣 | 第22-35页 |
| ·组蛋白分子伴侣Nucleoplasmin(NPM2) | 第22-23页 |
| ·组蛋白分子伴侣N1/N2 | 第23-24页 |
| ·组蛋白分子伴侣Nap1 | 第24-26页 |
| ·组蛋白分子伴侣CAF-1 | 第26-28页 |
| ·组蛋白分子伴侣HIRA | 第28-30页 |
| ·组蛋白分子伴侣Asf1 | 第30-32页 |
| ·组蛋白分子伴侣FACT | 第32-35页 |
| ·组蛋白分子伴侣网络 | 第35-39页 |
| ·组蛋白分子伴侣和转录 | 第35-37页 |
| ·组蛋白分子伴侣和复制 | 第37-39页 |
| ·总结 | 第39-40页 |
| 参考文献 | 第40-45页 |
| 第2章 组蛋白分子伴侣Rtt106的结构研究 | 第45-116页 |
| ·Rtt106的功能介绍 | 第45-54页 |
| ·Rtt106是组蛋白H3-H4的分子伴侣 | 第45-51页 |
| ·Rtt106和染色质沉默(Silencing) | 第51-54页 |
| ·实验材料和实验方法 | 第54-83页 |
| ·文献调研 | 第54页 |
| ·信息学调研 | 第54页 |
| ·引物设计 | 第54-55页 |
| ·PCR体系 | 第55-56页 |
| ·PCR回收产物和载体酶切 | 第56页 |
| ·连接反应 | 第56-57页 |
| ·转化反应和初步表达 | 第57页 |
| ·Rtt106突变体的构建 | 第57-59页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第59页 |
| ·Rtt106的表达 | 第59-61页 |
| ·Rtt106的亲和纯化 | 第61-63页 |
| ·TEV蛋白酶的纯化 | 第63-64页 |
| ·Rtt106分子筛纯化 | 第64-65页 |
| ·Rtt106阴离子交换纯化 | 第65页 |
| ·Rtt106长晶体前准备 | 第65-66页 |
| ·Rtt106晶体初筛和优化 | 第66-68页 |
| ·Rtt106相位的获得 | 第68-70页 |
| ·酵母组蛋白的构建,表达和纯化 | 第70-75页 |
| ·Rtt106和组蛋白的pull-down实验 | 第75-76页 |
| ·Rtt106和DNA的相互作用 | 第76-79页 |
| ·Rtt106的圆二色谱(CD谱) | 第79-80页 |
| ·Rtt106和组蛋白的Native电泳 | 第80页 |
| ·Rtt106和组蛋白的NMR或ITC实验 | 第80-83页 |
| ·实验结果和讨论 | 第83-110页 |
| ·Rtt106结构研究片断的选择 | 第83-90页 |
| ·Rtt106蛋白的表达和纯化 | 第90-92页 |
| ·Rtt106-M结构解析和数据统计 | 第92-94页 |
| ·Rtt106-M结构分析 | 第94-99页 |
| ·Rtt106-M和DNA的相互作用 | 第99-101页 |
| ·Rtt106-M和H3-H4的相互作用 | 第101-103页 |
| ·Rtt106-M和H3K56突变体的结合实验 | 第103页 |
| ·Rtt106-FL和组蛋白结合实验 | 第103-104页 |
| ·Pob3-M也可以结合dsDNA | 第104-105页 |
| ·Rtt106对端粒异染色质沉默的影响 | 第105-107页 |
| ·酵母组蛋白四聚体和八聚体的构建 | 第107-110页 |
| ·总结 | 第110-115页 |
| 参考文献 | 第115-116页 |
| 第3章 Brd2蛋白第二个Bromodomain的结构研究 | 第116-147页 |
| ·组蛋白的共价修饰 | 第116-122页 |
| ·目前发现的组蛋白修饰及其作用模型 | 第116-117页 |
| ·组蛋白的乙酰化修饰和Bromodomain | 第117-122页 |
| ·Brd2蛋白的功能 | 第122-131页 |
| ·Brd2是新的transcriptional regulator | 第122-124页 |
| ·Brd2的Bromodomains | 第124-127页 |
| ·Brd2是histone chaperone | 第127-131页 |
| ·实验方法、结果和讨论 | 第131-143页 |
| ·Brd2 BD2的表达和纯化 | 第131-133页 |
| ·Brd2 BD2的核磁实验 | 第133页 |
| ·Brd2 BD2的结构分析 | 第133-137页 |
| ·Brd2 BD2和乙酰化H4的相互作用 | 第137-141页 |
| ·Brd2 BD2和乙酰化H4的复合物结构 | 第141-143页 |
| ·总结 | 第143-145页 |
| 参考文献 | 第145-147页 |
| 附录1 酿酒酵母的组蛋白序列以及相关信息 | 第147-148页 |
| 附录2 人的组蛋白H1十一种不同亚型 | 第148页 |
| 附录3 NPM家族蛋白相关信息 | 第148-149页 |
| 附录4 Nap1家族蛋白相关信息 | 第149-150页 |
| 附录5 Asf1蛋白序列比对 | 第150-151页 |
| 附录6 Rtt106十三个同源物的蛋白序列 | 第151-153页 |
| 附录7 Rtt106-M的Ramachandran图 | 第153-156页 |
| 附录8 FPA实验荧光探针及计算的Kd值 | 第156-157页 |
| 附录9 酵母菌株 | 第157-159页 |
| 附录10 Brd2 BD2的Ramachandran图 | 第159-160页 |
| 参考文献 | 第160-161页 |
| 在读期间发表的学术论文与取得的研究成果 | 第161-163页 |
| 致谢 | 第163-164页 |
