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金黄色葡萄球菌可选择性σ因子σ~H调控原噬菌体的整合与切出

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-10页
第1章 绪论第10-28页
   ·金黄色葡萄球菌第10-15页
     ·金黄色葡萄球菌的分类及基本特征第10页
     ·金黄色葡萄球菌的致病性第10-11页
     ·金黄色葡萄球菌的主要致病因子第11-13页
     ·耐氧甲西林金黄色葡萄球菌第13页
     ·金黄色葡萄球菌的基因组测序第13-14页
     ·金黄色葡萄球菌中的σ因子第14-15页
   ·温和噬菌体的生活周期第15-22页
     ·噬菌体策略第15-16页
     ·噬菌体的裂解周期受级联反应控制第16-17页
     ·温和噬菌体的裂解周期第17-18页
     ·温和噬菌体的溶源化过程第18-20页
     ·噬菌体在宿主染色体中插入和切出的模型第20-22页
   ·金黄色葡萄球菌中的原噬菌体第22-28页
     ·可动遗传因子第22-23页
     ·原噬菌体第23-24页
     ·温和噬菌体的水平转移机制第24-25页
     ·原噬菌体与宿主的协同进化第25-28页
第2章 实验结果第28-48页
   ·金黄色葡萄球菌原噬菌体int基因的5’非转录区有一个启动子第28-33页
     ·金黄色葡萄球菌原噬菌体int基因的上游存在着一个高度保守的区域第28-32页
     ·金黄色葡萄球菌元噬菌体int基因转录结构分析第32-33页
   ·金黄色葡萄球菌σ因子σ~H识别int基因前的启动子并起始转录第33-44页
     ·金黄色葡萄球菌的σ~H在进化上有别与其它厚壁菌门的成员第34页
     ·SigH基因的缺失引起了原噬菌体int基因mRNA水平的下降第34-35页
     ·Northern实验证明sigH敲除株中缺少了最短的一条int基因转录产物第35-38页
     ·σ~H蛋白在体内和体外都可以识别int基因的启动子并起始转录第38-40页
     ·相对于野生型,SigH基因缺失株中的原噬菌体游离态有所增加第40-44页
   ·SigH基因的缺失改变了金黄色葡萄球菌的自发裂解率和溶源率第44-48页
     ·SigH基因的缺失提高了金黄色葡萄球菌的自发裂解率第44-45页
     ·SigH基因的缺失降低了金黄色葡萄球菌的溶源率第45-48页
第3章 结果讨论第48-52页
第4章 材料与方法第52-78页
   ·菌株及培养第52-53页
   ·质粒的构建第53-62页
     ·引物的设计和PCR第54-58页
     ·大肠杆菌CaCl_2感受态细胞的制备第58-59页
     ·酶切反应第59-60页
     ·线形质粒DNA的去磷化第60页
     ·琼脂糖凝胶电泳及DNA片断的回收第60-61页
     ·DNA的连接反应第61页
     ·大肠杆菌质粒的热激转化第61页
     ·碱裂解法快速小量质粒抽提第61-62页
   ·大肠杆菌系统表达中蛋白质的表达和纯化第62-64页
     ·大肠杆菌表达系统中的蛋白诱导表达第62页
     ·SDS聚丙烯酰胺凝胶(SDS-PAGE)蛋白电泳第62-63页
     ·Ni-NTA树脂纯化带有6-histidin Tag的蛋白第63-64页
   ·同源重组法构建金黄色葡萄球菌的基因缺失株第64-66页
     ·金黄色葡萄球菌电转感受态制备方法第64页
     ·金黄色葡萄球菌的电转化法第64-65页
     ·金黄色葡萄球菌的质粒抽提第65页
     ·用pMAD质粒对金黄色葡萄球菌基因组进行基因敲除第65-66页
   ·基因组DNA及全RNA的抽提第66-68页
     ·金黄色葡萄球菌基因组DNA的抽提第66-67页
     ·金黄色葡萄球菌的总RNA抽提(Trizol法)第67-68页
     ·用DNA酶消化提取RNA中残余的DNA污染第68页
   ·反转录第68-69页
   ·荧光实时定量PCR第69-70页
   ·体外转录第70-71页
   ·Northern印迹第71-72页
   ·引物延伸实验第72-73页
   ·大肠杆菌体内σ~H-pint识别实验第73-74页
     ·在大肠杆菌基因组上插入pint-lacZ融合片断第73页
     ·β-内酰胺酶酶活的测定第73-74页
   ·噬菌体的紫外诱导及病毒粒子的滴度测定第74-75页
   ·溶源菌株的构建第75-76页
     ·丝裂霉素C诱导溶源菌裂解第75页
     ·用PEG沉淀噬菌体颗粒第75页
     ·构建溶源菌株第75-76页
   ·溶源率测定实验第76-78页
参考文献第78-88页
附录1 缩略词表第88-89页
附录2 序列号表第89-90页
致谢第90-92页
攻读学位期间发表的学术论文第92-93页

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