生物序列分析算法的研究及其应用
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-13页 |
| 第1章 绪论 | 第13-21页 |
| ·生物信息学 | 第13-14页 |
| ·本文的研究内容 | 第14-19页 |
| ·群体数据集单体分型 | 第14-16页 |
| ·家系数据集单体分型 | 第16-17页 |
| ·生物序列模体发现 | 第17-18页 |
| ·蛋白质二级结构预测 | 第18-19页 |
| ·论文组织 | 第19-21页 |
| 第2章 分子生物学背景 | 第21-35页 |
| ·基因、DNA与蛋白质 | 第21-24页 |
| ·单体型 | 第24-29页 |
| ·变异与SNP位点 | 第24-25页 |
| ·单体型与基因型 | 第25-27页 |
| ·重组 | 第27-28页 |
| ·单体型块结构 | 第28-29页 |
| ·序列模体 | 第29-31页 |
| ·转录因子 | 第29-30页 |
| ·模体 | 第30-31页 |
| ·蛋白质结构 | 第31-34页 |
| ·蛋白质 | 第31-33页 |
| ·蛋白质的结构层次 | 第33-34页 |
| ·本章小结 | 第34-35页 |
| 第3章 群体数据集单体分型 | 第35-53页 |
| ·问题定义 | 第35-36页 |
| ·已有的工作 | 第36-41页 |
| ·组合优化算法 | 第36-39页 |
| ·频率估计算法 | 第39-41页 |
| ·基于分块的单体型频率估计算法 | 第41-51页 |
| ·基于动态规划的分块算法 | 第43-45页 |
| ·基于贪心的合并算法 | 第45-46页 |
| ·实验比较 | 第46-51页 |
| ·结论 | 第51页 |
| ·本章小结 | 第51-53页 |
| 第4章 家系数据集单体分型 | 第53-65页 |
| ·问题定义 | 第53-54页 |
| ·已有的工作 | 第54-58页 |
| ·最少重组单体分型 | 第55-56页 |
| ·异或基因型 | 第56-58页 |
| ·基于异或基因型的家系单体分型 | 第58-64页 |
| ·异或基因型推导算法 | 第58-61页 |
| ·实验比较 | 第61-64页 |
| ·结论 | 第64页 |
| ·本章小结 | 第64-65页 |
| 第5章 生物序列模体发现 | 第65-77页 |
| ·问题定义 | 第65-66页 |
| ·已有的工作 | 第66-67页 |
| ·CVOTNG算法 | 第67-76页 |
| ·基于相容模体的剪枝算法 | 第68-70页 |
| ·基于投票的哈希算法 | 第70-71页 |
| ·扩展的投票算法 | 第71-73页 |
| ·实验比较 | 第73-76页 |
| ·结论 | 第76页 |
| ·本章小结 | 第76-77页 |
| 第6章 蛋白质二级结构预测 | 第77-91页 |
| ·问题定义 | 第77页 |
| ·已有的工作 | 第77-78页 |
| ·基于化学位移的二级结构预测算法 | 第78-88页 |
| ·数据收集 | 第79页 |
| ·KNN预测 | 第79-81页 |
| ·结果平滑 | 第81-82页 |
| ·实验比较 | 第82-88页 |
| ·结论 | 第88页 |
| ·本章小结 | 第88-91页 |
| 第7章 总结 | 第91-95页 |
| ·本文工作 | 第91-92页 |
| ·本文贡献与创新之处 | 第92-93页 |
| ·进一步工作 | 第93-95页 |
| 参考文献 | 第95-102页 |
| 附录1 插图索引 | 第102-103页 |
| 附录2 表格索引 | 第103-105页 |
| 致谢 | 第105-107页 |
| 攻读学位期间参加的科研项目 | 第107-108页 |
| 在读期间发表的学术论文 | 第108-109页 |
