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FASTQ文件无损压缩算法研究

摘要第5-6页
ABSTRACT第6-7页
符号对照表第10-11页
缩略语对照表第11-14页
第一章 绪论第14-20页
    1.1 研究背景及现状第14-17页
    1.2 论文结构第17-20页
第二章 基础理论第20-34页
    2.1 FASTQ格式文件第20-21页
    2.2 无损压缩编码第21-27页
        2.2.1 小整数编码第22-23页
        2.2.2 比特串压缩编码第23-24页
        2.2.3 字符集编码第24-27页
    2.3 BWT变换与小波树第27-34页
        2.3.1 BWT变换第27-31页
        2.3.2 小波树第31-34页
第三章 FASTQ文件无损压缩算法FTComp第34-48页
    3.1 FASTQ文件预处理第35-41页
        3.1.1 标识符序列垂直编码第35-38页
        3.1.2 DNA序列分组编码第38-39页
        3.1.3 质量分数序列游程编码第39-41页
    3.2 HyBWT无损压缩算法第41-48页
        3.2.1 压缩过程第41-45页
        3.2.2 解压缩过程第45-48页
第四章 实验结果与分析第48-60页
    4.1 实验环境及数据源第48页
    4.2 参数对FTComp算法压缩比的影响第48-51页
    4.3 算法性能对比第51-60页
第五章 总结与展望第60-62页
参考文献第62-66页
致谢第66-68页
作者简介第68-69页

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