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沙田柚配子体自交不亲和花柱基因数字表达谱的分析

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第1章 前言第9-16页
    1.1 植物自交不亲和性概述第9-15页
        1.1.1 植物配子体自交不亲和性的研究进展第9-14页
        1.1.2 孢子体自交不亲和机制的研究进展第14-15页
    1.2 沙田柚自交不亲和研究进展第15页
    1.3 数字基因表达谱技术与应用第15-16页
    1.4 本研究目的及意义第16页
第2章 实验材料和方法第16-27页
    2.1 实验材料及其处理第16-17页
        2.1.1 实验材料的准备第16页
        2.1.2 主要的生化试剂及仪器第16-17页
    2.2 沙田柚花柱总RNA的提取第17页
    2.3 DGE文库的构建及测序第17-18页
    2.4 DGE原始数据的基本处理第18-21页
        2.4.1 测序评估第18-19页
        2.4.2 差异表达基因第19-20页
        2.4.3 差异表达基因的GO功能注释及代谢途径分析第20-21页
    2.5 RNase-like和WRKY转录因子基因的生物信息学分析第21页
    2.6 核糖核酸酶基因(RIB)原核表达载体的构建第21-25页
        2.6.1 原核表达载体pET43.1a-2441的构建第21-23页
        2.6.2 重组质粒pET43.1a-2441的转化第23页
        2.6.3 pET43.1a-2441质粒的抽提及酶切鉴定第23页
        2.6.4 融合蛋白的诱导表达与纯化第23-25页
        2.6.5 SDS-PAGE凝胶电泳第25页
    2.7 实时荧光定量PCR分析第25-27页
        2.7.1 基因序列及引物的设计第25页
        2.7.2 逆转录第25-26页
        2.7.3 荧光定量PCR扩增第26页
        2.7.4 检测和计算基因相对表达量第26-27页
    2.8 花粉的体外萌发实验第27页
        2.8.1 沙田柚花药的脱水处理及贮藏第27页
        2.8.2 超低温贮藏花药的解冻及萌发率的测定第27页
        2.8.3 重组蛋白对离体花粉萌发和花粉管生长的影响第27页
第3章 结果与分析第27-52页
    3.1 沙田柚花柱提取RNA的质量检测第27-29页
    3.2 沙田柚自交、异交花柱基因数字表达谱结果的分析第29-41页
        3.2.1 测序质量的评估第29-31页
        3.2.2 测序饱和度的分析第31-33页
        3.2.3 测序随机性的分析第33-34页
        3.2.4 基因测序覆盖度第34-35页
        3.2.5 差异表达基因的筛选第35-36页
        3.2.6 表达模式的聚类分析第36-37页
        3.2.7 GO功能显著性富集分析第37-39页
        3.2.8 Pathway显著性富集分析第39-41页
    3.3 RNase-like蛋白基因和WRKY转录因子基因的鉴定与分析第41-47页
        3.3.1 RNase-like基因的分析第41-44页
        3.3.2 WRKY转录因子基因的分析第44-47页
    3.4 核糖核酸酶基因原核表达载体构建与目的蛋白的纯化第47-50页
        3.4.1 重组表达载体的检测第47-48页
        3.4.2 诱导表达蛋白电泳的结果第48-50页
    3.5 荧光定量PCR验证第50-51页
    3.6 花粉体外萌发结果与分析第51-52页
第4章 讨论第52-55页
    4.1 沙田柚配子体自交不亲和相关的候选基因第52-54页
        4.1.1 核酸酶相关基因第52-53页
        4.1.2 激素相关基因第53-54页
        4.1.3 花粉管伸长的相关基因第54页
    4.2 RNase-like基因和WRKY转录因子基因在自交不亲和中差异表达的分析第54-55页
第5章 结论与展望第55-57页
参考文献第57-65页
附录第65-71页
攻读硕士期间发表论文的情况第71-72页
致谢第72-73页

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