基于图论的单体型重建算法设计和可视化实验平台的构建
| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第9-20页 |
| 1.1 生物信息学简介 | 第9-15页 |
| 1.1.1 生物信息学的产生与发展背景 | 第9-12页 |
| 1.1.2 主要研究内容 | 第12-15页 |
| 1.2 单体型检测问题及当前研究现状 | 第15-18页 |
| 1.2.1 单体型检测问题介绍 | 第15-16页 |
| 1.2.2 单体型推断 | 第16-17页 |
| 1.2.3 单体型组装 | 第17-18页 |
| 1.3 本文主要内容和结构 | 第18-20页 |
| 第二章 单体型组装问题和优化模型 | 第20-29页 |
| 2.1 遗传学基础 | 第20-24页 |
| 2.1.1 染色体和DNA | 第20-22页 |
| 2.1.2 基因和等位基因 | 第22-23页 |
| 2.1.3 SNPs、单体型和基因型 | 第23-24页 |
| 2.2 单体型组装问题 | 第24-28页 |
| 2.2.1 单体型组装问题介绍 | 第24-26页 |
| 2.2.2 数据格式及计算模型 | 第26-28页 |
| 2.3 本章小结 | 第28-29页 |
| 第三章 基于位点关联图的单体型重建算法 | 第29-47页 |
| 3.1 位点关联图的无冲突着色问题 | 第29-33页 |
| 3.2 基于位点关联图的无冲突着色算法 | 第33-39页 |
| 3.3 实验结果 | 第39-46页 |
| 3.3.1 CFVC的参数 | 第40-42页 |
| 3.3.2 与H-BOP和ReFHap的比较 | 第42-46页 |
| 3.4 本章小结 | 第46-47页 |
| 第四章 可视化实验平台 | 第47-57页 |
| 4.1 需求分析 | 第47-48页 |
| 4.2 总体设计和相关技术 | 第48-51页 |
| 4.2.1 总体设计 | 第48-49页 |
| 4.2.2 相关技术 | 第49-51页 |
| 4.3 实验演示 | 第51-55页 |
| 4.4 本章小结 | 第55-57页 |
| 第五章 总结和展望 | 第57-61页 |
| 5.1 总结 | 第57-58页 |
| 5.2 展望 | 第58-61页 |
| 参考文献 | 第61-65页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第65页 |
| 攻读硕士学位期间参与的科研项目 | 第65-66页 |
