基于序列顺序与位置信息的启动子预测
| 摘要 | 第5-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-16页 |
| 1.1 启动子及其识别 | 第10-11页 |
| 1.2 真核和原核启动子预测研究现状 | 第11-13页 |
| 1.3 本文结构及主要内容 | 第13-16页 |
| 第二章 基准数据集 | 第16-18页 |
| 2.1 数据来源 | 第16-17页 |
| 2.2 小结 | 第17-18页 |
| 第三章 特征描述与筛选 | 第18-28页 |
| 3.1 特征描述 | 第18-24页 |
| 3.1.1 伪核苷酸(PseKNC)特征 | 第18-21页 |
| 3.1.2 序列保守性分析 | 第21-23页 |
| 3.1.3 位置关联打分(PCSF)特征 | 第23-24页 |
| 3.2 特征筛选 | 第24-27页 |
| 3.2.1 最小冗余最大相关方法简介 | 第25-26页 |
| 3.2.2 增量特征选择方法决策最优子集 | 第26-27页 |
| 3.3 小结 | 第27-28页 |
| 第四章 模型构建与评估 | 第28-34页 |
| 4.1 模型构建 | 第28-31页 |
| 4.1.1 支持向量机简介 | 第28-29页 |
| 4.1.2 LIBSVM的使用 | 第29-31页 |
| 4.2 模型评价 | 第31-33页 |
| 4.2.1 交叉验证方法 | 第31-32页 |
| 4.2.2 常用评估参数 | 第32-33页 |
| 4.3 小结 | 第33-34页 |
| 第五章 结果分析与讨论 | 第34-46页 |
| 5.1 PseKNC参数优化 | 第34-35页 |
| 5.2 五个启动子分类器 | 第35-38页 |
| 5.3 与现有启动子分类器的比较 | 第38-41页 |
| 5.4 在线服务介绍 | 第41-45页 |
| 5.5 小结 | 第45-46页 |
| 第六章 总结与展望 | 第46-49页 |
| 6.1 本文工作总结 | 第46-47页 |
| 6.2 未来工作展望 | 第47-49页 |
| 致谢 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-57页 |
| 攻读硕士期间取得的研究成果 | 第57页 |
