| 摘要 | 第6-10页 |
| ABSTRACT | 第10-13页 |
| LIST OF FIGURES | 第19-21页 |
| ACRONYMS AND ABBREVIATIONS | 第21-24页 |
| CHAPTER No: 1 INTRODUCTION | 第24-51页 |
| 1.1 QUORUM SENSING | 第24-26页 |
| 1.1.1 Quorum Sensing in Bacteria | 第24-25页 |
| 1.1.2 Quorum Sensing in Plant | 第25页 |
| 1.1.3 Quorum Sensing in Parasite | 第25-26页 |
| 1.2 DIFFERENT QUORUM SIGNALS SYSTEMS IN BACTERIA | 第26-34页 |
| 1.2.1 Mechanisms of Quorum Sensing | 第27-28页 |
| 1.2.2 Quo rum-Sensing Signals | 第28页 |
| 1.2.3 Autoinducer-1 or AI-1 | 第28-29页 |
| 1.2.4 Autoinducer-2 or AI-2 | 第29-31页 |
| 1.2.5 Autoinducer-3 or AI-3 | 第31-32页 |
| 1.2.6 Autoinducing Peptides | 第32-34页 |
| 1.3 ESCHERICHIA COLI AND T4 BACTERIOPHAGE IN NATURAL ENVIRONMENT | 第34-38页 |
| 1.3.1 Escherichia coli in Natural Environment | 第34页 |
| 1.3.2 Escherichia coli in Soil Environment | 第34-35页 |
| 1.3.3 Escherichia coli in Tropical Fresh Water Environment | 第35-36页 |
| 1.3.4 T4 Bacteriophage in Natural Environment | 第36-37页 |
| 1.3.5 Interaction between Phage and Hosts in their Physical Environment | 第37-38页 |
| 1.4 ESCHERICHIA COLI AS A MODEL ORGANISM | 第38-44页 |
| 1.4.1 Life cycle of Escherichia coli | 第39-40页 |
| 1.4.2 Escherichia coli Transmission | 第40页 |
| 1.4.3 Escherichia coli Genera History | 第40页 |
| 1.4.4 Escherichia coli Phenotypic Diversity | 第40-41页 |
| 1.4.5 Escherichia coli Strains | 第41-42页 |
| 1.4.6 DNA Sequence of Escherichia coli | 第42页 |
| 1.4.7 Escherichia coli Proteins | 第42页 |
| 1.4.8 Escherichia coli as a Model Organism | 第42页 |
| 1.4.9 Nonpathogenic Escherichia coli Advantages | 第42-43页 |
| 1.4.10 Role of Escherichia coli in Research Field | 第43-44页 |
| 1.5 T4 BACTERIOPHAGE AS A MODEL ORGANISM | 第44-49页 |
| 1.5.1 Infection and Life cycle of T4 Bacteriophage | 第45-46页 |
| 1.5.2 T4 Bacte riophage Unique Feature | 第46页 |
| 1.5.3 Bacteriophage Classification | 第46-47页 |
| 1.5.4 Lysis from within"and "Lysis from without | 第47页 |
| 1.5.5 T4 Bacteriophage as Model System | 第47-48页 |
| 1.5.6 T4 Bacteriophage Therapy | 第48页 |
| 1.5.7 T4 Bacteriophage Lysins as Antimicrobials | 第48-49页 |
| 1.5.8 T4 Bacteriophage Display | 第49页 |
| 1.5.9 Function of T4 Bacteriophage in Vaccines | 第49页 |
| 1.5.10 T4 Bacteriophage for Detection of Pathogens | 第49页 |
| 1.6 GOAL OF OUR STUDY | 第49-51页 |
| CHAPTER No: 2 THE EFFECT OF DIFFERENT pfu, TEMPERATURE AND pH ON T4 BACTERIOPHAGE INFECTION ACTIVITY AND PRODUCTION | 第51-59页 |
| 2.1 MATERIALS AND METHODS | 第51-53页 |
| 2.1.1 Bacteria and Bacteriophage | 第51-52页 |
| 2.1.2 Culture Media | 第52页 |
| 2.1.3 Semi Solid Media | 第52页 |
| 2.1.4 Plaque Count Assay | 第52页 |
| 2.1.5 Plating of T4 Bacteriiophage | 第52页 |
| 2.1.6 Dilution of T4 Bacteriophage Stock | 第52-53页 |
| 2.1.7 Media pH | 第53页 |
| 2.1.8 Sterilization of Instruments and Media | 第53页 |
| 2.1.9 Statistical Analysis | 第53页 |
| 2.2 RESULT | 第53-57页 |
| 2.2.1 Effect of Different pfu of T4 Bacteriophage on its host interaction | 第53-54页 |
| 2.2.2 Effect of Temperature on T4 Bacteriophage and its host interaction | 第54-56页 |
| 2.2.3 Effect of pH on T4 Bacteriophage and its host interaction | 第56-57页 |
| 2.3 DISCUSSION | 第57-59页 |
| CHAPTER No: 3 VARIOUS CULTURE MEDIA EFFECT ON T4 BACTERIOPHAGE INFECTION ACTIVITY AND PRODUCTION | 第59-64页 |
| 3.1 MATERIALS AND METHODS | 第60-62页 |
| 3.1.1 Bacteria and Bacteriophage | 第60页 |
| 3.1.2 Culture Media | 第60-61页 |
| 3.1.2.1 Luria-Bertani Media | 第60页 |
| 3.1.2.2 Luria-Bertani pulse 0.0% Glucose Media | 第60页 |
| 3.1.2.3 Minimal Media | 第60页 |
| 3.1.2.4 Nutrient Media | 第60-61页 |
| 3.1.3 Semi Solid Media | 第61页 |
| 3.1.4 Plaque Count Assay | 第61页 |
| 3.1.5 Plating of T4 Bacteriophage | 第61页 |
| 3.1.6 Sterilization of Instruments and Media | 第61页 |
| 3.1.7 Statistical Analysis | 第61-62页 |
| 3.2 RESULT | 第62-63页 |
| 3.3 DISCUSSION | 第63-64页 |
| CHAPTER No:4 EFFECT OF DIFFERENT PHASE ESCHERICHIA COLI ON T4 BACTERIOPHAGE INFECTION ACTIVITY AND PRODUCTION | 第64-69页 |
| 4.1 MATERIALS AND METHODS | 第65-67页 |
| 4.1.1 Bacteria and Bacteriophage | 第65页 |
| 4.1.2 Culture Media | 第65页 |
| 4.1.3 Semi Solid Media | 第65-66页 |
| 4.1.4 Plaque Count Assay | 第66页 |
| 4.1.5 Plating of T4 Bacte riophage | 第66页 |
| 4.1.6 Sterilization of Instruments and Media | 第66页 |
| 4.1.7 Statistical Analysis | 第66-67页 |
| 4.2 RESULT | 第67-68页 |
| 4.3 DISCUSSION | 第68-69页 |
| CHAPTER No:5 LYSIS INHIBITION EFFECT T4 BACTERIOPHAGE PLAQUE BURST SIZE | 第69-75页 |
| 5.1 MATERIALS AND METHODS | 第70-71页 |
| 5.1.1 Bacteria and Bacteriophage | 第70页 |
| 5.1.2 Culture Media | 第70页 |
| 5.1.3 Semi Solid Media | 第70页 |
| 5.1.4 Plaque Count Assay | 第70-71页 |
| 5.1.5 Plating of T4 Bacte riophage | 第71页 |
| 5.1.6 Sterilization of Instruments and Media | 第71页 |
| 5.2 RESULT | 第71-74页 |
| 5.3 DISCUSSION | 第74-75页 |
| CHAPTER No:6 QUORUM SENSING MOLECULES ACYL-HOMOSERINE LACTONES AND INDOLE EFFECT ON T4 BACTERIOPHAGE INFECTION AND PRODUCTION | 第75-85页 |
| 6.1 MATERIALS AND METHODS | 第77-80页 |
| 6.1.1 Bacteria and Bacteriophage | 第77页 |
| 6.1.2 Luria-Bertani Media | 第77页 |
| 6.1.3 Semi Solid Media | 第77页 |
| 6.1.4 Chemicals | 第77-78页 |
| 6.1.5 Plaque Count Assay | 第78-79页 |
| 6.1.6 Plating of T4 Bacteriophage | 第79页 |
| 6.1.7 Plaque Size Determination | 第79页 |
| 6.1.8 Sterilization of Instrument and Media | 第79页 |
| 6.1.9 Statistical Analysis | 第79-80页 |
| 6.2 RESULT | 第80-83页 |
| 6.2.1 Quorum Sensing Molecule AHL Effect on T4 Bacteriophage Infection and Production | 第80-81页 |
| 6.2.2 Quorum Sensing Molecule Indole Effect on T4 Bacteriophage Infection and Production | 第81-82页 |
| 6.2.3 The AHL and Indole Effect on Diluted T4 Bacteriophage Production and Lysis Activity | 第82-83页 |
| 6.2.4 Quorum Sensing Molecules AHL and Indole Effect on the Plaque size of T4 bacteriophage | 第83页 |
| 6.3 DISCUSSION | 第83-85页 |
| CHAPTER No:7 SEPERATION AND PURIFICATION OF TWO NEW QUORUM SENSING MOLECULES W1 AND W2 | 第85-97页 |
| 7.1 MATERIALS AND METHODS | 第85-91页 |
| 7.1.1 Bacteria and Bacteriophage | 第85页 |
| 7.1.2 Minimal Media | 第85-86页 |
| 7.1.3 Semi Solid Media | 第86页 |
| 7.1.4 Plaque Count Assay | 第86页 |
| 7.1.5 Plating of T4 Bacteriophage | 第86页 |
| 7.1.6 0.1M Tris-Base Buffer | 第86页 |
| 7.1.7 0.1M Hcl Buffer | 第86页 |
| 7.1.8 0.05M Tris-Hcl Buffer(100ml) | 第86-87页 |
| 7.1.9 0.05M Tris-Hcl with 2M Nacl Buffer(100ml) | 第87页 |
| 7.1.10 20% Ethanol/Alcohol | 第87页 |
| 7.1.11 Acetonitrile | 第87页 |
| 7.1.12 Cutt-off membrane(MWCO 9 and 5 KDa) | 第87页 |
| 7.1.13 HiPrep QFF Column and its Preparation | 第87-88页 |
| 7.1.14 Dialysis Tube | 第88-89页 |
| 7.1.15 Zorbax semi-preparative C18(9.4×250 mm)column | 第89页 |
| 7.1.16 Sterilization of Instruments and Media | 第89页 |
| 7.1.17 Protocol for Purification of W1 and W2 Quorum Sensing Molecules | 第89页 |
| 7.1.18 Spot Test | 第89-90页 |
| 7.1.19 Dialysis Process | 第90页 |
| 7.1.20 Ion-Exchange Chromatography | 第90-91页 |
| 7.1.21 High-Performance Liquid Chromatography(HPLC) | 第91页 |
| 7.2 RESULT | 第91-95页 |
| 7.2.1 Fast Protein Liquid Chromatography(FPLC) | 第91-92页 |
| 7.2.2 High-Performance Liquid Chromatography(HPLC) | 第92页 |
| 7.2.3 Time-of-Flight Mass Spectrometry(TOF MS) | 第92-94页 |
| 7.2.4 Quorum Sensing Molecules W1 and W2 Effect on T4 Bacteriophage Infection and Production | 第94-95页 |
| 7.2.5 To check the effect of Different condition on W1 and W2 Quorum Sensing Molecules Efficiency | 第95页 |
| 7.3 DISCUSSION | 第95-97页 |
| CHAPTER No:8 SUMMERY AND OUTLOOK | 第97-102页 |
| REFERENCES | 第102-116页 |
| PAPERS DETAILS | 第116-118页 |
| ANNEXURE-1 INSTRUMENTS | 第118-120页 |
| ANNEXURE-2 COLUMNS AND DIALYSIS TUBLE/BAG | 第120-127页 |
| ANNEXURE-3 FPLC AND HPLC PROCEDURE | 第127-132页 |
| ANNEXURE-4 STERILIZATION OF INSTRUMENTS | 第132-134页 |
| ANNEXURE-5 RECIPES OF MEDIA | 第134-103页 |
| REFERENCES | 第103-140页 |
