| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-14页 |
| CHAPTER ONE INTRODUCTION AND LITERATURE REVIEW | 第14-34页 |
| ·Butternut (J. cinerea L.) | 第15-18页 |
| ·Native range | 第15-16页 |
| ·Use, selected cultivars, and nursery production | 第16-17页 |
| ·Butternut canker disease | 第17-18页 |
| ·Japanese walnut (J. ailantifolia Carr.) | 第18-20页 |
| ·Black walnut (J. nigra L.) | 第20-22页 |
| ·Native range | 第20-21页 |
| ·Use | 第21-22页 |
| ·Black walnut genetic research | 第22页 |
| ·Hybrids | 第22-23页 |
| ·Breeding and Genetics | 第23-26页 |
| ·Molecular genetics and breeding in plants and walnuts | 第26-32页 |
| ·RAPD, SCAR, CAPS markers | 第27-28页 |
| ·Internal transcribed spacer (ITS) | 第28-29页 |
| ·TrnT (UAA)–trnF (GAA) region | 第29页 |
| ·Microsatellites, simple sequence repeats (SSR) | 第29-30页 |
| ·Restriction fragment length polymorphisms (RFLPs) | 第30页 |
| ·Amplied fragment length polymorphism (AFLP) | 第30-31页 |
| ·Gene cloning and micropropagation | 第31-32页 |
| ·Breeding without breeding (BWB) assisted breeding approach | 第32页 |
| ·Walnut cultivars | 第32-33页 |
| ·Objectives | 第33-34页 |
| CHAPTER TWO DNA MARKERS IDENTIFY HYBRIDS BETWEEN BUTTERNUT (JUGLANS CINEREA L.) AND JAPANESE WALNUT (JUGLANS AILANTIFOLIA CARR.) | 第34-70页 |
| ·Introduction | 第34-36页 |
| ·Materials and Methods | 第36-49页 |
| ·Plant materials | 第36页 |
| ·DNA extraction | 第36-44页 |
| ·RAPD PCR analysis | 第44-46页 |
| ·ITS and trnL-F markers | 第46页 |
| ·Cloning and sequencing RAPD DNA amplicons | 第46-47页 |
| ·Primer design and PCR amplification for SCAR and CAPS markers | 第47页 |
| ·CAPS marker analysis | 第47-49页 |
| ·Results | 第49-65页 |
| ·Randomly amplified polymorphic DNA bulked segregant analysis | 第49-50页 |
| ·Use of ITS and trnL-F markers to identify hybrids | 第50-51页 |
| ·Cloning and sequencing RAPD DNA amplicons | 第51-60页 |
| ·Development of the CAPS markers | 第60-63页 |
| ·Marker phenotypes of other Juglans species and hybrids | 第63-65页 |
| ·Discussion | 第65-68页 |
| ·Summary | 第68-70页 |
| CHAPTER THREE COMBINING PHENOTYPES AND GENOTYPES FOR PARENTAGE ANALYSIS AND SELECTION IN A BLACK WALNUT (JUGLANS NIGRA L.) PROGENY TEST | 第70-98页 |
| ·Introduction | 第70-71页 |
| ·Materials and Methods | 第71-78页 |
| ·Plant materials | 第71-72页 |
| ·Progeny test establishment | 第72-73页 |
| ·Morphological measurements | 第73页 |
| ·DNA extraction | 第73页 |
| ·Microsatellite PCR analysis | 第73-78页 |
| ·Results | 第78-93页 |
| ·Multiple SSR loci during PCR | 第78-80页 |
| ·Phenotypic selection in a black walnut progeny test | 第80-81页 |
| ·Progeny exclusion and reassignment | 第81-82页 |
| ·Effect of progeny exclusion/reassignment based on genotype on family performance | 第82-83页 |
| ·Effect of parentage and paternity assignment on family means for the trait | 第83-84页 |
| ·Effect of parentage and paternity assignment on family means for quality rati | 第84-86页 |
| ·The family ranks for Height, DBH, LDR and quality determined by phenotypic and genotypic data | 第86-93页 |
| ·Discussion | 第93-97页 |
| ·Summary | 第97-98页 |
| CHAPTER FOUR MICROSATELLITE MARKERS (SSR) AND PHENOTYPES IDENTIFY CULTIVARS OF BLACK WALNUT (JUGLANS NIGRA L.) FOR NUT BREEDING | 第98-115页 |
| ·Introduction | 第98-99页 |
| ·Materials and Methods | 第99-104页 |
| ·Plant materials | 第99-100页 |
| ·Morphological measurements | 第100-102页 |
| ·DNA extraction | 第102-103页 |
| ·PCR amplification of microsatellites and analysis of data | 第103-104页 |
| ·Data analysis | 第104-107页 |
| ·Results and Discussion | 第107-114页 |
| ·Analysis of phenology and morphological | 第107-109页 |
| ·Analysis of genotypic data | 第109-112页 |
| ·Canonical analyses of black walnut cultivars | 第112-114页 |
| ·Summary | 第114-115页 |
| CHAPTER FIVE CONCLUSIONS AND FUTURE WORK | 第115-117页 |
| ·Conclusions | 第115-116页 |
| ·Future work | 第116-117页 |
| REFERENCE | 第117-138页 |
| APPENDIX | 第138-172页 |
| ACKNOWLEDGEMENTS | 第172-174页 |
| 作者简介 | 第174-176页 |
