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两株胶红酵母菌的胞外多糖结构、生物活性及转录组表达差异分析

摘要第5-8页
ABSTRACT第8-11页
符号说明第13-20页
1 前言第20-33页
    1.1 胶红酵母菌概述第20页
    1.2 酵母菌胞外多糖的研究概况第20-26页
        1.2.1 酵母菌胞外多糖的合成途径第21-23页
        1.2.2 酵母菌胞外多糖结构解析第23-25页
        1.2.3 酵母菌胞外多糖活性功能分析第25-26页
    1.3 转录组测序(RNA-Seq)技术第26-30页
        1.3.1 RNA-Seq原理与优势第27-29页
        1.3.2 RNA-Seq技术在酵母菌细胞研究中的应用第29-30页
    1.4 课题研究的目的意义与研究内容第30-33页
        1.4.1 课题研究的目的意义第30-31页
        1.4.2 课题研究的主要内容第31-33页
2 胶红酵母菌株的鉴定及其胞外多糖的分离纯化第33-45页
    2.1 引言第33页
    2.2 实验材料第33-36页
        2.2.1 菌株及培养基第33页
        2.2.2 实验器材及试剂第33-35页
        2.2.3 仪器设备第35-36页
    2.3 实验方法第36-41页
        2.3.1 胶红酵母R.mucilaginosaCM-1菌种的鉴定第36-38页
        2.3.2 胶红酵母R.mucilaginosaCM-1胞外多糖的制备第38-39页
        2.3.3 胶红酵母R.mucilaginosaCM-1菌株胞外粗多糖初步纯化第39页
        2.3.4 胶红酵母菌胞外多糖单一组分(RmEPS-11)的分离、纯化第39-41页
    2.4 结果与分析第41-44页
        2.4.1 胶红酵母R.mucilaginosaCM-1菌株的鉴定第41-43页
        2.4.2 胶红酵母R.mucilaginosaCM-1胞外多糖分离与纯化第43-44页
    2.5 本章小结第44-45页
3 胶红酵母菌株(R. mucilaginosa)CM-1 胞外多糖初级结构解析与抗氧化活性研究第45-57页
    3.1 引言第45页
    3.2 实验材料第45-47页
        3.2.1 菌株第45页
        3.2.2 实验器材及试剂第45-46页
        3.2.3 仪器设备第46-47页
    3.3 实验方法第47-50页
        3.3.1 胶红酵母菌胞外多糖RmEPS-11结构解析第47-48页
        3.3.2 胶红酵母菌胞外多糖(RmEPS-11)抗氧化活性研究第48-50页
    3.4 结果与分析第50-56页
        3.4.1 多糖组分RmEPS-11的均一性和分子量分布第50-51页
        3.4.2 多糖组分RmEPS-11红外光谱分析第51-52页
        3.4.3 多糖组分RmEPS-11单糖组成分析第52页
        3.4.4 多糖组分RmEPS-11甲基化分析第52-53页
        3.4.5 多糖组分RmEPS-11核磁谱图分析第53-54页
        3.4.6 多糖组分RmEPS-11抗氧化活性分析第54-56页
    3.5 本章小结第56-57页
4 胞外多糖RmEPS-11对异烟肼和利福平肝毒性的保护机制第57-67页
    4.1 引言第57页
    4.2 实验材料第57-58页
        4.2.1 试剂与材料第57-58页
        4.2.2 设备第58页
    4.3 实验方法第58-63页
        4.3.1 分组及造模第58-59页
        4.3.2 脏器指数的测定及样品处理第59-60页
        4.3.3 T-Protein测定第60页
        4.3.4 T-SOD测定第60页
        4.3.5 MDA测定第60-61页
        4.3.6 GSH-PX测定第61页
        4.3.7 病理学研究第61页
        4.3.8 CYP2E1基因表达水平分析第61-62页
        4.3.9 总RNA的提取纯化第62页
        4.3.10 荧光实时定量PCR第62-63页
        4.3.11 统计学处理第63页
    4.4 结果与分析第63-65页
        4.4.1 胶红酵母多糖对肝功能活性的影响肝功能活性分析第63-65页
        4.4.2 CYP2E1的表达第65页
    4.5 本章小结第65-67页
5 胶红酵母(R. mucilaginosa)CICC 33013 胞外多糖的分离纯化、结构解析及抗氧化活性研究第67-81页
    5.1 引言第67页
    5.2 实验材料第67-70页
        5.2.1 菌株及培养基第67-68页
        5.2.2 实验器材及试剂第68-69页
        5.2.3 仪器设备第69-70页
    5.3 实验方法第70-72页
        5.3.1 胶红酵母CICC33013胞外多糖的制备第70页
        5.3.2 胶红酵母CICC33013胞外粗多糖初步纯化第70-71页
        5.3.3 胶红酵母胞外多糖单一组分(REPS2-A)的分离、纯化第71页
        5.3.4 胶红酵母胞外多糖(REPS2-A)结构解析第71-72页
        5.3.5 胶红酵母胞外多糖(REPS2-A)抗氧化活性第72页
    5.4 结果与分析第72-79页
        5.4.1 胶红酵母(R.mucilaginosa)CICC33013胞外多糖分离与纯化第72-73页
        5.4.2 多糖组分REPS2-A的均一性和分子量分布第73-74页
        5.4.3 多糖组分REPS2-A红外光谱分析第74页
        5.4.4 多糖组分REPS2-A单糖组成分析第74-75页
        5.4.5 多糖组分REPS2-A甲基化分析第75-76页
        5.4.6 多糖组分REPS2-A核磁谱图分析第76-77页
        5.4.7 多糖组分REPS2-A的抗氧化活性分析第77-79页
    5.5 本章小结第79-81页
6 胶红酵母(R. mucilaginosa CICC 33013)胞外多糖抑制肝癌细胞活性研究第81-91页
    6.1 引言第81页
    6.2 实验材料第81-82页
        6.2.1 试剂与材料第81-82页
        6.2.2 设备第82页
    6.3 实验方法第82-84页
        6.3.1 细胞复苏第82-83页
        6.3.2 癌细胞筛选第83页
        6.3.3 多糖组分REPS2-A对肝癌细胞Hep-G2作用浓度及时效性测定第83-84页
        6.3.4 肝癌细胞Hep-G2凋亡检测第84页
        6.3.5 细胞形态学观察第84页
        6.3.6 肝癌细胞周期测定第84页
    6.4 结果与分析第84-89页
        6.4.1 癌细胞的筛选第84-85页
        6.4.2 多糖组分REPS2-A溶液的浓度及时效性分析第85-86页
        6.4.3 多糖组分REPS2-A对Hep-G2细胞凋亡影响分析第86-87页
        6.4.4 多糖组分REPS2-A对Hep-G2细胞形态学影响分析第87-88页
        6.4.5 多糖组分REPS2-A对肝癌细胞Hep-G2周期影响分析第88-89页
    6.5 本章小结第89-91页
7 胶红酵母菌株RNA-Seq分析第91-133页
    7.1 引言第91-92页
    7.2 实验材料第92-93页
        7.2.1 药品和试剂第92-93页
        7.2.2 主要试剂配置第93页
        7.2.3 仪器设备第93页
    7.3 实验方法第93-101页
        7.3.1 胶红酵母菌株(R.mucilaginosa)总RNA的提取及测序第93-95页
        7.3.2 测序质量分析第95-96页
        7.3.3 转录本拼接第96页
        7.3.4 基因功能注释第96-98页
        7.3.5 SSR分析第98-99页
        7.3.6 基因表达水平分析第99页
        7.3.7 RNA-Seq整体质量分析第99页
        7.3.8 差异表达基因筛选第99-100页
        7.3.9 差异基因GO分析第100页
        7.3.10 差异基因KEGG分析第100-101页
    7.4 结果与分析第101-130页
        7.4.1 RNA样品质量检测及文库构建第101-102页
        7.4.2 测序质量鉴定第102-104页
        7.4.3 转录本拼接第104-105页
        7.4.4 基因功能注释第105-110页
        7.4.5 SSR分析结果第110-111页
        7.4.6 基因表达水平分析第111-112页
        7.4.7 RNA-seq整体质量分析第112-113页
        7.4.8 差异表达基因筛选第113-115页
        7.4.9 差异基因GO富集分析第115-119页
        7.4.10 差异基因KEGG富集分析第119-130页
    7.5 本章小结第130-133页
8 结论与展望第133-138页
    8.1 结论与创新点第133-136页
        8.1.1 结论第133-135页
        8.1.2 创新点第135-136页
    8.2 展望第136-138页
致谢第138-140页
参考文献第140-148页
附录第148-160页
攻读学位期间发表的学术论文目录第160-161页

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