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基于转录组测序滇牡丹花色形成分子调控机理研究

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
第一章 绪论第19-32页
    1.1 引言第19-20页
    1.2 花色形成调控机理的国内外研究现状第20-26页
        1.2.1 花色素的种类第20-21页
        1.2.2 类黄酮化合物的生物合成及基因表达调控第21-24页
        1.2.3 花色素苷的转录调控第24-26页
    1.3 牡丹花色形成机理研究现状第26-28页
    1.4 滇牡丹花色研究现状第28页
    1.5 高通量测序技术第28-29页
    1.6 研究目标和主要研究内容第29-31页
        1.6.1 研究目标第29-30页
        1.6.2 研究内容第30-31页
    1.7 研究技术路线第31-32页
第二章 滇牡丹花瓣不同发育时期花色及类黄酮成分测定第32-47页
    2.1 材料与方法第32-35页
        2.1.1 试验材料第32-33页
        2.1.2 试验方法第33-35页
    2.2 结果与分析第35-45页
        2.2.1 试验结果第35-44页
        2.2.2 讨论第44-45页
    2.3 小结第45-47页
第三章 滇牡丹花瓣转录组测序与分析第47-71页
    3.1 材料与方法第47-50页
        3.1.1 试验材料第47页
        3.1.2 总RNA提取,cDNA文库构建及测序第47-48页
        3.1.3 组装和序列分析第48页
        3.1.4 功能注释第48页
        3.1.5 RNA-Seq基因表达分析第48-49页
        3.1.6 差异表达基因的qRT-PCR验证第49-50页
    3.2 结果与分析第50-69页
        3.2.1 试验结果第50-67页
        3.2.2 讨论第67-69页
    3.3 小结第69-71页
第四章 滇牡丹实时定量PCR内参基因筛选第71-86页
    4.1 材料与方法第71-75页
        4.1.1 试验材料第71-72页
        4.1.2 总RNA提取与cDNA合成第72页
        4.1.3 候选内参基因选择第72-74页
        4.1.4 PCR引物设计和扩增效率检测第74页
        4.1.5 实时定量PCR第74页
        4.1.6 统计分析第74-75页
        4.1.7 PsCHS1和PsCHI1验证第75页
    4.2 结果与分析第75-84页
        4.2.1 试验结果第75-82页
        4.2.2 讨论第82-84页
    4.3 小结第84-86页
第五章 滇牡丹类黄酮合成途径结构基因的表达分析第86-102页
    5.1 材料与方法第86-88页
        5.1.1 试验材料第86页
        5.1.2 滇牡丹类黄酮合成途径相关关键酶的筛选第86-87页
        5.1.3 RNA提取第87页
        5.1.4 qRT-PCR引物设计第87页
        5.1.5 qRT-PCR反应第87-88页
    5.2 结果与分析第88-101页
        5.2.1 试验结果第88-99页
        5.2.2 讨论第99-101页
    5.3 小结第101-102页
第六章 调控滇牡丹类黄酮合成途径转录因子的表达分析第102-126页
    6.1 材料与方法第102-104页
        6.1.1 试验材料第102页
        6.1.2 基因全长序列的克隆第102-104页
        6.1.3 生物信息学分析第104页
        6.1.4 qRT-PCR表达分析第104页
    6.2 结果与分析第104-125页
        6.2.1 试验结果第104-122页
        6.2.2 讨论第122-125页
    6.3 小结第125-126页
第七章 滇牡丹谷胱甘肽转移酶基因GST的分离及表达分析第126-138页
    7.1 材料与方法第126-129页
        7.1.1 试验材料第126-128页
        7.1.2 总RNA提取及目的基因全长序列的克隆第128页
        7.1.3 生物信息学第128-129页
        7.1.4 表达模式分析第129页
    7.2 结果与分析第129-137页
        7.2.1 试验结果第129-136页
        7.2.2 讨论第136-137页
    7.3 小结第137-138页
第八章 结论第138-141页
    8.1 结论第138-139页
    8.2 创新点第139-140页
    8.3 展望第140-141页
参考文献第141-162页
附录第162-168页
在读期间的学术研究第168-169页
致谢第169页

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