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人类相关的miRNA相互关系研究和数据库的构建

摘要第1-9页
Abstract第9-13页
缩略语(按照英文首字母顺序排序)第13-15页
第一章 文献综述第15-29页
 1 microRNA (miRNA)第15-18页
   ·miRNA 的形成第15-16页
   ·miRNA 的作用机制和功能第16页
   ·miRNA 的保守性和基因簇集现象第16-18页
 2 miRNA 功能研究的方法学第18-19页
   ·Northern 杂交(Northern blot analysis)第18页
   ·RT-PCR第18-19页
   ·miRNA 芯片(microRNA microarray)第19页
   ·上调或者下调miRNAs 的表达(Up- or down-regulated expression of miRNAs)第19页
 3 miRNA 与人类疾病第19-22页
   ·miRNA 与肿瘤第20-21页
   ·miRNA 与心血管疾病第21-22页
 4 miRNA 相关的数据库的概述第22-25页
   ·miRNA 靶基因相关的数据库第22-24页
   ·其他miRNA 信息相关的数据库第24-25页
 5 miRNA 参与调控信号通路第25-28页
 6 展望第28-29页
第二章 课题方案设计第29-32页
 1 选题目的和意义第29页
 2 论文的主要工作第29-30页
 3 论文的组织结构第30-31页
 4 小结第31-32页
第三章 材料和方法第32-42页
 1 数据库的构建平台第32页
 2 数据收集第32-35页
   ·文献检索第32-33页
   ·数据摘录第33-35页
 3 数据处理第35-36页
 4 数据统计第36-40页
   ·收录文献数据统计第36页
   ·收录数据分类第36-40页
   ·其他数据统计第40页
 5 常用基因注释资源数据库第40-41页
   ·Gene Ontology(GO)数据库第40页
   ·Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM)数据库第40-41页
   ·Genecards 数据库第41页
 6 小结第41-42页
第四章 本地数据库miCenter 的设计与构建第42-50页
 1 关系数据库的设计原则第42-43页
 2 miCenter 数据库中的表结构第43-44页
 3 miCenter 数据库的实现第44-46页
   ·系统要求第44页
   ·各表的创建第44-46页
 4 miCenter 数据库查询页面和结果页面的组织第46-49页
 5 本章小结第49-50页
第五章 miRNA 与miRNA 相互关系的分析第50-59页
 1 算法的选择及模型的建立第50-52页
   ·单尾Fisher 精确检验第50-51页
   ·计算模型的建立第51-52页
   ·结果及分析第52页
 2 miRNA 与miRNA 相互关系网络的构建第52-56页
   ·软件工具第52-53页
   ·关系网络的构建第53-56页
 3 网络的初步分析第56-58页
 4 结果分析第58页
 5 本章小结第58-59页
第六章 总结与展望第59-61页
 1 总结第59页
 2 展望第59-61页
参考文献第61-65页
致谢第65-66页
附录一 miRNA 家族和聚类成员表第66-68页
附录二 miRBase 不同版本miNRA 名字转换表第68-72页
附录三 推测的具有相关性的miRNA 聚类第72-78页

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