摘要 | 第1-9页 |
Abstract | 第9-13页 |
缩略语(按照英文首字母顺序排序) | 第13-15页 |
第一章 文献综述 | 第15-29页 |
1 microRNA (miRNA) | 第15-18页 |
·miRNA 的形成 | 第15-16页 |
·miRNA 的作用机制和功能 | 第16页 |
·miRNA 的保守性和基因簇集现象 | 第16-18页 |
2 miRNA 功能研究的方法学 | 第18-19页 |
·Northern 杂交(Northern blot analysis) | 第18页 |
·RT-PCR | 第18-19页 |
·miRNA 芯片(microRNA microarray) | 第19页 |
·上调或者下调miRNAs 的表达(Up- or down-regulated expression of miRNAs) | 第19页 |
3 miRNA 与人类疾病 | 第19-22页 |
·miRNA 与肿瘤 | 第20-21页 |
·miRNA 与心血管疾病 | 第21-22页 |
4 miRNA 相关的数据库的概述 | 第22-25页 |
·miRNA 靶基因相关的数据库 | 第22-24页 |
·其他miRNA 信息相关的数据库 | 第24-25页 |
5 miRNA 参与调控信号通路 | 第25-28页 |
6 展望 | 第28-29页 |
第二章 课题方案设计 | 第29-32页 |
1 选题目的和意义 | 第29页 |
2 论文的主要工作 | 第29-30页 |
3 论文的组织结构 | 第30-31页 |
4 小结 | 第31-32页 |
第三章 材料和方法 | 第32-42页 |
1 数据库的构建平台 | 第32页 |
2 数据收集 | 第32-35页 |
·文献检索 | 第32-33页 |
·数据摘录 | 第33-35页 |
3 数据处理 | 第35-36页 |
4 数据统计 | 第36-40页 |
·收录文献数据统计 | 第36页 |
·收录数据分类 | 第36-40页 |
·其他数据统计 | 第40页 |
5 常用基因注释资源数据库 | 第40-41页 |
·Gene Ontology(GO)数据库 | 第40页 |
·Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM)数据库 | 第40-41页 |
·Genecards 数据库 | 第41页 |
6 小结 | 第41-42页 |
第四章 本地数据库miCenter 的设计与构建 | 第42-50页 |
1 关系数据库的设计原则 | 第42-43页 |
2 miCenter 数据库中的表结构 | 第43-44页 |
3 miCenter 数据库的实现 | 第44-46页 |
·系统要求 | 第44页 |
·各表的创建 | 第44-46页 |
4 miCenter 数据库查询页面和结果页面的组织 | 第46-49页 |
5 本章小结 | 第49-50页 |
第五章 miRNA 与miRNA 相互关系的分析 | 第50-59页 |
1 算法的选择及模型的建立 | 第50-52页 |
·单尾Fisher 精确检验 | 第50-51页 |
·计算模型的建立 | 第51-52页 |
·结果及分析 | 第52页 |
2 miRNA 与miRNA 相互关系网络的构建 | 第52-56页 |
·软件工具 | 第52-53页 |
·关系网络的构建 | 第53-56页 |
3 网络的初步分析 | 第56-58页 |
4 结果分析 | 第58页 |
5 本章小结 | 第58-59页 |
第六章 总结与展望 | 第59-61页 |
1 总结 | 第59页 |
2 展望 | 第59-61页 |
参考文献 | 第61-65页 |
致谢 | 第65-66页 |
附录一 miRNA 家族和聚类成员表 | 第66-68页 |
附录二 miRBase 不同版本miNRA 名字转换表 | 第68-72页 |
附录三 推测的具有相关性的miRNA 聚类 | 第72-78页 |