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Sulfolobus solfataricus P2中(+)-γ-内酰胺酶的半理性设计及其结构改造

学位论文数据集第3-4页
摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 绪论第15-21页
    1.1 2-氮杂双环[2.2.1]庚-5-烯-3-酮第15页
    1.2 γ-内酰胺酶第15-17页
        1.2.1 γ-内酰胺酶的来源第15-16页
        1.2.2 γ-内酰胺酶的研究现状第16-17页
    1.3 定向进化第17-19页
        1.3.1 定向进化简介第17-18页
        1.3.2 定向进化的相关研究第18-19页
    1.4 分子模拟辅助定向进化进行半理性设计第19-20页
    1.5 课题研究的目的和意义第20-21页
第二章 SSOP2中(+)-γ-内酰胺酶模型的构建及突变热点的选取第21-43页
    2.1 引言第21页
    2.2 实验仪器及软件第21页
    2.3 实验方法第21-24页
        2.3.1 构建SSOP2中(+)-γ-内酰胺酶分子模型第21-23页
        2.3.2 计算机模拟突变体第23-24页
    2.4 实验结果与讨论第24-40页
        2.4.1 SSOP2中(+)-γ-内酰胺酶分子模型的构建第24-32页
        2.4.2 (+)-γ-内酰胺酶蛋白质模型的结构分析第32-33页
        2.4.3 距离-能量评价假说第33页
        2.4.4 分阶段性预测突变热点第33-40页
    2.5 本章小结第40-43页
第三章 SSOP2中(+)-γ-内酰胺酶的定点饱和突变第43-81页
    3.1 引言第43页
    3.2 实验仪器与材料第43-44页
        3.2.1 实验仪器第43页
        3.2.2 实验试剂及材料第43页
        3.2.3 培养基第43页
        3.2.4 溶液及缓冲液第43-44页
    3.3 实验方法第44-54页
        3.3.1 测定菌液浓度第44-45页
        3.3.2 高通量筛选方法第45页
        3.3.3 测定蛋白溶液浓度第45-46页
        3.3.4 内标法测定酶活第46-47页
        3.3.5 定点饱和突变的实验方法第47-54页
        3.3.6 构建多突变体第54页
    3.4 实验结果与讨论第54-78页
        3.4.1 菌液浓度测定标准曲线第54-56页
        3.4.2 饱和突变构建突变体第56-66页
        3.4.3 多突变体的构建及大量培养检测活性第66-69页
        3.4.4 酶的蛋白纯化第69-72页
        3.4.5 蛋白浓度检测及内标法测定酶活第72-74页
        3.4.6 内标法测定阳性突变体的酶活第74-76页
        3.4.7 阳性突变体结构及能量解析第76-78页
    3.5 本章小结第78-81页
第四章 阳性突变体酶学性质的研究第81-93页
    4.1 引言第81页
    4.2 实验仪器及试剂第81页
        4.2.1 实验仪器第81页
        4.2.2 实验材料及试剂第81页
        4.2.3 溶液及缓冲液第81页
    4.3 实验方法第81-84页
        4.3.1 最适温度第81-82页
        4.3.2 温度热稳定性第82页
        4.3.3 最适pH第82页
        4.3.4 金属离子耐受性第82-83页
        4.3.5 米氏常数及催化效率第83-84页
    4.4 酶学性质的实验结果与讨论第84-91页
        4.4.1 最适温度第84页
        4.4.2 温度稳定性第84-85页
        4.4.3 最适pH第85-86页
        4.4.4 金属离子耐受性第86-87页
        4.4.5 米氏常数及催化效率第87-91页
    4.5 本章小结第91-93页
第五章 总结第93-95页
参考文献第95-99页
附录第99-105页
    附录1第99-100页
    附录2第100-101页
    附录3第101-102页
    附录4第102页
    附录5第102-103页
    附录6第103-105页
致谢第105-107页
研究成果及发表的学术论文第107-109页
作者与导师简介第109-110页
附件第110-111页

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