| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 上篇 文献综述 | 第12-27页 |
| 1 橡胶树白粉病的研究进展 | 第12-15页 |
| 1.1 橡胶树白粉病的概述 | 第12-13页 |
| 1.2 白粉病及橡胶树白粉病 | 第13-14页 |
| 1.3 橡胶树白粉菌的生物学特性 | 第14-15页 |
| 2 白粉菌与寄主互作研究 | 第15-18页 |
| 2.1 白粉菌侵入植物寄主 | 第16页 |
| 2.2 寄主对白粉菌侵染后的变化 | 第16-18页 |
| 3 白粉菌基因组与转录组及其相关基因的研究进展 | 第18-25页 |
| 3.1 植物病原菌与寄主互作 | 第18页 |
| 3.2 白粉真菌基因组转录组研究的现状 | 第18-20页 |
| 3.3 白粉菌互作相关基因的研究 | 第20-23页 |
| 3.3.1 与分生孢子萌发相关的基因 | 第20-21页 |
| 3.3.2 与附着胞形成相关的基因 | 第21页 |
| 3.3.3 与吸器形成相关的基因 | 第21-22页 |
| 3.3.4 参与真菌中重要胞内代谢的基因 | 第22页 |
| 3.3.5 真菌毒力因子与分泌 | 第22页 |
| 3.3.6 入侵后的定殖 | 第22-23页 |
| 3.3.7 转座与位点特异性重组 | 第23页 |
| 3.3.8 未知蛋白或者假定蛋白 | 第23页 |
| 3.4 白粉真菌基因组及转录组面临的挑战及待解决的问题 | 第23-25页 |
| 4 本研究目的意义 | 第25-26页 |
| 5 技术路线 | 第26-27页 |
| 下篇 研究内容 | 第27-75页 |
| 1 材料与方法 | 第27-34页 |
| 1.1 供试材料 | 第27-28页 |
| 1.2 橡胶树白粉菌分生孢子在不同介质的萌发形态及其能量转移 | 第28页 |
| 1.2.1 分生孢子形态学观察 | 第28页 |
| 1.2.2 分生孢子于不同介质上面萌发观察 | 第28页 |
| 1.2.3 葡糖糖水与清水中分生孢子的萌发观察 | 第28页 |
| 1.2.4 数据分析 | 第28页 |
| 1.3 橡胶树与O.heveae互作组织学及寄主相关抗性基因表达研究 | 第28-30页 |
| 1.3.1 接种方法 | 第28-29页 |
| 1.3.2 考马斯亮蓝染色 | 第29页 |
| 1.3.3 寄主细胞应对橡胶树白粉菌侵染的H_2O_2原位检测 | 第29页 |
| 1.3.4 寄主细胞坏死斑的观察 | 第29页 |
| 1.3.5 扫描电镜样品制备及观察 | 第29-30页 |
| 1.3.6 共聚焦显微镜样品制备及观察 | 第30页 |
| 1.3.7 橡胶树叶组织内H_2O_2含量测定 | 第30页 |
| 1.3.8 提取不同感病阶段的橡胶树叶片RNA并进行氧爆发相关基因的扩增 | 第30页 |
| 1.3.9 数据分析 | 第30页 |
| 1.4 橡胶树白粉菌收集及DNA和RNA提取方法比较 | 第30-32页 |
| 1.4.1 接种方法 | 第30页 |
| 1.4.2 白粉菌取菌法 | 第30-31页 |
| 1.4.3 三种不同的总RNA提取方法 | 第31页 |
| 1.4.4 三种不同的DNA提取方法 | 第31-32页 |
| 1.4.5 RNA、DNA质量及完整性的检测 | 第32页 |
| 1.4.6 RT-PCR/PCR及测序 | 第32页 |
| 1.4.7 数据分析 | 第32页 |
| 1.5 橡胶树白粉菌全基因组学初步分析 | 第32-34页 |
| 1.5.1 DNA提取 | 第32-33页 |
| 1.5.2 rDNA-ITS区间序列聚类分析 | 第33页 |
| 1.5.3 白粉菌全基因组测定 | 第33页 |
| 1.5.4 基因组序列的组装及拼接 | 第33页 |
| 1.5.5 基因的预测及注释 | 第33-34页 |
| 1.5.5.1 基因的预测 | 第33-34页 |
| 1.5.5.2 基因比对和注释 | 第34页 |
| 1.5.6 基因功能分析 | 第34页 |
| 1.5.6.1 KEGG代谢途径分析 | 第34页 |
| 1.5.6.2 COG、KOG基因家族分类 | 第34页 |
| 1.5.7 基因组比较分析 | 第34页 |
| 2 、结果与分析 | 第34-66页 |
| 2.1 橡胶树白粉菌分生孢子在不同介质的萌发形态及其能量转移 | 第34-40页 |
| 2.1.1 橡胶树白粉菌分生孢子的形态特征 | 第34-36页 |
| 2.1.2 在不同介质面上分生孢子萌发与发育结构形成存在异同 | 第36页 |
| 2.1.3 分生孢子在非生命介质中萌发率高于寄主介质 | 第36-38页 |
| 2.1.4 孢子萌发以自身糖元和脂肪等作为主要能源物质 | 第38-40页 |
| 2.2 橡胶树与Oidium heveae互作组织学及寄主相关抗性基因表达研究 | 第40-48页 |
| 2.2.1 侵染橡胶树叶组织的白粉菌分为5个发育关键时间点 | 第40-44页 |
| 2.2.2 寄主细胞对于橡胶树白粉菌的入侵反应 | 第44-48页 |
| 2.2.2.1 寄主细胞无坏死反应却产生氧爆发和胼胝质等抗性反应 | 第44-46页 |
| 2.2.2.2 侵染中后期寄主细胞会激发氧爆发阻止病原菌扩展 | 第46-48页 |
| 2.2.3 与氧爆发相关的基因在橡胶树叶片上不表达 | 第48页 |
| 2.3 橡胶树白粉菌收集及DNA和RNA提取方法比较 | 第48-53页 |
| 2.3.1 不同的收集方法获得的白粉菌 | 第48-49页 |
| 2.3.2 不同的提取方法获得的RNA及RT-PCR结果 | 第49-51页 |
| 2.3.3 不同方法提取得到的DNA及PCR结果 | 第51-53页 |
| 2.3.4 橡胶树白粉菌的DNA纯度检测 | 第53页 |
| 2.4 橡胶树白粉菌全基因组学初步分析 | 第53-66页 |
| 2.4.1 白粉菌基因组DNA的提取和质量检测 | 第53页 |
| 2.4.2 O. heveae与其他相近属真菌的系统发育树分析 | 第53-55页 |
| 2.4.3 基因组序列的拼接与组装分析 | 第55-57页 |
| 2.4.4 基因的预测及注释 | 第57页 |
| 2.4.5 基因功能分类 | 第57-66页 |
| 3. 讨论 | 第66-73页 |
| 3.1 橡胶树白粉菌分生孢子可以在不同介质及溶液的萌发,但是附着胞却有多种不同的形态 | 第66-69页 |
| 3.2 寄主细胞对于橡胶树白粉菌的入侵反应会延迟 | 第69-70页 |
| 3.3 橡胶树白粉菌不同的收集法采用不同的DNA和RNA提取方法,适用于不同的下游分子操作 | 第70-72页 |
| 3.4 橡胶树白粉菌全基因组学初步分析 | 第72-73页 |
| 4. 结论与展望 | 第73-75页 |
| 参考文献 | 第75-85页 |
| 附录 | 第85-95页 |
| 1. 附表 | 第85-88页 |
| 2. 附方法 | 第88-94页 |
| 2.1 细胞学观察方法 | 第88-90页 |
| 2.2 分子实验方法 | 第90-94页 |
| 3. 缩略语 | 第94-95页 |
| 攻读硕士期间发表或者待发表的文章 | 第95-96页 |
| 致谢 | 第96页 |
