| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 缩略语表 | 第6-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-19页 |
| 1.1 食用菌的概况 | 第11-12页 |
| 1.1.1 香菇的营养价值和药用价值 | 第12页 |
| 1.2 采后食用菌的生理和病理特性 | 第12-13页 |
| 1.3 食用菌软化相关的细胞壁降解酶基因及其调控 | 第13-16页 |
| 1.4 转录组测序的研究进展 | 第16-17页 |
| 1.5 内参基因的选择对荧光定量分析结果的重要性 | 第17-18页 |
| 1.6 研究目的与内容 | 第18-19页 |
| 第2章 香菇转录组测序与结果分析 | 第19-35页 |
| 2.1 试剂与仪器 | 第19-20页 |
| 2.1.1 试剂 | 第19页 |
| 2.1.2 仪器 | 第19-20页 |
| 2.2 材料与处理 | 第20页 |
| 2.2.1 香菇来源 | 第20页 |
| 2.2.2 香菇软化处理 | 第20页 |
| 2.3 香菇总RNA的提取及检测 | 第20-23页 |
| 2.3.1 香菇总RNA提取 | 第20-21页 |
| 2.3.2 香菇总RNA浓度的测定及完整性检测 | 第21页 |
| 2.3.3 总RNA的纯化及检测 | 第21-22页 |
| 2.3.4 逆转录cDNA第一链的合成 | 第22-23页 |
| 2.4 转录测序样本制备 | 第23-24页 |
| 2.5 转录组测序数据分析 | 第24-26页 |
| 2.5.1 序列的拼接与组装 | 第24-25页 |
| 2.5.2 Unigene功能注释及分析 | 第25-26页 |
| 2.6 结果分析 | 第26-34页 |
| 2.6.1 香菇总RNA的提取和逆转录结果 | 第26-27页 |
| 2.6.2 转录组测序组装结果及分析 | 第27-28页 |
| 2.6.3 香菇子实体转录组的功能注释 | 第28-29页 |
| 2.6.4 香菇子实体转录组的GO分类 | 第29页 |
| 2.6.5 香菇子实体转录组COG分类 | 第29-31页 |
| 2.6.6 香菇子实体转录组KEGG分类 | 第31-32页 |
| 2.6.7 CDS统计结果分析 | 第32-34页 |
| 2.7 本章小结 | 第34-35页 |
| 第3章 实时定量内参基因筛选与细胞壁分解相关基因表达变化 | 第35-49页 |
| 3.1 试剂与仪器 | 第35-36页 |
| 3.1.1 试剂 | 第35页 |
| 3.1.2 仪器 | 第35-36页 |
| 3.2 cDNA第一链的合成 | 第36页 |
| 3.3 内参基因的选择与荧光定量实验 | 第36-39页 |
| 3.3.1 内参基因序列的选择 | 第37页 |
| 3.3.2 内参基因序列的引物设计 | 第37页 |
| 3.3.3 内参基因引物特异性验证 | 第37-38页 |
| 3.3.4 内参基因标准曲线的制作 | 第38-39页 |
| 3.4 细胞壁分解相关基因的选择与荧光定量 | 第39页 |
| 3.4.1 细胞壁分解相关基因序列筛选及引物设计 | 第39页 |
| 3.4.2 细胞壁分解相关基因荧光定量引物特异性验证 | 第39页 |
| 3.5 结果分析 | 第39-46页 |
| 3.5.1 内参基因的结果分析 | 第39-42页 |
| 3.5.2 细胞壁降解相关基因的结果分析 | 第42-46页 |
| 3.6 本章小结 | 第46-49页 |
| 参考文献 | 第49-52页 |
| 致谢 | 第52-53页 |
| 参与科研项目 | 第53页 |
| 发表论文 | 第53页 |