| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 第一章 引言 | 第11-22页 |
| 1.1 研究背景和意义 | 第11-13页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第13-19页 |
| 1.2.1 植物黄萎病致病机理研究现状 | 第13页 |
| 1.2.2 植物抗黄萎病机理研究现状 | 第13-14页 |
| 1.2.3 转录组测序技术研究概述 | 第14-18页 |
| 1.2.4 RNA-Seq在植物抗病机制研究中的应用现状 | 第18-19页 |
| 1.3 论文的组织结构和创新点 | 第19-22页 |
| 1.3.1 论文组织结构 | 第19-20页 |
| 1.3.2 技术路线 | 第20-21页 |
| 1.3.3 论文创新点 | 第21-22页 |
| 第二章 黄萎病菌胁迫下向日葵品种S18、P77的生理生化指标响应及抗病性鉴定 | 第22-34页 |
| 2.1 引言 | 第22-24页 |
| 2.2 实验材料 | 第24页 |
| 2.2.1 植物材料及菌种 | 第24页 |
| 2.2.2 主要试剂 | 第24页 |
| 2.2.3 主要仪器设备 | 第24页 |
| 2.3 实验方法 | 第24-28页 |
| 2.3.1 植物材料和菌培养及接菌 | 第24-25页 |
| 2.3.2 抗病性鉴定 | 第25-26页 |
| 2.3.3 取样方法 | 第26页 |
| 2.3.4 生理生化指标测定方法 | 第26-28页 |
| 2.4 结果与分析 | 第28-31页 |
| 2.4.1 抗病性检测结果 | 第28页 |
| 2.4.2 生理生化指标测定结果 | 第28-31页 |
| 2.5 讨论 | 第31-32页 |
| 2.5.1 抗病性鉴定 | 第31页 |
| 2.5.2 病原菌侵染下植物生理生化响应 | 第31-32页 |
| 2.6 小结 | 第32-34页 |
| 第三章 黄萎病胁迫下向日葵转录组测序及功能注释 | 第34-47页 |
| 3.1 引言 | 第34-35页 |
| 3.2 实验材料 | 第35-36页 |
| 3.2.1 植物材料及菌种 | 第35页 |
| 3.2.2 主要试剂 | 第35页 |
| 3.2.3 主要仪器设备 | 第35-36页 |
| 3.3 实验方法 | 第36-40页 |
| 3.3.1 RNA制备 | 第36-37页 |
| 3.3.2 转录组测序与数据处理 | 第37-40页 |
| 3.4 结果与分析 | 第40-45页 |
| 3.4.1 RNA样本质量检测结果 | 第40-41页 |
| 3.4.2 RNA-Seq测序结果 | 第41-42页 |
| 3.4.3 基因表达量计算及功能注释 | 第42-45页 |
| 3.5 讨论 | 第45页 |
| 3.6 小结 | 第45-47页 |
| 第四章 向日葵响应黄萎病侵染的差异表达基因筛选与分析 | 第47-68页 |
| 4.1 引言 | 第47页 |
| 4.2 研究材料 | 第47-48页 |
| 4.2.1 数据材料 | 第47-48页 |
| 4.2.2 主要仪器设备 | 第48页 |
| 4.3 研究方法 | 第48-50页 |
| 4.3.1 主成分分析和条件特异表达分析 | 第48-49页 |
| 4.3.2 差异表达基因(DEGs)筛选 | 第49页 |
| 4.3.3 差异表达基因GO功能注释与KEGG通路分析 | 第49页 |
| 4.3.4 抗黄萎病相关DEGs共表达网络构建 | 第49-50页 |
| 4.4 结果与分析 | 第50-65页 |
| 4.4.1 主成分分析和条件特异表达分析结果 | 第50-51页 |
| 4.4.2 SCK与PCK间DEGs筛选及功能注释 | 第51-52页 |
| 4.4.3 病原菌诱导下样品DEGs筛选与功能注释 | 第52-56页 |
| 4.4.4 品种间共表达模式DEGs分析 | 第56-58页 |
| 4.4.5 品种间特异表达模式下DEGs分析 | 第58-60页 |
| 4.4.6 向日葵抗黄萎病相关DEGs的KEGG通路分析 | 第60-65页 |
| 4.4.7 抗黄萎病相关DEGs共表达网络调控研究 | 第65页 |
| 4.5 讨论 | 第65-66页 |
| 4.6 小结 | 第66-68页 |
| 第五章 向日葵抗黄萎病差异表达基因的q-PCR验证 | 第68-75页 |
| 5.1 引言 | 第68页 |
| 5.2 实验材料 | 第68-69页 |
| 5.2.1 植物材料 | 第68页 |
| 5.2.2 主要试剂 | 第68-69页 |
| 5.2.3 主要仪器设备 | 第69页 |
| 5.3 实验方法 | 第69-71页 |
| 5.3.1 RNA提取 | 第69-70页 |
| 5.3.2 qRCR反应体系及程序 | 第70-71页 |
| 5.4 结果与分析 | 第71-74页 |
| 5.4.1 RNA提取结果 | 第71页 |
| 5.4.2 qPCR验证结果 | 第71-74页 |
| 5.5 讨论 | 第74页 |
| 5.6 小结 | 第74-75页 |
| 第六章 总结与展望 | 第75-78页 |
| 6.1 本论文工作总结 | 第75-76页 |
| 6.2 工作展望 | 第76-78页 |
| 参考文献 | 第78-90页 |
| 附录1 RNA样品质量检验和测序质量评估 | 第90-92页 |
| 附录2 差异表达基因筛选及KEGG通路分析 | 第92-97页 |
| 附录3 q-PCR反应引物序列信息、18S序列信息及溶解曲线 | 第97-100页 |
| 致谢 | 第100-102页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第102-103页 |
