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猕猴桃病毒种类鉴定及分子特性研究

摘要第6-8页
ABSTRACT第8-9页
缩略语表第10-11页
第一章 文献综述第11-20页
    1.1 AcVA和AcVB的研究进展第13-15页
        1.1.1 分类地位第13页
        1.1.2 分布、危害特点及生物学特性第13页
        1.1.3 AcVA和AcVB的基因组序列特点第13-15页
    1.2 Emaravirus属病毒的生物学和分子特性第15-18页
        1.2.1 分类地位第15-16页
        1.2.2 生物学特性第16页
        1.2.3 EMARaV的基因组结构第16-18页
    1.3 高通量sRNA测序技术的应用第18-19页
    1.4 研究目的与意义第19-20页
第二章 猕猴桃病毒A和B的RT-PCR检测及分子变异研究第20-31页
    2.1 试验材料第20页
        2.1.1 样品来源第20页
        2.1.2 研究所用主要试剂第20页
    2.2 试验方法第20-24页
        2.2.1 引物设计与合成第20-21页
        2.2.2 总RNA的提取第21-22页
        2.2.3 RT-PCR第22页
        2.2.4 琼脂糖凝胶电泳第22页
        2.2.5 PCR扩增产物的回收第22-23页
        2.2.6 DNA片段的连接第23页
        2.2.7 大肠杆菌热击感受态细胞的制备第23页
        2.2.8 DNA片段的连接第23页
        2.2.9 热击转化第23-24页
        2.2.10 重组质粒的阳性鉴定及序列测定第24页
        2.2.11 序列分析所用软件第24页
    2.3 结果与分析第24-30页
        2.3.1 RT-PCR检测结果第24-25页
        2.3.2 AcVA的ORF1、ORF4 和ORF5 扩增产物序列分析第25-28页
        2.3.3 AcVB的ORF5 扩增产物序列分析第28-30页
    2.4 小结与讨论第30-31页
第三章 ACRaV全基因组序列测定及分析第31-55页
    3.1 试验材料第31-32页
    3.2 研究方法第32-38页
        3.2.1 RNA的提取和sRNA测序第32页
        3.2.2 ACRaV全基因组扩增策略第32-33页
        3.2.3 RT-PCR第33-37页
        3.2.4 ACRaV全基因组序列分析第37-38页
    3.3 结果与分析第38-53页
        3.3.1 ACRaV全基因组序列测定第38页
        3.3.2 ACRaV基因组序列第38-41页
        3.3.3 ACRaV的基因组结构第41-45页
        3.3.4 系统进化分析第45-47页
        3.3.5 病毒粒子的形态观察第47-48页
        3.3.6 来源于ACRaV的sRNA分析第48-51页
        3.3.7 特异性RT-PCR的建立第51-53页
    3.4 小结与讨论第53-55页
第四章 全文总结与展望第55-56页
参考文献第56-60页
附录A 常用溶液配方第60-61页
附录B RT-PCR方法检测猕猴桃样品三种病毒结果统计第61-64页
附录C 部分猕猴桃样品症状图第64-65页
附录D 硕士研究期间发表的文章第65-66页
致谢第66页

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