摘要 | 第6-8页 |
ABSTRACT | 第8-9页 |
缩略语表 | 第10-11页 |
第一章 文献综述 | 第11-20页 |
1.1 AcVA和AcVB的研究进展 | 第13-15页 |
1.1.1 分类地位 | 第13页 |
1.1.2 分布、危害特点及生物学特性 | 第13页 |
1.1.3 AcVA和AcVB的基因组序列特点 | 第13-15页 |
1.2 Emaravirus属病毒的生物学和分子特性 | 第15-18页 |
1.2.1 分类地位 | 第15-16页 |
1.2.2 生物学特性 | 第16页 |
1.2.3 EMARaV的基因组结构 | 第16-18页 |
1.3 高通量sRNA测序技术的应用 | 第18-19页 |
1.4 研究目的与意义 | 第19-20页 |
第二章 猕猴桃病毒A和B的RT-PCR检测及分子变异研究 | 第20-31页 |
2.1 试验材料 | 第20页 |
2.1.1 样品来源 | 第20页 |
2.1.2 研究所用主要试剂 | 第20页 |
2.2 试验方法 | 第20-24页 |
2.2.1 引物设计与合成 | 第20-21页 |
2.2.2 总RNA的提取 | 第21-22页 |
2.2.3 RT-PCR | 第22页 |
2.2.4 琼脂糖凝胶电泳 | 第22页 |
2.2.5 PCR扩增产物的回收 | 第22-23页 |
2.2.6 DNA片段的连接 | 第23页 |
2.2.7 大肠杆菌热击感受态细胞的制备 | 第23页 |
2.2.8 DNA片段的连接 | 第23页 |
2.2.9 热击转化 | 第23-24页 |
2.2.10 重组质粒的阳性鉴定及序列测定 | 第24页 |
2.2.11 序列分析所用软件 | 第24页 |
2.3 结果与分析 | 第24-30页 |
2.3.1 RT-PCR检测结果 | 第24-25页 |
2.3.2 AcVA的ORF1、ORF4 和ORF5 扩增产物序列分析 | 第25-28页 |
2.3.3 AcVB的ORF5 扩增产物序列分析 | 第28-30页 |
2.4 小结与讨论 | 第30-31页 |
第三章 ACRaV全基因组序列测定及分析 | 第31-55页 |
3.1 试验材料 | 第31-32页 |
3.2 研究方法 | 第32-38页 |
3.2.1 RNA的提取和sRNA测序 | 第32页 |
3.2.2 ACRaV全基因组扩增策略 | 第32-33页 |
3.2.3 RT-PCR | 第33-37页 |
3.2.4 ACRaV全基因组序列分析 | 第37-38页 |
3.3 结果与分析 | 第38-53页 |
3.3.1 ACRaV全基因组序列测定 | 第38页 |
3.3.2 ACRaV基因组序列 | 第38-41页 |
3.3.3 ACRaV的基因组结构 | 第41-45页 |
3.3.4 系统进化分析 | 第45-47页 |
3.3.5 病毒粒子的形态观察 | 第47-48页 |
3.3.6 来源于ACRaV的sRNA分析 | 第48-51页 |
3.3.7 特异性RT-PCR的建立 | 第51-53页 |
3.4 小结与讨论 | 第53-55页 |
第四章 全文总结与展望 | 第55-56页 |
参考文献 | 第56-60页 |
附录A 常用溶液配方 | 第60-61页 |
附录B RT-PCR方法检测猕猴桃样品三种病毒结果统计 | 第61-64页 |
附录C 部分猕猴桃样品症状图 | 第64-65页 |
附录D 硕士研究期间发表的文章 | 第65-66页 |
致谢 | 第66页 |