致谢 | 第4-10页 |
摘要 | 第10-12页 |
1 文献综述 | 第12-20页 |
1.1 DGAT2基因的研究进展 | 第13-14页 |
1.1.1 DGAT2基因 | 第13页 |
1.1.2 DGAT2对脂肪代谢的影响 | 第13页 |
1.1.3 DGAT2对生长性状的影响 | 第13-14页 |
1.2 DNA分子标记 | 第14页 |
1.3 单核苷酸多态性研究进展 | 第14-16页 |
1.3.1 SNP特性 | 第14页 |
1.3.2 SNP的检测方法 | 第14-15页 |
1.3.2.1 聚合酶链反应一单链构象多态性 | 第14-15页 |
1.3.2.2 直接测序技术 | 第15页 |
1.3.2.3 限制性片段长度多态性聚合酶链反应 | 第15页 |
1.3.2.4 创造酶切位点 | 第15页 |
1.3.2.5 DNA芯片 | 第15页 |
1.3.3 SNP在家禽遗传育种中的研究进展 | 第15-16页 |
1.4 拷贝数变异的研究进展 | 第16-19页 |
1.4.1 拷贝数变异的形成机制 | 第16-17页 |
1.4.2 拷贝数变异的作用机制 | 第17页 |
1.4.3 拷贝数变异的检测方法 | 第17-18页 |
1.4.3.1 aCGH技术 | 第17页 |
1.4.3.2 SNP芯片技术 | 第17-18页 |
1.4.3.3 二代测序技术 | 第18页 |
1.4.4 拷贝数变异的剂量效应 | 第18页 |
1.4.4.1 基因剂量效应的定义 | 第18页 |
1.4.4.2 基因剂量效应对表型的影响 | 第18页 |
1.4.5 拷贝数变异在家禽中的研究进展 | 第18-19页 |
1.4.6 拷贝数变异对家禽表型性状的影响 | 第19页 |
1.5 本研究的目的和意义 | 第19-20页 |
2 引言 | 第20-21页 |
3 DGAT2基因在固始鸡不同发育时期的组织表达特性 | 第21-27页 |
3.1 试验材料 | 第21页 |
3.1.1 试验动物及样品采集 | 第21页 |
3.1.2 试验主要试剂及配制 | 第21页 |
3.1.3 试验主要仪器 | 第21页 |
3.2 试验方法 | 第21-23页 |
3.2.1 总RNA的提取 | 第21-22页 |
3.2.2 RNA质量检测 | 第22页 |
3.2.3 反转录 | 第22-23页 |
3.2.4 荧光定量PCR引物设计 | 第23页 |
3.2.5 荧光定量PCR反应 | 第23页 |
3.2.6 数据分析 | 第23页 |
3.3 结果分析 | 第23-25页 |
3.3.1 总RNA质量检测 | 第23-24页 |
3.3.2 鸡DGAT2基因在固始鸡不同发育时期的组织表达特性 | 第24-25页 |
3.4 讨论 | 第25-26页 |
3.5 小结 | 第26-27页 |
4 鸡DGAT2基因第7外显子多态性与生产性能的关联 | 第27-37页 |
4.1 试验材料 | 第27-28页 |
4.1.1 研究群体 | 第27页 |
4.1.2 测定指标 | 第27页 |
4.1.3 试验主要试剂及配制 | 第27-28页 |
4.1.4 试验主要仪器 | 第28页 |
4.2 试验方法 | 第28-30页 |
4.2.1 引物合成 | 第28-29页 |
4.2.2 DGAT2基因扩增 | 第29页 |
4.2.3 酶切反应 | 第29页 |
4.2.4 数据处理 | 第29-30页 |
4.3 结果与分析 | 第30-35页 |
4.3.1 鸡DGAT2基因突变筛选 | 第30页 |
4.3.2 鸡DGAT2基因突变位点分型 | 第30页 |
4.3.3 鸡DGAT2基因突变位点经判型后测序验证 | 第30-31页 |
4.3.4 鸡DGAT2基因突变位点基因型频率和基因频率 | 第31页 |
4.3.5 鸡DGAT2基因型与资源群经济性状关联分析 | 第31-35页 |
4.3.5.1 鸡DGAT2基因g.13955C>T位点与生长性状的关联分析 | 第31-32页 |
4.3.5.2 鸡DGAT2基因g.13955C>T位点与肉质、脂肪性状的关联分析 | 第32-33页 |
4.3.5.3 鸡DGAT2基因g.13955C>T位点与屠体性状、肌纤维性状和血液生化指标的关联分析 | 第33-35页 |
4.4 讨论 | 第35-36页 |
4.5 小结 | 第36-37页 |
5 DGAT2基因拷贝数变异基因剂量效应研究 | 第37-50页 |
5.1 试验材料 | 第37页 |
5.1.1 试验动物和样品稀释 | 第37页 |
5.1.2 F_2代资源群及测量指标 | 第37页 |
5.2 试验方法 | 第37-39页 |
5.2.1 血样基因组DNA提取与检测 | 第37-38页 |
5.2.2 引物设计与合成 | 第38页 |
5.2.3 Q-PCR反应体系与程序 | 第38页 |
5.2.4 标准曲线的制作 | 第38-39页 |
5.2.5 试验数据分析 | 第39页 |
5.3 结果分析 | 第39-47页 |
5.3.1 引物标准曲线的绘制 | 第39-40页 |
5.3.1.1 引物溶解曲线 | 第39-40页 |
5.3.1.2 引物标准曲线的制作 | 第40页 |
5.3.2 不同品种鸡在DGAT2位点的相对拷贝数 | 第40-41页 |
5.3.3 DGAT2拷贝数变异与组织表达的影响 | 第41-42页 |
5.3.4 DGAT2基因拷贝数变异对固始鸡-安卡鸡F2代资源群经济性状的关联分析 | 第42-47页 |
5.3.4.1 DGAT2基因拷贝数变异对固始-安卡鸡F_2代资源群生长性状的影响 | 第42-44页 |
5.3.4.2 DGAT2基因拷贝数变异对固始-安卡鸡F_2代资源群屠体性状的影响 | 第44页 |
5.3.4.3 DGAT2基因拷贝数变异对固始-安卡鸡F_2代资源群血液生化指标的影响 | 第44-45页 |
5.3.4.4 DGAT2基因拷贝数变异对固始-安卡鸡F_2代资源群肉质性状的影响 | 第45-46页 |
5.3.4.5 DGAT2基因拷贝数变异对固始-安卡鸡F_2代资源群肌纤维性状的影响 | 第46-47页 |
5.4 讨论 | 第47-49页 |
5.4.1 DGAT2基因拷贝数变异的验证 | 第47页 |
5.4.2 拷贝数的分析方法 | 第47-48页 |
5.4.3 拷贝数变异与生产性状的关联分析 | 第48-49页 |
5.5 小结 | 第49-50页 |
6 全文总结 | 第50-51页 |
参考文献 | 第51-59页 |
ABSTRACT | 第59-61页 |