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鸡DGAT2基因组织表达特性及其SNP、CNV遗传效应分析

致谢第4-10页
摘要第10-12页
1 文献综述第12-20页
    1.1 DGAT2基因的研究进展第13-14页
        1.1.1 DGAT2基因第13页
        1.1.2 DGAT2对脂肪代谢的影响第13页
        1.1.3 DGAT2对生长性状的影响第13-14页
    1.2 DNA分子标记第14页
    1.3 单核苷酸多态性研究进展第14-16页
        1.3.1 SNP特性第14页
        1.3.2 SNP的检测方法第14-15页
            1.3.2.1 聚合酶链反应一单链构象多态性第14-15页
            1.3.2.2 直接测序技术第15页
            1.3.2.3 限制性片段长度多态性聚合酶链反应第15页
            1.3.2.4 创造酶切位点第15页
            1.3.2.5 DNA芯片第15页
        1.3.3 SNP在家禽遗传育种中的研究进展第15-16页
    1.4 拷贝数变异的研究进展第16-19页
        1.4.1 拷贝数变异的形成机制第16-17页
        1.4.2 拷贝数变异的作用机制第17页
        1.4.3 拷贝数变异的检测方法第17-18页
            1.4.3.1 aCGH技术第17页
            1.4.3.2 SNP芯片技术第17-18页
            1.4.3.3 二代测序技术第18页
        1.4.4 拷贝数变异的剂量效应第18页
            1.4.4.1 基因剂量效应的定义第18页
            1.4.4.2 基因剂量效应对表型的影响第18页
        1.4.5 拷贝数变异在家禽中的研究进展第18-19页
        1.4.6 拷贝数变异对家禽表型性状的影响第19页
    1.5 本研究的目的和意义第19-20页
2 引言第20-21页
3 DGAT2基因在固始鸡不同发育时期的组织表达特性第21-27页
    3.1 试验材料第21页
        3.1.1 试验动物及样品采集第21页
        3.1.2 试验主要试剂及配制第21页
        3.1.3 试验主要仪器第21页
    3.2 试验方法第21-23页
        3.2.1 总RNA的提取第21-22页
        3.2.2 RNA质量检测第22页
        3.2.3 反转录第22-23页
        3.2.4 荧光定量PCR引物设计第23页
        3.2.5 荧光定量PCR反应第23页
        3.2.6 数据分析第23页
    3.3 结果分析第23-25页
        3.3.1 总RNA质量检测第23-24页
        3.3.2 鸡DGAT2基因在固始鸡不同发育时期的组织表达特性第24-25页
    3.4 讨论第25-26页
    3.5 小结第26-27页
4 鸡DGAT2基因第7外显子多态性与生产性能的关联第27-37页
    4.1 试验材料第27-28页
        4.1.1 研究群体第27页
        4.1.2 测定指标第27页
        4.1.3 试验主要试剂及配制第27-28页
        4.1.4 试验主要仪器第28页
    4.2 试验方法第28-30页
        4.2.1 引物合成第28-29页
        4.2.2 DGAT2基因扩增第29页
        4.2.3 酶切反应第29页
        4.2.4 数据处理第29-30页
    4.3 结果与分析第30-35页
        4.3.1 鸡DGAT2基因突变筛选第30页
        4.3.2 鸡DGAT2基因突变位点分型第30页
        4.3.3 鸡DGAT2基因突变位点经判型后测序验证第30-31页
        4.3.4 鸡DGAT2基因突变位点基因型频率和基因频率第31页
        4.3.5 鸡DGAT2基因型与资源群经济性状关联分析第31-35页
            4.3.5.1 鸡DGAT2基因g.13955C>T位点与生长性状的关联分析第31-32页
            4.3.5.2 鸡DGAT2基因g.13955C>T位点与肉质、脂肪性状的关联分析第32-33页
            4.3.5.3 鸡DGAT2基因g.13955C>T位点与屠体性状、肌纤维性状和血液生化指标的关联分析第33-35页
    4.4 讨论第35-36页
    4.5 小结第36-37页
5 DGAT2基因拷贝数变异基因剂量效应研究第37-50页
    5.1 试验材料第37页
        5.1.1 试验动物和样品稀释第37页
        5.1.2 F_2代资源群及测量指标第37页
    5.2 试验方法第37-39页
        5.2.1 血样基因组DNA提取与检测第37-38页
        5.2.2 引物设计与合成第38页
        5.2.3 Q-PCR反应体系与程序第38页
        5.2.4 标准曲线的制作第38-39页
        5.2.5 试验数据分析第39页
    5.3 结果分析第39-47页
        5.3.1 引物标准曲线的绘制第39-40页
            5.3.1.1 引物溶解曲线第39-40页
            5.3.1.2 引物标准曲线的制作第40页
        5.3.2 不同品种鸡在DGAT2位点的相对拷贝数第40-41页
        5.3.3 DGAT2拷贝数变异与组织表达的影响第41-42页
        5.3.4 DGAT2基因拷贝数变异对固始鸡-安卡鸡F2代资源群经济性状的关联分析第42-47页
            5.3.4.1 DGAT2基因拷贝数变异对固始-安卡鸡F_2代资源群生长性状的影响第42-44页
            5.3.4.2 DGAT2基因拷贝数变异对固始-安卡鸡F_2代资源群屠体性状的影响第44页
            5.3.4.3 DGAT2基因拷贝数变异对固始-安卡鸡F_2代资源群血液生化指标的影响第44-45页
            5.3.4.4 DGAT2基因拷贝数变异对固始-安卡鸡F_2代资源群肉质性状的影响第45-46页
            5.3.4.5 DGAT2基因拷贝数变异对固始-安卡鸡F_2代资源群肌纤维性状的影响第46-47页
    5.4 讨论第47-49页
        5.4.1 DGAT2基因拷贝数变异的验证第47页
        5.4.2 拷贝数的分析方法第47-48页
        5.4.3 拷贝数变异与生产性状的关联分析第48-49页
    5.5 小结第49-50页
6 全文总结第50-51页
参考文献第51-59页
ABSTRACT第59-61页

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