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公绵羊精液品质相关基因群体遗传效应研究

致谢第4-10页
摘要第10-12页
英文缩略词表第12-13页
1 文献综述第13-26页
    1.1 主要肉用型绵羊品种简介第13-14页
        1.1.1 杜泊羊第13页
        1.1.2 萨福克羊第13-14页
        1.1.3 白萨福克羊第14页
        1.1.4 无角道赛特羊第14页
    1.2 绵羊繁殖力及其候选基因第14页
    1.3 绵羊精液品质性状相关基因多态性研究第14-25页
        1.3.1 FSHR基因第15页
        1.3.2 AR基因第15-16页
        1.3.3 LHCGR基因第16-17页
        1.3.4 MBL2基因第17页
        1.3.5 EPPIN基因第17-18页
        1.3.6 INH基因第18页
        1.3.7 CYP19基因第18-19页
        1.3.8 HSP70基因第19-20页
        1.3.9 BMP7基因第20-21页
        1.3.10 AQP7基因第21-22页
        1.3.11 TRIM基因第22-23页
        1.3.12 CFTR基因第23页
        1.3.13 CAPN基因第23-24页
        1.3.14 ID2基因第24页
        1.3.15 CD4基因第24-25页
    1.4 本研究总体目标第25-26页
2 引言第26-27页
3 试验一 29个候选基因中重要SNP对公绵羊精液品质性状的遗传效应分析第27-60页
    3.1 试验材料第27-29页
        3.1.1 试验样品采集第27页
        3.1.2 试验仪器设备第27-28页
        3.1.3 试验试剂第28页
        3.1.4 溶液配制第28页
        3.1.5 分析工具第28-29页
    3.2 试验方法第29-36页
        3.2.1 绵羊血液基因组DNA的提取第29页
        3.2.2 DNA样品的纯度与浓度检测第29页
        3.2.3 引物设计第29-31页
            3.2.3.1 引物稀释第30页
            3.2.3.2 注意事项第30-31页
        3.2.5 PCR扩增、检测第31-32页
            3.2.5.1 PCR扩增第31页
            3.2.5.2 PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测第31页
            3.2.5.3 PCR产物纯化第31-32页
        3.2.6 Sequenom MassArray基因分型第32页
        3.2.7 种公羊精液品质指标测定第32-33页
        3.2.8 统计分析第33-36页
            3.2.8.1 基因频率第33页
            3.2.8.2 基因型频率第33页
            3.2.8.3 群体遗传杂合度第33页
            3.2.8.4 有效等位基因数第33页
            3.2.8.5 多态信息含量第33-34页
            3.2.8.6 群体哈代-温伯格平衡第34页
            3.2.8.7 变异位点与精液品质性状的关联分析第34页
            3.2.8.8 连锁不平衡与单体型分析第34-35页
            3.2.8.9 标签SNP的分析步骤第35页
            3.2.8.10 单倍体型与精液品质性状关联的回归分析步骤第35-36页
    3.3 试验结果与分析第36-54页
        3.3.1 全血基因组DNA提取结果与分析第36页
        3.3.2 各候选基因重要SNP位点的群体遗传分析第36-39页
            3.3.2.1 FSHR(rs398233545)位点遗传变异分析第37页
            3.3.2.2 LHCGR(rs398733991)位点遗传变异分析第37-38页
            3.3.2.3 MBL2(rs401909751)位点遗传变异分析第38页
            3.3.2.4 CD4(rs403107881)位点遗传变异分析第38-39页
            3.3.2.5 ID2(rs420477086)位点遗传变异分析第39页
        3.3.3 各候选基因重要SNP与精液品质性状的关联性分析第39-45页
            3.3.3.1 FSHR(rs398233545)基因型与公羊精液品质关联分析第39-40页
            3.3.3.2 LHCGR(rs398733991)基因型与公羊精液品质关联分析第40页
            3.3.3.3 MBL2(rs401909751)基因型与公羊精液品质关联分析第40-42页
            3.3.3.4 CD4(rs403107881)基因型与公羊精液品质关联分析第42页
            3.3.3.5 ID2(rs420477086)基因型与公羊精液品质关联分析第42-45页
        3.3.4 5个SNP单体型分析第45-49页
            3.3.4.1 合并群体单倍体型分析第45-46页
            3.3.4.2 各品种群体单倍体型分析第46-49页
            3.3.4.3 合并群体中单倍体型标签SNP检测第49页
        3.3.5 单倍体型与公绵羊精液品质性状的关联分析第49-54页
            3.3.5.1 单倍体型与公绵羊精液量的关联分析第49-51页
            3.3.5.2 单倍体型与公绵羊精子活力的关联分析第51-52页
            3.3.5.3 单倍体型与公绵羊精子路径速度的关联分析第52-54页
    3.4 讨论与小结第54-60页
        3.4.1 公绵羊精液品质性状影响因素第54页
        3.4.2 种公羊FSHR、LHCGR、MBL2、CD4、ID2基因群体遗传性状分析第54-57页
            3.4.2.1 FSHR基因SNP位点多态性与精液品质性状关联分析第54-55页
            3.4.2.2 LHCGR基因SNP位点多态性与精液品质性状关联分析第55页
            3.4.2.3 MBL2基因SNP位点多态性与精液品质性状关联分析第55-56页
            3.4.2.4 CD4基因SNP位点多态性与精液品质性状关联分析第56-57页
            3.4.2.5 ID2基因SNP位点多态性与精液品质性状关联分析第57页
        3.4.3 基因偏态第57页
        3.4.4 数量性状单倍体型分析第57-58页
        3.4.5 小结第58-60页
            3.4.4.1 四个品种公羊29个SNP位点基因分型结果第58页
            3.4.4.2 试验群体单基因效应分析第58-60页
4 试验二 公绵羊血清生化指标与精液品质相关分析第60-71页
    4.1 材料与方法第60-66页
        4.1.1 试验材料第60页
        4.1.2 试验方法第60-66页
            4.1.2.1 血清钙测定方法(偶氮胂Ⅲ法)第60页
            4.1.2.2 血清磷测定方法(磷钼酸盐法)第60-61页
            4.1.2.3 血清镁测定方法(二甲苯胺蓝法)第61-62页
            4.1.2.4 葡萄糖测定方法(葡萄糖氧化酶法)第62-63页
            4.1.2.5 尿素测定方法(尿素酶-谷氨酰脱氢酶法)第63-64页
            4.1.2.6 天门冬氨酸氨基转移酶测定(天门冬氨酸底物法)第64-65页
            4.1.2.7 丙氨酸氨基转移酶测定方法(丙氨酸底物法)第65-66页
        4.1.3 试验数据统计分析第66页
    4.2 结果与分析第66-68页
        4.2.1 不同品种公羊血清生化指标和精液品质各指标的分析第66页
        4.2.2 公羊血清生化指标与精液品质指标相关分析第66-68页
    4.3 讨论与小结第68-71页
        4.3.1 计算机辅助精液分析系统第68页
        4.3.2 不同品种公羊血清生化指标和精液品质指标的分析第68-69页
        4.3.3 试验总群体血清生化指标与精液品质指标的相关分析第69页
        4.3.4 小结第69-71页
5 总结展望与创新点第71-74页
参考文献第74-81页
ABSTRACT第81-83页

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