| 摘要 | 第8-12页 |
| ABSTRACT | 第12-16页 |
| 缩略词表 | 第17-20页 |
| 第一章 文献综述 | 第20-42页 |
| 1 引言 | 第20页 |
| 2 农药异丙隆的概况 | 第20-24页 |
| 2.1 异丙隆的理化特性 | 第20-21页 |
| 2.2 异丙隆的作用机理、使用现状及环境来源 | 第21-22页 |
| 2.3 异丙隆的生态毒性 | 第22-23页 |
| 2.4 异丙隆的代谢和矿化 | 第23-24页 |
| 3 农药阿特拉津的概况 | 第24-27页 |
| 3.1 阿特拉津的理化特性 | 第24页 |
| 3.2 阿特拉津的作用机理、使用现状及环境来源 | 第24-25页 |
| 3.3 阿特拉津的生态毒性 | 第25-26页 |
| 3.4 阿特拉津的代谢和矿化 | 第26-27页 |
| 4 植物对农药的代谢和解毒 | 第27-29页 |
| 5 农药在土壤中的降解 | 第29-31页 |
| 5.1 微生物降解 | 第29-30页 |
| 5.2 协同降解代谢 | 第30-31页 |
| 6 水杨酸概况 | 第31-36页 |
| 6.1 水杨酸的信号转导和转运 | 第33页 |
| 6.2 水杨酸与植物的抗逆性 | 第33-36页 |
| 7 DNA甲基化与植物抗逆性 | 第36-39页 |
| 7.1 植物基因组中DNA甲基化的形成和维持 | 第36-38页 |
| 7.2 逆境胁迫下植物基因组DNA甲基化修饰 | 第38-39页 |
| 8 选题依据、目的及意义 | 第39-40页 |
| 9 研究内容 | 第40-42页 |
| 第二章 水稻幼苗对异丙隆的毒性反应 | 第42-52页 |
| 1 材料 | 第43-44页 |
| 1.1 供试材料 | 第43页 |
| 1.2 试剂与仪器 | 第43-44页 |
| 2 实验方法 | 第44-48页 |
| 2.1 水稻种子萌发及幼苗的培养和处理 | 第44-45页 |
| 2.2 水稻幼苗株高和根长的测定 | 第45页 |
| 2.3 丙二醛含量的测定 | 第45页 |
| 2.4 总叶绿素含量的测定 | 第45页 |
| 2.5 水稻幼苗组织中质膜稳定性的测定 | 第45页 |
| 2.6 抗氧化酶活力的测定 | 第45-47页 |
| 2.7 水稻幼苗组织中异丙隆积累量的测定 | 第47-48页 |
| 2.8 数据处理与统计分析 | 第48页 |
| 3 结果与讨论 | 第48-51页 |
| 3.1 异丙隆对水稻幼苗组织中丙二醛含量的影响 | 第48-49页 |
| 3.2 异丙隆对水稻幼苗生长、叶绿素含量以及组织中电导率的影响 | 第49页 |
| 3.3 异丙隆对水稻幼苗组织中抗氧化酶活力的影响 | 第49-50页 |
| 3.4 水稻组织中异丙隆积累量的测定 | 第50-51页 |
| 4 本章小结 | 第51-52页 |
| 第三章 异丙隆处理下水稻差异转录组及代谢分析 | 第52-90页 |
| 1 材料 | 第53页 |
| 1.1 供试材料 | 第53页 |
| 1.2 仪器与试剂 | 第53页 |
| 2 实验方法 | 第53-63页 |
| 2.1 水稻种子萌发及幼苗的培养和处理 | 第53-54页 |
| 2.2 水稻组织中总RNA的提取 | 第54页 |
| 2.3 转录组(RNA-Seq)测序实验方法 | 第54-55页 |
| 2.4 RNA-Seq数据处理与分析 | 第55-58页 |
| 2.5 实时荧光定量PCR | 第58-59页 |
| 2.6 参与外源物解毒过程相关基因的顺式作用元件及转录因子的预测 | 第59页 |
| 2.7 解毒酶活力测定 | 第59-61页 |
| 2.8 水稻幼苗组织中异丙隆积累量的测定 | 第61-62页 |
| 2.9 水稻幼苗组织中异丙隆代谢物及缀合物的鉴定 | 第62-63页 |
| 3 结果与讨论 | 第63-89页 |
| 3.1 样品总RNA电泳检测 | 第63-64页 |
| 3.2 RNA-Seq质量评估 | 第64-65页 |
| 3.3 文库数据对比分析与差异基因的筛选 | 第65-68页 |
| 3.4 GO功能与Pathway显著性富集分析 | 第68-73页 |
| 3.5 qRT-PCR对RNA-Seq测序结果的验证 | 第73-74页 |
| 3.6 与异丙隆解毒与代谢降解相关差异基因的分析 | 第74-77页 |
| 3.7 参与异丙隆代谢解毒的相关酶活力 | 第77-79页 |
| 3.8 代谢相关表达差异基因的顺式作用元件预测与基因网络分析 | 第79-80页 |
| 3.9 水稻组织中异丙隆积累量的测定及其代谢产物的鉴定 | 第80-89页 |
| 4 本章小结 | 第89-90页 |
| 第四章 外源水杨酸对小麦降解异丙隆的影响 | 第90-110页 |
| 1 材料 | 第91页 |
| 1.1 供试材料 | 第91页 |
| 1.2 试剂与仪器 | 第91页 |
| 2 实验方法 | 第91-93页 |
| 2.1 土壤处理 | 第91页 |
| 2.2 小麦种子萌发及幼苗的培养和处理 | 第91-92页 |
| 2.3 小麦幼苗组织中质膜稳定性的测定 | 第92页 |
| 2.4 小麦幼苗组织中异丙隆代谢产物的提取和测定 | 第92页 |
| 2.5 小麦幼苗组织中异丙隆代谢物及缀合物的鉴定和分析 | 第92-93页 |
| 2.6 小麦幼苗组织内糖基转移酶活力的测定 | 第93页 |
| 2.7 编码糖基转移酶基因的实时荧光定量PCR分析 | 第93页 |
| 2.8 数据处理与统计分析 | 第93页 |
| 3 结果与讨论 | 第93-107页 |
| 3.1 外源水杨酸对异丙隆胁迫下小麦细胞膜渗透性和生长的影响 | 第93-94页 |
| 3.2 小麦幼苗组织内异丙隆降解产物及缀合物的鉴定 | 第94-100页 |
| 3.3 水杨酸对小麦体内异丙隆及其代谢产物积累量的影响 | 第100-103页 |
| 3.4 水杨酸对异丙隆胁迫下小麦糖基转移酶活力及其编码基因转录的影响 | 第103-105页 |
| 3.5 水杨酸作用下小麦体内异丙隆的代谢途径推测 | 第105-107页 |
| 4 本章小结 | 第107-110页 |
| 第五章 外源水杨酸对小麦种植土壤中异丙隆降解的影响 | 第110-138页 |
| 1 材料 | 第111-112页 |
| 1.1 供试材料 | 第111页 |
| 1.2 试剂与仪器 | 第111-112页 |
| 2 实验方法 | 第112-120页 |
| 2.1 土壤处理 | 第112页 |
| 2.2 小麦种子萌发及幼苗的培养和处理 | 第112页 |
| 2.3 土壤采集 | 第112页 |
| 2.4 小麦幼苗中异丙隆的积累量及种植土壤中异丙隆残留量的测定 | 第112-113页 |
| 2.5 土壤酶测定方法 | 第113-115页 |
| 2.6 根际土壤中低分子有机酸的测定 | 第115-116页 |
| 2.7 土壤中微生物有机碳和微生物有机氮含量的测定 | 第116-117页 |
| 2.8 土壤中磷脂脂肪酸的提取和测定 | 第117-119页 |
| 2.9 数据处理与统计分析 | 第119-120页 |
| 3 结果与讨论 | 第120-136页 |
| 3.1 外源水杨酸对土壤中异丙隆降解的影响 | 第120-121页 |
| 3.2 外源水杨酸对小麦根系分泌低分子有机酸的影响 | 第121-123页 |
| 3.3 外源水杨酸和异丙隆处理对土壤微生物有机碳和有机氮的影响 | 第123-124页 |
| 3.4 外源水杨酸对小麦种植土中微生物群落结构的影响 | 第124-127页 |
| 3.5 外源水杨酸对小麦种植土中土壤酶活力的影响 | 第127-129页 |
| 3.6 多因素的主成分与相关矩阵分析 | 第129-131页 |
| 3.7 土壤中异丙隆及其代谢产物的分析 | 第131-135页 |
| 3.8 异丙隆在根际土壤中的代谢途径 | 第135-136页 |
| 4 本章小结 | 第136-138页 |
| 第六章 阿特拉津对水稻全基因组DNA甲基化的影响 | 第138-174页 |
| 1 材料 | 第139-140页 |
| 1.1 供试材料 | 第139页 |
| 1.2 试剂与仪器 | 第139-140页 |
| 2 实验方法 | 第140-148页 |
| 2.1 水稻种子萌发及幼苗的培养和处理 | 第140-141页 |
| 2.2 重亚硫酸盐测序(Bisulfite sequencing,BS-Seq) | 第141-144页 |
| 2.3 转录组(RNA-Seq)测序实验方法 | 第144页 |
| 2.4 RNA-Seq数据处理与分析 | 第144页 |
| 2.5 重亚硫酸盐PCR (bisulfite-PCR,BS-PCR)验证 | 第144-147页 |
| 2.6 半定量PCR和定量PCR分析转录本 | 第147页 |
| 2.7 DNA甲基化抑制剂对阿特拉津处理水稻的表型和生理影响 | 第147页 |
| 2.8 水稻幼苗组织中阿特拉津代谢产物的提取和测定 | 第147-148页 |
| 2.9 数据处理与统计分析 | 第148页 |
| 3 结果与讨论 | 第148-173页 |
| 3.1 阿特拉津处理下水稻基因组甲基化测序 | 第148-151页 |
| 3.2 阿特拉津处理下水稻DNA甲基化模式谱图 | 第151-153页 |
| 3.3 阿特拉津处理对水稻基因整体DNA甲基化模式的影响 | 第153-155页 |
| 3.4 DNA甲基化和转录组数据的联合分析 | 第155-161页 |
| 3.5 阿特拉津对水稻DNA甲基化相关基因表达的影响 | 第161-163页 |
| 3.6 阿特拉津处理对转座子和逆转座子DNA甲基化的影响 | 第163-165页 |
| 3.7 对应答阿特拉津的甲基化和表达量的基因验证 | 第165-167页 |
| 3.8 DNA甲基化抑制剂对水稻生长和阿特拉津积累量及代谢产物的影响 | 第167-171页 |
| 3.9 阿特拉津处理对microRNAs甲基化水平的影响 | 第171-173页 |
| 4 本章小结 | 第173-174页 |
| 参考文献 | 第174-198页 |
| 全文总结 | 第198-200页 |
| 论文创新之处 | 第200页 |
| 论文不足之处 | 第200-202页 |
| 致谢 | 第202-204页 |
| 攻读博士期间发表文章目录 | 第204-206页 |
| 附录 | 第206-223页 |
