基于信息熵理论的基因组特性研究
摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-9页 |
第1章 绪论 | 第9-15页 |
·课题背景 | 第9-11页 |
·研究的目的与意义 | 第11页 |
·基因组特性的研究现状 | 第11-13页 |
·本文的主要研究内容和组织结构 | 第13-15页 |
第2章 信息熵理论基础及在序列分析中的研究现状 | 第15-28页 |
·引言 | 第15页 |
·信息熵理论基础 | 第15-20页 |
·信息的概念 | 第16页 |
·信息熵的定义 | 第16-17页 |
·熵函数的性质 | 第17-18页 |
·共熵与条件熵以及平均交互信息量 | 第18-19页 |
·Rényi 熵 | 第19-20页 |
·信息熵在基因组特性分析中的应用 | 第20-27页 |
·信息熵在基因识别研究中的应用 | 第21-24页 |
·信息熵在功能位点识别研究中应用 | 第24-25页 |
·信息熵在序列相似性分析及进化树构建中的应用 | 第25-26页 |
·信息熵在基因组序列特性分析中的其它一些应用 | 第26页 |
·基因组序列特性分析问题中的信息熵应用总结 | 第26-27页 |
·本章小结 | 第27-28页 |
第3章 基因组翻译起始和终止区域的特性分析 | 第28-51页 |
·引言 | 第28页 |
·数据准备与预处理 | 第28-30页 |
·基因组翻译起始和终止区域的特性分析 | 第30-50页 |
·基因组单碱基位点信息熵分析的算法模型及流程 | 第30-32页 |
·原核生物基因组单碱基位点信息熵分析 | 第32-42页 |
·真核生物基因组单碱基位点信息熵分析 | 第42-46页 |
·原核生物基因组相邻多碱基位点信息熵分析 | 第46-50页 |
·本章小结 | 第50-51页 |
第4章 不同物种基因组序列相似性的分析 | 第51-60页 |
·引言 | 第51页 |
·基于信息熵的序列相似性分析模型 | 第51-53页 |
·序列相似性模型的合理性分析与验证 | 第53-59页 |
·构建相似性矩阵和距离矩阵 | 第53-58页 |
·物种进化树的构建及合理性分析 | 第58-59页 |
·本章小结 | 第59-60页 |
结论 | 第60-62页 |
参考文献 | 第62-68页 |
攻读学位期间发表的论文 | 第68-70页 |
致谢 | 第70页 |