基因表达数据的缺失值估计研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 第1章 绪论 | 第8-15页 |
| ·课题背景及研究的目的和意义 | 第8-10页 |
| ·研究背景 | 第8-9页 |
| ·研究的目的和意义 | 第9-10页 |
| ·国内外发展概况 | 第10-14页 |
| ·基因芯片的研究现状 | 第10页 |
| ·基因表达数据缺失值估计的研究现状 | 第10-11页 |
| ·组蛋白乙酰化影响基因表达的研究现状 | 第11-12页 |
| ·算法评价的研究现状 | 第12-13页 |
| ·聚类算法的研究现状 | 第13-14页 |
| ·本课题的主要研究内容及安排 | 第14-15页 |
| 第2章 基因芯片及评价算法基本理论介绍 | 第15-24页 |
| ·基因芯片原理 | 第15-18页 |
| ·基因芯片数据的预处理 | 第18页 |
| ·对数化 | 第18页 |
| ·数据过滤 | 第18页 |
| ·数据归一化 | 第18页 |
| ·缺失值估计算法的评价算法基本理论 | 第18-23页 |
| ·归一化均方根误差 | 第18-19页 |
| ·类结构的保持度 | 第19-23页 |
| ·基因的差异性表达 | 第23页 |
| ·本章小结 | 第23-24页 |
| 第3章 缺失值估计算法设计 | 第24-37页 |
| ·基于数据集的全局结构角度的方法 | 第24-29页 |
| ·奇异值分解法 | 第24-25页 |
| ·贝叶斯主成分分析法 | 第25-29页 |
| ·基于数据集的局部结构角度的方法 | 第29-34页 |
| ·最近邻法 | 第30-31页 |
| ·局部最小二乘法 | 第31-32页 |
| ·改进算法 | 第32-34页 |
| ·基于生物知识角度的方法 | 第34-36页 |
| ·本章小结 | 第36-37页 |
| 第4章 缺失值估计算法结果 | 第37-54页 |
| ·数据集的选取及预处理 | 第37-38页 |
| ·缺失模型及预处理 | 第38-39页 |
| ·评价指标 | 第39页 |
| ·缺失值估计算法性能比较 | 第39-52页 |
| ·算法的参数选择 | 第39-42页 |
| ·乙酰化模式 | 第42-43页 |
| ·针对完整数据集的归一化均方根误差比较 | 第43-44页 |
| ·针对完整数据集的类结构保持度比较 | 第44-46页 |
| ·针对过滤后的基因数据集的归一化均方根误差比较 | 第46-47页 |
| ·针对过滤后的基因数据集的类结构保持度比较 | 第47-48页 |
| ·层次聚类结果 | 第48-50页 |
| ·运行时间比较 | 第50-52页 |
| ·本章小结 | 第52-54页 |
| 结论 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-60页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果 | 第60-62页 |
| 致谢 | 第62页 |
