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DNA序列拼接中deBruijn图结构的研究

摘要第1-5页
Abstract第5-8页
第1章 绪论第8-12页
   ·课题背景第8页
   ·国内外研究现状第8-10页
   ·本文的主要研究内容及意义第10-12页
第2章 基因组测序技术与序列拼接技术第12-22页
   ·引言第12页
   ·DNA 测序技术第12-18页
     ·第一代测序技术第12-13页
     ·第二代测序技术第13-17页
     ·第三代测序技术第17页
     ·三代测序技术比较第17-18页
   ·序列拼接技术第18-21页
     ·贪心算法第18页
     ·Hamilton 路径算法第18-19页
     ·Euler 路径算法第19-20页
     ·拼接算法比较第20-21页
   ·本章小结第21-22页
第3章 错位数与DE BRUIJN 图结构的关联性第22-33页
   ·引言第22页
   ·DE BRUIJN 图中的分支结构第22-24页
   ·错位数改变对DE BRUIJN 图中分支结构的影响第24-31页
   ·错位数改变对拼接算法的时间和空间复杂性的影响第31-32页
     ·错位数改变对拼接算法空间复杂性的影响第31页
     ·错位数改变对拼接算法时间复杂性的影响第31-32页
   ·本章小结第32-33页
第4章 错位数对DE BRUIJN 图中REPEAT 结构的影响第33-39页
   ·引言第33页
   ·错位数对DE BRUIJN 图中的REPEAT 数目影响的直观分析第33页
   ·建立数学模型第33-38页
     ·确定de Bruijn 图中的顶点的数目第34-35页
     ·确定de Bruijn 图中以分岔点为起点的有向边的数目第35-38页
   ·本章小结第38-39页
第5章 错位数与DE BRUIJN 图结构关联性信息查询系统第39-49页
   ·引言第39页
   ·错位数与DE BRUIJN 图结构关联性信息查询系统第39-44页
     ·系统意义与原理第39页
     ·Servlet 与JSP 技术第39-41页
     ·系统体系结构第41-42页
     ·系统核心算法第42-44页
   ·系统运行所需的配置及系统使用方法第44页
   ·系统功能测试第44-48页
   ·本章小结第48-49页
结论第49-50页
参考文献第50-54页
致谢第54页

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