| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 本论文的创新点 | 第10-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-34页 |
| ·引言 | 第14-15页 |
| ·蛋白质溶液结构的NMR研究 | 第15-21页 |
| ·应用多维NMR和同位素标记技术的NMR信号指认 | 第15-16页 |
| ·NMR数据与计算模拟相结合的蛋白质结构分析 | 第16-20页 |
| ·NMR研究蛋白质动力学的独特优势 | 第20-21页 |
| ·计算机辅助药物设计在新药研发中的应用进展 | 第21-24页 |
| ·Rnd1的功能及其与PlexinB1的作用文献综述 | 第24-30页 |
| ·Ras GTPases超家族和Rho GTPases亚家族 | 第24-27页 |
| ·Rnd1蛋白的特性与功能 | 第27-29页 |
| ·Rnd1与plexinB1的相互作用 | 第29-30页 |
| ·论文设计思想和研究内容 | 第30-34页 |
| ·课题的提出 | 第30-33页 |
| ·课题思路和研究内容 | 第33-34页 |
| 第二章 Rnd1在溶液中的稳定性和溶解度优化 | 第34-52页 |
| ·引言 | 第34-35页 |
| ·材料与方法 | 第35-38页 |
| ·His_6-Rnd1蛋白的表达和纯化 | 第35页 |
| ·His_6-Rnd组氨酸标签切除 | 第35-36页 |
| ·PlexinB1 RBD蛋白表达和纯化 | 第36页 |
| ·Rnd1定点突变 | 第36-37页 |
| ·NMR样品准备和NMR实验 | 第37页 |
| ·等温滴定微量量热(ITC)实验 | 第37页 |
| ·质谱分析 | 第37-38页 |
| ·结果与讨论 | 第38-50页 |
| ·His-Rnd1的表达、纯化和NMR谱图分析 | 第38-40页 |
| ·缓冲溶液的优化 | 第40页 |
| ·组氨酸标签的切除和GMPPNP的作用 | 第40-42页 |
| ·Rnd1定点突变和初步的NMR分析 | 第42-44页 |
| ·Rnd1 W66L突变体与plexinB1 RBD的结合能力 | 第44-46页 |
| ·Rnd1氘代标记及对~(13)C相关谱的影响 | 第46-50页 |
| ·结论 | 第50-52页 |
| 第三章 Rnd1的NMR信号归属和溶液结构分析 | 第52-70页 |
| ·引言 | 第52-54页 |
| ·材料与方法 | 第54-56页 |
| ·Rnd1蛋白质样品制备 | 第54页 |
| ·Rnd1特定氨基酸选择性标记 | 第54-55页 |
| ·NMR样品准备和NMR实验 | 第55-56页 |
| ·结果与讨论 | 第56-68页 |
| ·Rnd1的多维谱图分析 | 第56-60页 |
| ·Rnd1的NMR归属 | 第60-61页 |
| ·氨基酸选择性~(15)N标记的Rnd1谱图分析 | 第61-67页 |
| ·Rnd1 NMR结构分析 | 第67-68页 |
| ·结论 | 第68-70页 |
| 第四章 Rnd1与PlexinB1结合过程中的构象和动力学研究以及基于结构和相互作用的初步药物设计 | 第70-90页 |
| ·引言 | 第70-71页 |
| ·材料与方法 | 第71-74页 |
| ·Rnd1蛋白表达和纯化 | 第71页 |
| ·Rac1蛋白表达和纯化 | 第71-72页 |
| ·Rac1-GMPPNP的制备 | 第72页 |
| ·PlexinB1 RBD蛋白表达和纯化 | 第72-73页 |
| ·NMR实验 | 第73页 |
| ·ITC实验 | 第73-74页 |
| ·结果与讨论 | 第74-88页 |
| ·Rnd1与plexinB1 RBD作用中的关键氨基酸以及构象变化分析 | 第74-77页 |
| ·Rnd1与plexinB1 RBD作用的NMR分析与X-Ray结果的比较 | 第77-79页 |
| ·Rnd1和Racl与plexinB1 RBD相互作用过程的比较 | 第79-80页 |
| ·Rnd1与plexinB1 RBD作用过程中的动力学变化初步分析 | 第80-82页 |
| ·Rac1抑制剂EHT1864、NSC23766对Rnd1和Rnd1与plexinB1结合的影响 | 第82-86页 |
| ·基于Rnd1结构以及Rnd1-plexinB1 RBD相互作用的计算机辅助药物设计 | 第86-88页 |
| ·结论 | 第88-90页 |
| 论文总结和展望 | 第90-92页 |
| 附表A-1：Rad1的主链~1H和~(15)N、~(13)C的化学位移值 | 第92-99页 |
| 参考文献 | 第99-113页 |
| 在校期间发表的论文、科研成果等 | 第113-114页 |
| 致谢 | 第114页 |
