中文摘要 | 第1-15页 |
ABSTRACT | 第15-19页 |
第一章 文献综述 | 第19-46页 |
1. 引言 | 第19-20页 |
2. 第一类肽链释放因子的结构与功能 | 第20-28页 |
·第一类肽链释放因子的结构 | 第20-22页 |
·第一类肽链释放因子的tRNA-mimicry模型 | 第20页 |
·第一类肽链释放因子的晶体结构 | 第20-22页 |
·第一类肽链释放因子的功能 | 第22-28页 |
·第一类肽链释放因子是如何解码的? | 第22-24页 |
·第一类肽链释放因子是如何释放新生肽链的? | 第24-26页 |
·第一类肽链释放因子与其它蛋白质因子的相互作用 | 第26-27页 |
·第一类肽链释放因子结构域间的相互作用及信号的传导 | 第27-28页 |
3. 研究材料—纤毛虫 | 第28-30页 |
4. 研究方法 | 第30-34页 |
·蛋白质荧光光谱 | 第30-32页 |
·荧光淬灭的机理 | 第30-31页 |
·荧光淬灭的应用 | 第31-32页 |
·基于同源建模的计算机模拟 | 第32-34页 |
·同源建模 | 第32-33页 |
·分子动力学优化 | 第33-34页 |
·分子对接 | 第34页 |
5. 研究目的和意义 | 第34-36页 |
参考文献 | 第36-46页 |
第二章 游仆虫第一类肽链释放因子eRF1 N、C结构域的构建、表达和纯化 | 第46-63页 |
1. 引言 | 第46-47页 |
2. 材料与方法 | 第47-54页 |
·实验材料 | 第47-49页 |
·主要实验设备 | 第47页 |
·菌株和质粒 | 第47页 |
·寡聚核苷酸 | 第47-49页 |
·主要酶及生化试剂 | 第49页 |
·实验方法 | 第49-54页 |
·Eo-eRF1b阅读框内无义密码子的突变 | 第49-50页 |
·重组表达质粒的构建 | 第50-52页 |
·结构域蛋白的表达与纯化 | 第52页 |
·目的蛋白的Western blotting分析 | 第52-53页 |
·两类肽链释放因子体外相互作用的pull down分析 | 第53-54页 |
3. 实验结果 | 第54-59页 |
·Eo-eRF1b阅读框内无义密码子的突变 | 第54-55页 |
·重组表达质粒的构建 | 第55页 |
·重组蛋白的表达与纯化 | 第55-58页 |
·体外相互作用的pull down分析 | 第58-59页 |
·小结 | 第59页 |
4. 讨论 | 第59-61页 |
参考文献 | 第61-63页 |
第三章 游仆虫第一类肽链释放因子eRF1的荧光光谱分析 | 第63-87页 |
1. 引言 | 第63页 |
2. 材料与方法 | 第63-66页 |
·实验材料 | 第63页 |
·主要实验设备 | 第63页 |
·主要化学试剂及配制 | 第63页 |
·实验原理与方法 | 第63-66页 |
3. 实验结果 | 第66-82页 |
·游仆虫第一类肽链释放因子eRF1的荧光光谱分析 | 第66-73页 |
·发射波长的确定 | 第66-68页 |
·内源荧光强度的线形化 | 第68-69页 |
·溶液体系对荧光的影响 | 第69-71页 |
·蛋白质相互作用对纤毛虫第一类肽链释放因子eRF1荧光光谱的影响 | 第71-72页 |
·Bj-eRFl的N结构域聚合对荧光光谱的影响 | 第72-73页 |
·游仆虫第一类肽链释放因子eRF1的淬灭荧光光谱分析 | 第73-82页 |
·单重荧光淬灭 | 第73-79页 |
·双重荧光淬灭 | 第79-82页 |
4. 讨论 | 第82-85页 |
参考文献 | 第85-87页 |
第四章 游仆虫第一类肽链释放因子C结构域分析 | 第87-105页 |
1. 引言 | 第87-88页 |
2. 材料与方法 | 第88-89页 |
·实验材料 | 第88页 |
·主要实验设备 | 第88页 |
·菌株和质粒 | 第88页 |
·寡聚核苷酸 | 第88页 |
·主要酶及生化试剂 | 第88页 |
·实验方法 | 第88-89页 |
·eRF1C结构域的定点突变 | 第88页 |
·蛋白质同源建模 | 第88-89页 |
·3D模拟结构的优化策略 | 第89页 |
·共振光散射 | 第89页 |
3. 结果与讨论 | 第89-99页 |
·计算机模拟 | 第89-96页 |
·突变体的体外相互作用 | 第96-98页 |
·共振光散射 | 第98-99页 |
4. 讨论 | 第99-103页 |
参考文献 | 第103-105页 |
第五章 游仆虫第一类肽链释放因子eRF1 N结构域结构与功能的计算机模拟 | 第105-119页 |
1. 引言 | 第105-106页 |
2. 材料与方法 | 第106-107页 |
·蛋白质同源建模 | 第106页 |
·3D模拟结构的优化策略 | 第106页 |
·数据分析 | 第106-107页 |
3. 结果与讨论 | 第107-117页 |
·总能量 | 第107-109页 |
·氢键 | 第109页 |
·静电作用能 | 第109-111页 |
·均方差分析 | 第111-117页 |
参考文献 | 第117-119页 |
总结 | 第119-121页 |
附录Ⅰ | 第121-122页 |
附录Ⅱ | 第122-124页 |
附录Ⅲ | 第124-125页 |
附录Ⅳ | 第125-126页 |
攻读学位期间取得的研究成果 | 第126-127页 |
攻读学位期间参与的科研项目 | 第127-128页 |
致谢 | 第128-130页 |