| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-15页 |
| 1. Molecular Phylogeography in Marine fishes | 第15-30页 |
| ·Definition and content of phylogeography | 第15页 |
| ·Development of phylogeography | 第15-17页 |
| ·The patterns of phylogeography in marine species | 第17-20页 |
| ·Factors influence the pattern of phylogeogrpahy in marine fishes | 第20-23页 |
| ·Extrinsic limits to dispersal | 第21-22页 |
| ·Life history | 第22-23页 |
| ·Major DNA markers in phylogeography | 第23-26页 |
| ·mtDNA | 第23-24页 |
| ·RFLP | 第24-25页 |
| ·AFLP | 第25页 |
| ·SSR | 第25-26页 |
| ·Molecular phylogeography study in Northwestern Pacific | 第26-29页 |
| ·Environmental background | 第26-27页 |
| ·Genetic findings | 第27-29页 |
| ·Objective of this study | 第29-30页 |
| 2. The phylogeographic pattern of Pennahia argentata revealed by mtDNA, AFLP and isozyme | 第30-70页 |
| ·Deep phylogeographic break among Pennahia argentata (Sciaenidae, Perciformes) populations in the Northwestern Pacific | 第30-48页 |
| ·Introduction | 第30-32页 |
| ·Materials and methods | 第32-37页 |
| ·Sample collection | 第32-34页 |
| ·DNA extraction, amplification, and sequencing | 第34-35页 |
| ·Data analysis | 第35-37页 |
| ·Results | 第37-44页 |
| ·Discussion | 第44-48页 |
| ·Phylogeographic patterns | 第44-45页 |
| ·Population genetic structure and historical demography | 第45-48页 |
| ·Analysis of genetic structure of white croaker using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers | 第48-60页 |
| ·Introduction | 第48-50页 |
| ·Materials and methods | 第50-53页 |
| ·Sample collection | 第50页 |
| ·AFLP analysis | 第50-51页 |
| ·Data analysis | 第51-53页 |
| ·Results | 第53-57页 |
| ·Discussion | 第57-60页 |
| ·Genetic variation among white croaker populations inferred from isozyme | 第60-70页 |
| ·Introduction | 第60-61页 |
| ·Materials and Methods | 第61-64页 |
| ·Results | 第64-67页 |
| ·Discussion | 第67-70页 |
| 3. Molecular phylogeography study of Nibea albiflora based on mtDNA and AFLP markers | 第70-93页 |
| ·Genetic population structure of Nibea albiflora in the Yellow and East China seas based on mtDNA | 第70-85页 |
| ·Introduction | 第70-73页 |
| ·Materials and methods | 第73-77页 |
| ·Sample collection | 第73-74页 |
| ·DNA extraction and PCR | 第74-75页 |
| ·Data analysis | 第75-77页 |
| ·Results | 第77-81页 |
| ·Genetic diversity | 第77-79页 |
| ·Phylogenetic analysis and population genetic structure | 第79-80页 |
| ·Pattern of historical demography | 第80-81页 |
| ·Discussion | 第81-85页 |
| ·Analysis of genetic diversity of Nibea albiflora by AFLP technology | 第85-93页 |
| ·Introduction | 第85页 |
| ·Materials and methods | 第85-87页 |
| ·Sample | 第85页 |
| ·DNA extraction | 第85-86页 |
| ·AFLP reactions | 第86页 |
| ·Gel electrophoresis and silver staining | 第86-87页 |
| ·Data analysis | 第87页 |
| ·Results | 第87-91页 |
| ·Discussion | 第91-93页 |
| 4. Phylogeography study of Japanese sand lance Ammodytes personatus in Northwestern Pacific: Pleistocene isolation and local adaptation | 第93-135页 |
| ·Phylogeographic pattern of Japanese sand lance Ammodytes personatus in Northwestern Pacific revealed by mtDNA sequence | 第93-118页 |
| ·Introduction | 第93-98页 |
| ·Materials and methods | 第98-101页 |
| ·Sampling and sequencing | 第98-99页 |
| ·Data analysis | 第99-101页 |
| ·Results | 第101-113页 |
| ·Discussion | 第113-117页 |
| ·Conclusion | 第117-118页 |
| ·Applications of AFLP technology in phylogenetic analysis of Japanese sand lance Ammodytes personatus | 第118-135页 |
| ·Introduction | 第118-119页 |
| ·Materials and methods | 第119-124页 |
| ·Sample collection | 第119-120页 |
| ·AFLP analysis | 第120-121页 |
| ·Data analysis | 第121-124页 |
| ·Results | 第124-130页 |
| ·Discussion | 第130-133页 |
| ·Conclusion | 第133-135页 |
| 5. Conclusion | 第135-137页 |
| References | 第137-152页 |
| 致谢 | 第152-154页 |
| 在学期间发表的论文 | 第154-156页 |
