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HMM及其在生物信息学中的应用

摘要第1-4页
ABSTRACT第4-8页
第一章 绪论第8-14页
   ·隐马氏模型的研究现状与发展趋势第8-10页
   ·生物信息学的基本知识第10-13页
     ·生物信息学的发展背景与简介第10-11页
     ·生物信息学的主要研究内容第11-13页
   ·本文的主要内容第13-14页
第二章 隐马尔可夫模型基本理论及其算法第14-35页
   ·引言第14页
   ·HMM基本原理第14-19页
     ·马尔可夫链第14-15页
     ·HMM模型第15-19页
   ·HMM基本算法第19-33页
     ·HMM的三个基本问题第19-20页
     ·HMM的算法第20-33页
   ·HMM的基本类型第33-35页
第三章 隐马尔可夫模型在生物信息学中的应用第35-47页
   ·引言第35页
   ·隐马氏模型在生物序列比对中的应用第35-41页
     ·生物序列比对的意义及概念第35-38页
     ·生物序列多重比对的隐马尔可夫模型第38-40页
     ·生物序列观察概率的计算:前向-后向算法第40-41页
     ·生物序列多重比对的隐马氏模型的参数估计第41页
   ·CPG岛位置判别第41-44页
     ·引言第41-42页
     ·用马尔科夫链识别CPG岛第42页
     ·用HMM检测CPG岛第42-44页
   ·基因识别第44-47页
第四章 隐马氏模型学习算法的进一步改进第47-55页
   ·对经典隐马尔可夫模型前向-后向算法的改进第47-50页
     ·问题的描述第47-48页
     ·改进的前向-后向算法第48-50页
   ·引入驻留时间的隐马氏模型第50-55页
第五章 总结与展望第55-56页
参考文献第56-61页
致谢第61-62页
攻读硕士学位期间主要成果第62页

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