HMM及其在生物信息学中的应用
摘要 | 第1-4页 |
ABSTRACT | 第4-8页 |
第一章 绪论 | 第8-14页 |
·隐马氏模型的研究现状与发展趋势 | 第8-10页 |
·生物信息学的基本知识 | 第10-13页 |
·生物信息学的发展背景与简介 | 第10-11页 |
·生物信息学的主要研究内容 | 第11-13页 |
·本文的主要内容 | 第13-14页 |
第二章 隐马尔可夫模型基本理论及其算法 | 第14-35页 |
·引言 | 第14页 |
·HMM基本原理 | 第14-19页 |
·马尔可夫链 | 第14-15页 |
·HMM模型 | 第15-19页 |
·HMM基本算法 | 第19-33页 |
·HMM的三个基本问题 | 第19-20页 |
·HMM的算法 | 第20-33页 |
·HMM的基本类型 | 第33-35页 |
第三章 隐马尔可夫模型在生物信息学中的应用 | 第35-47页 |
·引言 | 第35页 |
·隐马氏模型在生物序列比对中的应用 | 第35-41页 |
·生物序列比对的意义及概念 | 第35-38页 |
·生物序列多重比对的隐马尔可夫模型 | 第38-40页 |
·生物序列观察概率的计算:前向-后向算法 | 第40-41页 |
·生物序列多重比对的隐马氏模型的参数估计 | 第41页 |
·CPG岛位置判别 | 第41-44页 |
·引言 | 第41-42页 |
·用马尔科夫链识别CPG岛 | 第42页 |
·用HMM检测CPG岛 | 第42-44页 |
·基因识别 | 第44-47页 |
第四章 隐马氏模型学习算法的进一步改进 | 第47-55页 |
·对经典隐马尔可夫模型前向-后向算法的改进 | 第47-50页 |
·问题的描述 | 第47-48页 |
·改进的前向-后向算法 | 第48-50页 |
·引入驻留时间的隐马氏模型 | 第50-55页 |
第五章 总结与展望 | 第55-56页 |
参考文献 | 第56-61页 |
致谢 | 第61-62页 |
攻读硕士学位期间主要成果 | 第62页 |