| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 主要缩略词表 | 第12-13页 |
| 第1章 文献综述 | 第13-28页 |
| 1.1 水稻粒形的经典遗传、QTL定位和克隆 | 第13-22页 |
| 1.1.1 水稻粒形的经典遗传研究 | 第13-15页 |
| 1.1.1.1 粒形各性状的遗传特性 | 第14页 |
| 1.1.1.2 粒形各性状间的相关关系 | 第14-15页 |
| 1.1.2 水稻粒形性状QTL的定位及与环境的互作 | 第15-17页 |
| 1.1.2.1 水稻粒形QTL定位群体的主要类型 | 第15页 |
| 1.1.2.2 水稻粒形QTL的定位 | 第15-16页 |
| 1.1.2.3 水稻粒形QTL的一因多效 | 第16-17页 |
| 1.1.2.4 水稻粒形QTL的上位性作用以及与环境的互作 | 第17页 |
| 1.1.3 水稻粒形性状QTL的克隆及分子机理 | 第17-21页 |
| 1.1.4 水稻粒形基因的利用及展望 | 第21-22页 |
| 1.2 水稻穗粒数和穗型基因的克隆及其分子机理 | 第22-24页 |
| 1.3 生长调控因子蛋白家族及microRNA396的研究概况 | 第24-27页 |
| 1.3.1 生长调控因子的定义及功能 | 第24页 |
| 1.3.2 水稻和玉米GRF基因家族 | 第24-26页 |
| 1.3.3 拟南芥GRF基因家族 | 第26页 |
| 1.3.4 microRNA396对靶基因的调控及其功能 | 第26-27页 |
| 1.4 研究目的和意义 | 第27-28页 |
| 第2章 水稻穗部性状调控基因OsGRF4的克隆 | 第28-63页 |
| 2.1 材料与方法 | 第29-40页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第29页 |
| 2.1.2 NIL-OsGRF4与NIL-Osgrf4的种植及穗部性状表型调查 | 第29页 |
| 2.1.3 水稻DNA的提取以及质量检测 | 第29-30页 |
| 2.1.4 PCR和非变性聚丙烯酰胺电泳(Polyacrylamidegelelectrophoresis,PAGE) | 第30-31页 |
| 2.1.5 琼脂糖电泳 | 第31-32页 |
| 2.1.6 InDel标记开发、定位群体构建、OsGRF4基因的精细定位 | 第32-33页 |
| 2.1.7 超表达和RNA干涉载体构建及其遗传转化 | 第33-34页 |
| 2.1.8 OsGRF4基因全长cDNA序列和启动子序列分析 | 第34-35页 |
| 2.1.9 水稻总RNA的提取 | 第35页 |
| 2.1.10 反转录PCR | 第35-36页 |
| 2.1.11 荧光定量PCR | 第36-37页 |
| 2.1.12 构建融合表达载体验证OsGRF4基因的功能位点 | 第37页 |
| 2.1.13 亚细胞定位载体构建及水稻原生质体转化 | 第37-39页 |
| 2.1.14 离层切片的制作及观察 | 第39页 |
| 2.1.15 颖壳细胞大小和细胞数目观察 | 第39页 |
| 2.1.16 植物激素含量的测定 | 第39页 |
| 2.1.17 OsGRF4 基因功能标记的开发与验证 | 第39-40页 |
| 2.2 结果与分析 | 第40-60页 |
| 2.2.1 OsGRF4基因对表型的影响 | 第40-41页 |
| 2.2.2 NIL-OsGRF4与NIL-Osgrf4籽粒灌浆速度的比较 | 第41-42页 |
| 2.2.3 OsGRF4基因的精细定位与候选基因的预测 | 第42-44页 |
| 2.2.4 LOC_Os02g47280的转基因互补试验 | 第44-47页 |
| 2.2.5 OsGRF4基因的表达模式分析 | 第47-49页 |
| 2.2.6 亲本OsGRF4的基因结构比较分析 | 第49-51页 |
| 2.2.7 OsGRF4基因序列在不同水稻材料中的变异 | 第51-53页 |
| 2.2.8 构建融合表达载体验证OsGRF4基因的功能位点 | 第53-54页 |
| 2.2.9 OsGRF4蛋白的亚细胞定位 | 第54-55页 |
| 2.2.10 OsGRF4基因通过改变离层结构影响籽粒的落粒性 | 第55页 |
| 2.2.11 OsGRF4基因主要通过增加细胞长度来影响籽粒大小 | 第55-56页 |
| 2.2.12 OsGRF4基因可能通过改变激素含量而影响穗部性状表型 | 第56-57页 |
| 2.2.13 OsGRF4对细胞周期、细胞分裂素和穗部性状基因表达量的影响 | 第57-58页 |
| 2.2.14 OsGRF4 基因功能标记的开发及验证 | 第58-60页 |
| 2.3 讨论 | 第60-63页 |
| 第3章 转录组测序挖掘OsGRF4的调控基因 | 第63-74页 |
| 3.1 材料与方法 | 第63-64页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第63页 |
| 3.1.2 建库测序流程和生物信息分析流程 | 第63-64页 |
| 3.1.3 DEGs与报道的穗部性状QTL在染色体上的共定位 | 第64页 |
| 3.1.4 RT-qPCR验证DEGs的表达 | 第64页 |
| 3.2 结果与分析 | 第64-71页 |
| 3.2.1 NIL-OsGRF4和NIL-Osgrf4的转录组测序质量较高 | 第64-66页 |
| 3.2.2 鉴定NIL-OsGRF4和NIL-Osgrf4之间的差异表达基因 | 第66-67页 |
| 3.2.3 差异表达基因GO富集分析 | 第67-69页 |
| 3.2.4 差异表达基因KEGG通路分析 | 第69页 |
| 3.2.5 DEGs与报道的穗部性状QTL在染色体上的共定位 | 第69-70页 |
| 3.2.6 通过RT-qPCR验证DEGs的表达 | 第70-71页 |
| 3.3 讨论 | 第71-74页 |
| 第4章 OSGRF4基因在水稻高产育种中的应用 | 第74-83页 |
| 4.1 材料与方法 | 第74-75页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第74页 |
| 4.1.2 各组合品比试验设计 | 第74-75页 |
| 4.2 结果与分析 | 第75-82页 |
| 4.2.1 海南大区品比组合的产量性状表现 | 第75-76页 |
| 4.2.2 海南大区品比组合的生育期及产量表现 | 第76-77页 |
| 4.2.3 2015年中稻多点品比迟熟组合的产量性状表现 | 第77-79页 |
| 4.2.4 2015年中稻多点品比迟熟组合生育期及产量表现 | 第79-82页 |
| 4.3 讨论 | 第82-83页 |
| 第5章 全文总结与研究展望 | 第83-85页 |
| 5.1 本研究主要结论 | 第83-84页 |
| 5.2 本研究主要特色与创新点 | 第84页 |
| 5.3 研究展望 | 第84-85页 |
| 参考文献 | 第85-99页 |
| 附录1 用于定量PCR的引物 | 第99-100页 |
| 附录2 转录组测序鉴定的80个差异表达基因 | 第100-103页 |
| 致谢 | 第103-104页 |
| 作者简介 | 第104-105页 |
